德国医学信息学研究现状.docx

1、德国医学信息学研究现状德国医学信息学研究现状中国医学科学院医学信息研究所 北京 100005专 业：情报学 导 师：许培扬 研究生：栗文靖【摘要】医学信息学自产生以来，其内涵在不断的发展完善，在不同的国家和地区医学信息学具有不同的研究方向和侧重点。本文通过网络调研和文献调研结合GoPubMed分析工具，初步总结并分析了德国的医学信息学研究现状，以期为我国医学信息学事业的发展产生交流和借鉴的作用。【关键词】德国；医学信息学The Research of Medical Informatics in GermanyInstitute of Chinese Academy of Medical Sc

2、iences, Beijing, 100005Major: Information Science Mentor: Xu, Peiyang Student: Li, WenjingAbstract The concept of medical informatics has been developing since its inception. Its focus varies a lot in different countries or districts. In this paper, the current situation of medical informatics resea

3、rch in Germany was summarized and analyzed, through investigation via literature and internet, as well as GoPubMed. It was expected to be instructive to the developing of medical informatics in China.Keywords Germany; Medical informatics1 前言医学信息学作为一门交叉应用科学，随着发展其内涵和研究领域在不断的丰富。该学科于上世纪五十年代伴随微芯片和计算机的增长在

4、美国产生，其早期的名字包括：医学计算学、医学计算机科学、计算机医学、医学电子数据处理、医学数据自动化处理、医学信息处理、医学信息科学、医学软件工程和医学计算机技术等。从上世纪八十年代开始，这些初始的学科都等同加入国际医学信息学协会（IMIA）。目前医学信息学涉及的子领域包括：临床信息学、护理信息学、医学图形信息学、消费者健康信息学、公共卫生信息学、口腔医学信息学、临床研究信息学、生物信息学等。医学信息学在各国的发展过程各有特点，在不同的国家和地区，发展水平也存在着较大的差异。对德国医学信息学研究发展现状进行分析和总结，对于我国医学信息学事业的发展具有交流和借鉴的意义。2 德国的医学信息学内涵国

5、际医学信息学会（IMIA）的官方国家成员德国的医学信息学、生物测量和流行病学协会（Deutsche Gesellschaft fr Medizinische Informatik，Biometrie und Epidemiologie e.V.，GMDS）提出医学信息学（德语：Medizinische Informatik，MI）内涵为：医学信息学或称卫生信息学，是计算机信息科学技术在医学研究领域的应用，使得关于疾病的诊断与治疗的医学知识系统得到科学的表达与处理。高质量的医疗信息服务不能缺少系统的信息收集、加工与提炼过程。因此，医学信息学的方法与工具研究旨在为患者、医生以及其他的医护人员在合适

6、的时间、合适的地点以合适的形式提供正确的信息。13 国家协会、权威机构和地方学术机构不同国家和地区的组织机构和建设模式不同，这源于不同民族的文化构成和思维方式的差异，这一点在德国的医学信息学机构设置方面也有所体现。德国医学信息学国家级机构和地方级机构的功能和职责存在显著差异。3.1德国医学信息学、生物测量和流行病学协会该机构德文名称是Deutsche Gesellschaft fr Medizinische Informatik，Biometrie und Epidemiologie e.V.（GMDS）。该协会成立于1955年，地点在波恩（Bonn），是IMIA和欧洲医学信息学联盟（EFMI

7、）的官方国家成员。GMDS由4个部组成：医学信息学部、医学生物统计学部、流行病学部和医学文档管理部。以医学信息学为例，GMDS的宗旨是促进该学科的理论研究与应用研究。自1956年始，GMDS定期举办一年一度的由900-1,500人参与的国际会议来促进相关研究领域内的交流，该会议是相关领域内德语世界的重要论坛。GMDS每年出版年度报告，在其网站上可以免费获取1970至今的年度报告。GMDS也出版相关领域主题的战略指导和意见，例如，它已经出版了医学信息学和生物统计学教育的国家战略计划。GMDS还出版了一本国家级刊物Medizinische Informatik，Biometrie und Epid

8、emiologie（ISSN：1860-9171）。该刊物所刊载的文章被德国医学文献开放获取平台（German Medical Science，GMS）收录。23.2德国医学文档和信息研究所该机构德文名称是Deutsche Institut fr Medizinische Dokumentation und Information（DIMDI）。DIMDI建立于1969年，总部位于科隆（Cologne），是卫生部的附属机构。DIMDI是世界卫生组织（WHO）国际分类合作中心的成员单位，负责发布德国官方的医学分类（如：ICD-10、ICF、OPS）和维护对于医学领域电子数据交互来说非常重要的医学

9、术语、主题词和概念系统（如：MeSH、UMDNS、Alpha-ID、LOINC、OID），此外DIMDI还自建关于药物和医疗设备的数据库信息系统并负责卫生技术评估方案。在DIMDI网上提供了医学、药学、毒理学和心理学60余个数据库近1亿篇文献的在线自助检索，其中有一半的数据库检索是免费的。33.3 德国国家医学图书馆该机构德文名称是Deutsche Zentralbibliothek fr Medizin（ZB MED）。ZB MED建于1969年，目前是世界第二大图书馆，也是欧洲最大的图书馆，其在科隆（Cologne）和波恩（Bonn）两处均有分馆。2001年ZB MED与德国国家农业科学图

10、书馆进行合作，并从此拓展到医学以外的领域，现涉及医学、卫生保健学、营养学、环境科学和农业领域。ZB MED开展了各种研究项目致力于提高服务，有关医学专业的主要有：建立医学文献的快放获取平台GMS4；建立用户导向的、简易并快速获取医学数据库信息的平台MEDPILOT5；建立德语的医学术语库CC MED；建立MEZHMedInform以促进俄语的医学文献交流等。ZB MED是德国国家科技文献服务中心馆，馆藏超过150万册图书和期刊，文献传递和馆际互借是其主要的日常工作，仅2009年订单数就约为275,000。63.4 德国医学信息学专业学会该机构德文名称是Berufsverband Medizin

11、ischer Informatiker e.V.（BVMI）。该机构建立于1983年，位于海德堡（Heidelberg），目前会员数位为600余人。该学会的宗旨是处理医学信息学专业领域的政治问题，以保障领域内研究者的共同利益。63.5 地方学术机构与研究方向医学信息学的具体研究方向包括：人工智能、生物信息学、信息管理、电子病历、信息检索、决策支持系统、医学语言处理、远程医疗等，随着学科发展这些研究方向也在不断在变化。德国弗莱堡大学医学信息学部于1995年开展了一项名为“医学信息学网络社区”的工作7，这项工作中汇总了当时德国部分医学信息学相关学术机构。在此基础上，通过网络调研、浏览各机构网站、查

12、阅其年度研究报告来进一部归纳和整理，可以发现目前德国有大概50余处医学信息学相关学术机构，这些学术机构的研究方向和侧重点各不相同，往往包含一个或多个（表1）。表1 德国主要的医学信息学相关学术机构与研究方向城市学术机构MI相关的研究方向亚琛（Aachen）亚琛工业大学医学院：医学信息学部8CBT，CIM，IRV，SSL柏林（Berlin）柏林自由大学医学院：医学信息学部9AI，CBT，EDU， IR，IRV波鸿（Bochum）鲁尔大学：医学信息学，生物测量和流行病学部10EDU波恩（Bonn）波恩大学：医学信息学，生物测量和流行病学部11BIO，EDU，SIG不伦瑞克（Braunschweig

13、）不伦瑞克工业大学：医学信息学部12CIM，EDU科隆（Kln）MIBEG医学院：医学信息继续教育部13EDU科隆大学：医学统计，信息和流行病学部14IRV，SSL多特蒙德（Dortmund）多特蒙德高等专业学院：医学信息学部15EDU德累斯顿（Dresden）德累斯顿工业大学：医学信息和生物测量学部16CIM，MD，NI，PHI，SIG，TEL埃尔朗根（Erlangen）埃尔朗根-纽伦堡大学：医学信息，生物测量和流行病学部17CBT，CCT，CGL，CHI，CIM，DSS，EDU，EPR， IR，NI，TEL埃尔朗根-纽伦堡大学：计算机科学部18BCS，DSS，IRV，SIG埃森（Essen

14、）杜伊斯堡-埃森大学：医学信息，生物测量和流行病学部19BIO，CBT，CCT，CIM，EPR，OA，PHI弗莱堡（Freiburg）弗莱堡大学：生物测量与医学信息学部20AI，CBT，CCT，CIM，EDU，IR，MLP吉森（Gieen）吉森大学：医学信息学部21CIM，NI格丁根（Gttingen）格丁根大学：医学信息学部22EDU格赖夫斯瓦尔德（Greifswald）格赖夫斯瓦尔德大学：生物测量和医学信息学部23CBT，EDU，SIG哈雷（Halle）哈雷-维滕贝格大学：流行病学，医学信息和生物测量学部24EDU汉堡（Hamburg）汉堡大学医学院：医学信息学部25AI，EDU，IRV汉

15、诺威（Hannover）汉诺威医学院：医学信息学部26EDU海德堡（Heidelberg）海德堡大学：虚拟病人中心27CBT，EDU海德堡大学：医学信息学部28AI，CCT，CGL，CIM，DSS，EDU，EPR德国癌症研究中心：医学信息，生物信息学部29BIO，CCT，IRV海尔布隆（Heilbronn）海尔布隆学院：医学信息学部30EDU，EPR，IRV，SIG洪堡（Homburg）萨尔兰德大学医学院：生物测量，流行病学和医学信息学部31CBT，CIM，EPR，TEL伊尔默瑙（Ilmenau）伊尔默瑙工业大学：生物医学工程和医学信息学部32EDU耶拿（Jena）耶拿大学：医学统计，医学信息

16、和档案学部33BCS，EDU，MD，SIG基尔（Kiel）基尔大学：医学信息和医学统计学部34BIO，EDU莱比锡（Leipzig）莱比锡大学：医学信息，医学统计和流行病学部35CCT，CIM，EDU，EPR，SSL，TEL吕贝克（Lbeck）吕贝克大学：医学信息学部36CCT，CIM，DSS，EDU，EPR，IRV，SIG美因茨（Mainz）美因茨大学：医学生物统计，流行病学和医学信息学部37AI，BIO，CIM，EPR，PHI，SIG，SSL，TEL曼海姆（Mannheim）海德堡大学曼海姆医学院：医学统计，生物统计和数据处理部38EDU，SIG马尔堡（Marburg）马尔堡大学：医学信息

17、学部39CIM，EPR，OA，TEL慕尼黑（Mnchen）慕尼黑大学：医学信息处理，生物测量和流行病学部40EDU，PHI慕尼黑大学：医学计算机教育工作组41CBT，NI，OA，PHI，SIG，SSL，TEL慕尼黑工业大学：医学信息学，医学统计和流行病学部42BIO，CBT，CGL，CIM，DSS，EDU，EPR，IR，IRV，OA，SIG，SSL，TEL明斯特（Mnster）明斯特大学：医学信息和生物数学部43CBT，EDU纽伦堡（Nrnberg）亥姆霍兹慕尼黑研究中心：卫生经济学和卫生保健管理学部44PHI，SSL雷根斯堡（Regensburg）雷根斯堡大学医院：MedicDAT项目部45

18、TELeHealth能力中心46BIO，EDU，EPR，PHI，SSL，TEL罗斯托克（Rostock）罗斯托克大学医学院：生物统计，医学信息和老龄化学部47AI，BIO，DSS，EDU，PHI，TEL萨尔布吕肯（Saarbrcken）萨尔大学：形式本体和医学信息学部48AI，BCS，BIO，CCT，CGL，DSS，EPR，MLP， SSL乌尔姆（Ulm）乌尔姆大学：医疗档案学部49MD乌尔姆大学：生物测量学部50EDU，IR乌尔姆学院：医疗档案和信息教学部51MD，EDU研究方向缩写说明：AI：人工智能；BCS：生物医学认知科学；BIO：生物信息；CBT：基于计算机的培训；CCT：编码，分类

19、和术语；CGL：计算机化的临床指南；CHI：消费者健康信息；CIM：临床信息管理；DSS：决策支持系统；EDU：教育与培训；EPR电子病历；MD：医学文献；IR：信息检索；IRV：图像，机器人，虚拟医疗；MLP：医学语言处理；NI：护理信息；OA：成果评估；PHI：公共卫生信息；SIG：信号处理；SSL：标准，社会和法律问题；TEL：远程医疗。资料来源：根据有关资料整理而成。通过表1可以看出，德国目前医学信息学的研究方向也不是面面俱到的，例如德国目前还没有开展口腔医学信息的研究。在已有的研究方向中，除生物医学认知科学、医学语言处理等几个研究方向涉及较少以外，其他的已有的研究方向在德国地方学术机

20、构开展的都比较均衡，其中临床信息管理、电子病历、决策支持系统、虚拟医疗和远程医疗等这些隶属于电子卫生保健（eHealth）的重点研究方向是上述学术机构比较侧重的。这可能是由于近年来欧洲电子卫生保健行动计划European eHealth Action Plan在欧盟的欧洲信息社会2010（i2010）战略中起基础性作用的缘故。4 主要的医学信息学研究平台德国参与了欧盟很多医学信息学平台相关研究工作，由于欧盟组织的政治原因，很多平台都是以欧盟的名义存在的或者是德国与其他欧盟国家不分主次共同完成的。本文仅介绍以德国为主研发的重要医学信息学平台。4.1 决策支持系统：EFMI安理会成员门户和工作组动

21、态门户在世界卫生组织欧洲区的帮助下，欧洲医学信息学联盟于1979年9月在丹麦首府哥本哈根（Kbenhavn）创建，联盟代表来自于欧洲国家和地区性的学术机构和企业。联盟宣言：联盟是非盈利性的，致力于信息科技的理论和实践在健康领域的应用，以欧洲为主要区域。欧洲医学信息学联盟安理会成员门户（EFMI Council Members Portal）52则由德国亥姆霍兹慕尼黑研究中心（HMGU）来进行设计与维护，依托于该中心的医学信息系统（MEDIS），这可以看作是德国医学信息学在决策支持系统研究中优越性和成果的体现。EFMI工作组动态门户（EFMI WG PPD）53建设的目标是要成为欧洲的能量中心，

22、使工作组成员可以即时查看正在进行的各项活动并为决策者提供必要的信息支持。该动态门户也是由德国慕尼黑亥姆霍兹中心来进行设计与维护。4.2 电子卫生保健网络：eHealthNews.EU和eHealthDirectory.EUeHealthNews.EU54是欧洲领先的电子卫生保健新闻网络，其总部在德国慕尼黑。eHealthNews.EU旨在推动欧洲卫生保健事业，使最新的趋势、成就和技术得以推广。该网站统计的用户群为：医院和企业的IT人士（60%），研究者（30%），媒体和记者（10%）。eHealthDirectory.EU 55是欧洲第一个电子卫生保健目录，它是基于eHealthNews.EU

23、的设计理念进行开发的。该网站按照协会与社团、会议、教育、欧盟机构和服务、开放获取资源、政府机构、企业、新闻和媒体、研究、术语和分类这11项来组织电子卫生信息资源。4.3 生命科学搜索引擎：GoPubMedGoPubMed56是一个以知识为基础的生物医学文本搜索引擎。以基因本体（Gene Ontology，GO）和医学主题词（MeSH）作为“树形目录”来组织和结构化数以百万的MEDLINE数据。GoPubMed的搜索功能明显加快了生物医学研究人员和医生查找相关的研究结果的速度。GoPubMed是最早的web 2.0搜索引擎之一，系统中所使用的技术都是通用的，可以应用于任何形式的文本和知识载体。该

24、系统是由德国德累斯顿工业大学（Technische Universitaet Dresden）的Michael Schroeder教授及其在Transinsight公司的团队进行研发的。GoPubM这一生命科学搜索引擎获得了2009年度德国red dot 设计大奖：传媒设计领域（图形用户界面与交互工具）之至尊奖（best of the best award）。574.4 医学文献开放获取：GMS German Medical ScienceGMS German Medical Science58建设于2003年，是一个医学领域的在线期刊、会议论文摘要和网络文献、研究报告的开放获取门户，出版语言

25、是英语。它是德国医学科学社团联合会（AWMF）与德国DIMDI和ZB MED共同开发完成的，为医学领域的研究者提供了在线发表高质量研究成果的可能性。通过快速的同行评议过程以及采用高效的基于网络的手稿操作系统（MOPS），原始稿件从投稿、接收到发表仅需6-10周的时间。4.5 医学数据库信息平台：MEDPILOTMEDPILOT由ZB MED和DIMDI合作研发并于2003年发布，是一个高效的、用户导向的、跨库检索的医学专业信息获取门户。平台整合了2,500万篇医学文档，其目标用户群为医生、学生和研究者。ZB MED于2010年2月推出了MEDPILOT 3.0新版本。新版本与ZB MED的文献

26、订购与发送系统（DOD system）进行接口并增添了多语种的功能。5专业期刊和文献发表情况5.1 专业期刊截至到2009年8月科学引文索引（SCI）扩展版收录医学信息学学科期刊22种（SCI核心版12种），出版地为的美国医学信息学期刊10种，英国4种，德国3种（表2），爱尔兰2种，加拿大、荷兰、澳大利亚各1种。表2 2009年8月SCI收录的德国3种医学信息学专业期刊刊名全称刊名缩写ISSN（P）ISSN（O）IFBIOMEDIZINISCHE TECHNIK59BIOMED TECH0013-55851862-278X0.593MEDICAL & BIOLOGICAL ENGINEERIN

27、G & COMPUTING60MED DECIS MAKING0140-01181741-04442.196METHODS OF INFORMATION IN MEDICINE61METHOD INFORM MED0026-12701.451资料来源：2007版期刊引证报告（JCR）自然科学版和汤姆森科技信息集团网站附：汤姆森科技信息集团网站给出的医学信息学学科范畴（按照此范畴进行期刊分类）：Medical Informatics covers resources on health care information in clinical studies and medical resear

28、ch. This category includes resources on the evaluation, assessment, and use of health care technology, its consequences for patients, and its impact on society.5.1.1 BIOMEDIZINISCHE TECHNIK该刊中文译名为生物医学技术，创刊于1956年，目前是双月刊。该刊是生物医学工程、医学信息技术、生物技术研究领域高质量的知识交互论坛。该刊所有的文章均采用同行评议的方式。该刊正在向英语在线出版的方式转移。5.1.2 MEDI

29、CAL & BIOLOGICAL ENGINEERING & COMPUTING该刊中文译名为医学和生物工程与计算，创刊于1963年，目前是双月刊。该刊收录的文献在原生物医学工程领域的基础上进一步涵盖了生物医学和临床工程的所有范畴。该刊刊载原始研究文献，也发表综述和技术说明类的文献。该刊是国际医学和生物医学工程联盟（International Federation of Medical and Biological Engineering，IFMBE）的官方刊物。5.1.3 METHODS OF INFORMATION IN MEDICINE该刊中文译名为医学信息方法，创刊于1962年，目前为

30、季刊。该刊讨论医学数据处理的基本方法和科学基础，刊载医学信息和相关领域的原始论文、综述、报告、社论等。该刊是国际医学信息学会的官方杂志。5.2 文献发表与统计由于医学信息学内涵的丰富性，全面并科学地检索德国所发表的医学信息学文献有一定难度。本文按照德国学术机构所涉及到的主要研究方向作为检索主题的借鉴并结合MeSH进行分析来制定检索策略，在GoPubMed中对MEDLINE收录的文献进行检索，并利用其系统自带的分析功能进行初步统计，挑选部分统计结果，从文献的角度了解德国医学信息学发展的整体情况。5.2.1 检索策略 在PubMed的MeSH Database中进行检索可以发现，Medical I

31、nformatics是主题词（分别处于两个Tree当中），处于Information Science的下位的Medical InformaticsMedical Informatics Applications中还包括很多下位词。通过浏览确定Medical Informatics作为主题词进行扩展检索可以包含大部分的研究方向，其他的研究方向再重新选词并进行补充，最后的检索式为：(Medical InformaticsMesh or Artificial IntelligenceMesh or Consumer Health InformationMesh or Natural Language ProcessingMesh or Nursing Info