1、2、基因组是指某一种生物所具有的全部基因的总称。3、真核生物基因的大小通常是外显子的数目和长度决定的。4、在所有的真核生物中,内含子的长度和序列是高度保守的。5、酵母的基因普遍要比人的基因小,因此,酵母基因组编码的蛋白质普遍要比人基因组编码的蛋白质要小。6、在自由的四种核苷酸混合溶液中,任何碱基之间都可以形成氢键而发生配对。7、大幅度增加或减少溶液的pH都会导致一种双链DNA的Tm下降。8、富含GC的DNA双螺旋比富含AT的DNA双螺旋稳定的主要原因是GC碱基对比AT碱基对多一个氢键。9、超螺旋DNA的能量状态总是高于相同序列的松弛型DNA。10、用氯化铯梯度超离心纯化质粒DNA时,蛋白质在离
2、心管的最上部,RNA悬浮在中间,而DNA沉在底部。四、单项选择题(每题2分,共20分)1、有关蛋白质组不正确的叙述是( )A、翻译后加工可导致同一个翻译产物形成几种不同的蛋白质B、蛋白质之间的相互作用可形成组织特异性蛋白质复合物C、环境因素对一个细胞的蛋白质组无影响D、一个病态细胞的蛋白质组可能与一个健康细胞的蛋白质组有所不同2、DNA在细胞核内被包装成30 nm的染色质纤维。在试管里加入某种物质可以人为破坏这种结构(包括10 nm染色质纤维),你认为这种物质是( )A、NaCl B、辅酶 C、核糖核酸酶 D、ATP3、序列特异性DNA结合蛋白与DNA结合的主要作用力是( )A、离子键 B、氢
3、键 C、疏水作用 D、范德华力4、基因组中含有的转座子最多的生物是( )A、细菌 B、噬菌体 C、酵母 D、玉米5、导致DNA双螺旋具有大沟和小沟的原因是( )A、AT碱基对与GC碱基对的外形不同B、嘌呤碱基大,形成大沟,而嘧啶碱基小,形成小沟C、DNA结合蛋白将DNA扭曲成特定的形状D、两条链上的磷酸核糖骨架不是完全相对称的6、噬菌体基因组DNA上的碱基发生糖基化和甲基化修饰的主要功能是( )A、促进基因组DNA整合到宿主基因组上 B、保护病毒DNA受到限制性酶的水解C、有利于核酸正确的排列 D、稳定DNA,防止突变7、双螺旋DNA具有的典型特征包括( )A、沿着一条链是大沟,另外一条链是小
4、沟 B、碱基对的排列与螺旋轴平行C、嘌呤碱基和嘧啶碱基的数目相同 D、螺旋的方向总是右手8、在许多不同物种中,具有高度保守的序列一般是( )A、假基因 B、特定的间隔序列C、不重要的蛋白质的基因 D、非常重要的蛋白质的基因9、以下有关染色质的叙述不正确的是( )A、原核生物无染色质结构,真核生物才有染色质结构B、染色质由DNA、RNA、组蛋白和非组蛋白构成C、染色质的基本结构单位是核小体D、组蛋白是一种序列特异性DNA结合蛋白10、关于一种真核生物的基因组的最佳定义是( )A、这种生物所有的编码蛋白质的基因B、这种生物细胞核所有的DNAC、这种生物所有的遗传物质D、这种生物的单倍体细胞所具有的
5、所有染色体五、问答题(每题10分,共40分)1、如果有人在大肠杆菌细胞里发现一种新的蛋白质,它既含有跨膜的结构域,又含有与DNA结合的结构域,下面显示的是这种蛋白质的部分氨基酸序列:Ala-Leu-Phe-Ala-Gly-Ile-Val-Glu-Asn-Ser-Thr-Ala-Asp-Trp-His-Arg-Lys-His-Arg(1)你认为哪一段氨基酸序列最有可能发现在跨膜的结构域?为什么?(2)如果进一步的实验证明这种蛋白质并不是一种跨膜蛋白,而是位于细胞质。那么,你认为(1)中所指的氨基酸序列位于蛋白质三维结构的什么部分?(3)指出这种蛋白质分子中最有可能与DNA结合、发生相互作用的氨基
6、酸序列?(4)你认为这些氨基酸更可能与碱基还是磷酸核糖骨架相互作用?(5)何种次级键是蛋白质与DNA之间作用最强的化学键?2、大肠杆菌DNA的GC含量是0.532(摩尔分数)。(1)计算大肠杆菌DNA在0.05 mol/L NaCl溶液中的Tm。(2)你认为DNA退火温度是大于、等于还是小于Tm?(3)嗜热菌能够生存在高达100的环境,你认为这一类细菌可以使用哪些手段维持其DNA在高温下仍然处于双螺旋状态。(4)某些生物喜欢生活在热水之中!例如,某些细菌适宜生活在近乎沸腾的热泉中,如果将它们放在正常的温度下(37左右),反而不利于它们的生存。为什么37对于适宜生活在95下的生物体内的蛋白质的功
7、能是有害的?3、(1)有人在纯化质粒DNA的时候,由于某种原因将部分纯化的DNA在室温下放在水里面近一个月的时间。等他想到这件事的时候,他可以接着继续纯化还是需要从头来重新纯化?如果他纯化的是RNA,又该如何处理?(2)冰冻的乙醇经常被用来沉淀DNA。乙醇温度的重要性何在?它对短的DNA还是长的DNA更加重要?4、(1)“生命需要的必需基因的最低数目究竟有多少”一直是科学家感兴趣的问题。迄今为止,最小的生物的基因组来自寄生的支原体,其大小为5105 bp。试估计这种生物最多需要多少个编码蛋白质的基因。这些蛋白质基因的功能会是什么?如何能够更精确的确定所需要的必需基因的数目?(2)全基因组序列分
8、析已经导致像大肠杆菌这样的细菌几乎所有的蛋白质基因得以确定。然而,如果要用类似的方法想毫不含糊的确定大多数真核生物基因组编码蛋白质的基因,则非常困难。给出一个原因解释以上现象。习题二 DNA的复制、重组、损伤、修复以及突变1、Okazaki fragment2、semiconservative replication3、NER4、nonsense mutation5、suppressor mutation1、体内DNA复制一般以_为引物,复制的方向总是_,催化引物合成的酶称为_。而体外复制DNA通常用人工合成的_为引物。2、DNA甲基化修饰的甲基供体是_。原核细胞DNA上被修饰的碱基一般是_,
9、真核细胞的DNA被修饰的碱基通常位于_内的_。3、大肠杆菌染色体DNA复制的起始区称为_,酵母染色体DNA复制的起始区称为_,两者均富含_碱基对。4、大肠杆菌DNA连接酶使用_作为能源,病毒和真核细胞的DNA链接酶则使用_作为能源。用于基因工程的DNA连接酶一般来自_。5、参与大肠杆菌染色体DNA复制的主要聚合酶是_,该酶在复制体上组装成不对称的二聚体,分别负责前导链和后随链的合成。1、冈崎片段只由DNA组成。2、端粒酶带有自己的DNA模板。3、细胞内的DNA复制既需要DNA聚合酶,也需要RNA聚合酶。4、同源重组和位点特异性重组都形成Holliday中间体结构。5、如果HIV是一种DNA病毒
10、,那么治疗的难度将大大降低。6、转座重组既可以导致基因的失活,也可以导致基因的激活。7、癌症一般发生在人年迈的时候,其主要原因是随着年纪的增大,人体内的抑癌基因逐步失活。8、在一个基因的编码区内发生的核苷酸的插入或缺失总是导致移码突变。9、一个正在进行双向复制的真核细胞的DNA分子,当两个相邻的复制叉相遇的时候,一个复制叉的前导链总是跟另外一个复制叉的后随链相遇。10、DNA损伤的修复机制完全依赖于每一个DNA具有两个拷贝,每一个拷贝分别属于同源染色体中的一个。1、原核生物DNA复制不需要( )A、DNA聚合酶 B、DNA解链酶 C、DNA连接酶 D、端粒酶2、大肠杆菌染色体DNA复制所需要的
11、DNA聚合酶有( )A、DNA聚合酶 B、DNA聚合酶C、DNA聚合酶 D、DNA聚合酶和3、DNA连接酶需要被连接的两个DNA片段分别具有( )A、3-OH和5- B、5-OH和3-C、3-OH和5-OH D、5-和3-4、端粒酶是一种( )A、依赖于DNA的DNA聚合酶 B、依赖于DNA的RNA聚合酶C、依赖于RNA的DNA聚合酶 D、依赖于RNA的RNA聚合酶5、假定一个转座子插入到某一个基因的可读框内,并产生11 bp的靶点重复,当转座子离开以后,留下重复序列,那么,这最终将导致( )A、转换 B、颠换 C、移码突变 D、易位6、将两段寡脱氧核苷酸片段5-ACCACGTAACGGA-3
12、和5-GTTAC-3与DNA聚合酶一起加到含有dATP、dGTP、dCTP和dTTP的反应混合物之中,预测反应的终产物被参入的各碱基的比例是( )A、2C:1T B、1G:1T C、3G:2T D、3G:3T:2C7、如果一个具有放射性的DNA分子在没有放射性标记的dNTP溶液里进行两轮复制,那么得到的四个子代DNA分子的放射性分布是( )A、两股各有一半带有放射性 B、所有都含有放射性C、两个没有放射性 D、有一个DNA分子的两条链具有放射性8、细胞内的突变主要发生在( )A、DNA复制 B、DNA修复 C、转录 D、翻译9、碱基类似物导致DNA发生突变的主要原因是( )A、插入到碱基之间,
13、使DNA发生断裂 B、使C变成TC、能够与不同的碱基配对 D、促进DNA的脱嘌呤10、人类基因组比大肠杆菌基因组大700倍左右,然而,人类基因组复制的时间仅比大肠杆菌基因组复制长68倍。这是因为( )A、组蛋白的存在提高了人染色体DNA的复制速率B、人类基因组的GC含量低,两条链更容易解链C、人基因组的许多序列在复制中直接跳过去,因为只有35的序列编码蛋白质D、人染色体DNA上具有多个复制起始区,大肠杆菌只有一个1、(1)在使用双脱氧法测定DNA一级结构的时候,如果在反应系统中添加SSB,可以提高DNA的得率,为什么?现在测序使用的酶一般都是耐热的DNA聚合酶,使用这样的DNA聚合酶有什么好处
14、?(2)大肠杆菌细胞内的SSB的主要功能是什么?你如何确定它是不是DNA复制的一种必需成分?2、(1)有人将狗体内的己糖激酶与狼体内的己糖激酶的氨基酸序列进行了比对,结果发现两者完全相同。基于此,你能否认为这两种生物体内的己糖激酶基因从来没有突变过吗?(2)有人从使用羟胺诱发的突变中筛选到一种拷贝数极高的质粒,其在大肠杆菌内的拷贝数远高于野生型的质粒,究其原因是DNA复制频率提高了。经过序列分析发现,突变体的质粒在复制起始区周围的一个启动子序列发生了突变。试提出一种机制解释质粒拷贝数增加的现象,同时设计一个实验来证明你的解释。3、假定你一直在寻找一个具有更高进行性的DNA聚合酶,用于PCR研究
15、。你从几种不同来源的细菌培养物中分别得到了几种DNA聚合酶的粗品,现在要使用长达几千碱基的单链DNA作为模板,测定酶活性。(1)除了在测活系统中添加DNA模板和DNA聚合酶抽提物以外,还应该加入哪些成分?(2)如果你在粗抽提物中发现了一种具高进行性的DNA聚合酶,需要进一步纯化它。在用不同的引物一模板测定活性以后,你惊奇地发现,如果以短DNA引物/单链环状DNA模板测定活性,进行性不高。但是,如果你以线形的模板启动反应,然后迅速地环化模板,则发现延伸的进行性非常高。对此现象请给予合理的解释。如果你使用上面的环状模板、短的DNA引物测定活性,则发现在加入无DNA聚合酶的细胞粗抽提物以后,纯化好的
16、DNA聚合酶能像使用线形模板一样,很好地使用环状模板。对此你又如何解释?如何验证你的解释?(3)你本以为在测活系统中加入大肠杆菌的SSB可能会刺激DNA的合成,但结果不然。然而,如果你加的是T4噬菌体的SSB,则能刺激DNA的合成。另外,在有ATP的情况下加入RecA,结果也能刺激DNA的合成,但如果使用不能水解的ATP类似物代替ATP,则对DNA的合成无刺激。对此,试提出合理的解释。4、(1)DNA复制起始区一般具有哪些特征?(2)细菌染色体只有一个复制起始区,而真核细胞染色体具有多个复制起始区,为什么?(3)使用何种方法可以得到一个染色体DNA上的复制起始区序列?习题三 DNA转录、逆转录
17、及其转录后加工1、Pribnow box2、cis-acting element3、enhancer4、core promoter5、mRNA editing1、一个基因的有意义链是指_,它的序列与mRNA_。2、大肠杆菌的RNA聚合酶由_和_因子组成,参与转录起始的是_,而参与延伸的是_。3、真核细胞核mRNA前体后加工最重要的三种方式是_、_和_。4、snRNA即是_,它的主要功能是参与_;snoRNA即是_,它的主要功能是参与_后加工。5、使用_方法可以确定原核细胞的启动子序列,使用_方法可以确定真核细胞基因转录的起始点。1、原核生物与真核生物的RNA聚合酶在结构上具有高度的同源性,构成
18、原核生物RNA聚合酶的每一个亚基在真核细胞内都有同源的亚基。2、内含子在剪接反应中被切除,所以一种蛋白质的基因如果在内含子内发生突变,一般不会影响到这种蛋白质的功能。3、与蛋白质酶不同的是,核酶的活性不受温度的影响。4、RNA病毒因为无DNA基因组,所以其生活史省去了从DNA到RNA的过程。5、真核细胞mRNA的加帽反应需要GTP。6、mRNA的剪接总是产生套索结构。7、AAUAAA是真核细胞mRNA的主要加尾信号,该序列在加尾反应完成以后被切除。8、多数真核生物mRNA的降解开始于“脱帽”,随后是“去尾”。 ( )9、mRNA前体上与5端最近的内含子最有可能先被剪接掉。10、既然内含子大都是
19、遗传“垃圾”,所以在RNA剪接的时候不必进行精确的切除。1、tRNA基因的转录不需要的转录因子是( )A、TFA B、TFB C、TFC D、TFD2、在正常的生长条件下,某一细菌基因的启动子的普里布诺框由TCGACT突变成TATACT,由此而引起该基因转录水平发生变化,以下几项描述中正确的是( )A、该基因的转录增加 B、该基因的转录降低C、该基因不能转录 D、该基因的转录没有变化3、如果你想设计一种新的抗菌药物,其作用对象是原核细胞的RNA聚合酶,那么,你所设计的药物作用的最佳靶点应该是( )A、亚基 B、亚基 C、亚基 D、因子4、以下不会出现在一个cDNA克隆中的序列是( )A、加尾信
20、号 B、多腺苷酸尾巴 C、5-非翻译序列 D、TATA框5、DNA复制过程中合成RNA引物与细胞内其他RNA的差别在于( )A、T代替U B、由DNA聚合酶催化C、只能以DNA-RNA杂交双链形式存在 D、合成的方向是356、真核细胞的TATA框( )A、与-35区一道起作用 B、存在于所有编码蛋白质基因的启动子上C、将RNA聚合酶定位到启动子上 D、存在于-10区7、原核细胞内受RNA聚合酶全酶浓度的提高而加速的转录步骤是( )A、封闭的转录起始复合物的形成 B、启动子清空C、转录延伸 D、转录终止8、某些发生在RNA聚合酶亚基上的突变能够阻止依赖于因子的转录终止,你认为下列最有可能在体外恢
21、复依赖于因子的转录终止的条件是( )A、降低转录体系中的ATP浓度 B、降低转录体系中的GTP、CTP和UTP的浓度C、使用强启动子启动转录 D、在转录系统中加入核糖体9、RNA聚合酶和DNA聚合酶所具有的共同性质是( )A、都需要模板和引物 B、都具有自我校对的活性C、都需要Mg2+ D、都能够导致DNA发生解链10、以下属于转录后基因表达调控的机制是( )A、DNA分子上的C发生甲基化修饰 B、转录因子与启动子结合C、RNA分子上的C脱氨基转变成U D、基因扩增1、(1)如果将由RNA聚合酶催化转录的一个蛋白质的基因让RNA聚合酶或RNA聚合酶来转录,那么,这种蛋白质的mRNA前体还能经历
22、哪些后加工反应?(2)细菌体内的转录和翻译在时空上是偶联的,但真核生物并没有这样的偶联关系。然而,真核细胞内却有其他的过程与转录偶联,你认为它们是哪些过程?产生这种偶联机制的直接原因是什么?2、假定枯草杆菌基因组一共具有7300个基因,其中5125个基因在营养型细胞内表达,而在芽孢形成中只有3532个基因表达(假设枯草杆菌的全基因组序列和所有基因的编码序列均已经被确定)。(1)使用何种技术可以快速确定这5125个在营养型细胞表达的基因和3532个在芽孢形成中表达的基因?(2)将营养型细胞内表达的基因数和在芽孢形成中表达的基因数相加并非是7300,为什么?(3)一种枯草杆菌突变体已失去了产生芽孢
23、的能力,只能以营养型细胞生长,你认为哪些基因的突变能产生这种表型?3、下图显示的是一种细菌的几个相邻的基因结构图谱。基因的名称用带有数字的ORF表示,每一个ORF似乎是一个基因,但还没有得到专门的鉴定。某些ORF后来被证明参与Arg的合成,因此这些基因也用arg来表示,图中弯曲的箭头为转录起始点。图中单纯的数字是基因之间的核苷酸数目。(1)已有证据表明一种调节蛋白的结合位点与argF的启动子序列重叠。部分证据来自DNA酶足迹实验,受这种调节蛋白保护的区域有29 nt,从-10区的中间延伸到-35区的上游。试画出导致上升结论的足迹实验的结果,需要同时给出对照实验。(2)从(1)给出的信息来看,你
24、认为调节蛋白最有可能是激活蛋白还是阻遏蛋白?为什么?(3)下图显示的是靠近ORF5起点区域的一段RNA序列,这种结构有什么意义?它来自哪一个转录物?(4)在细菌的培养基中加入Arg,能够提高ORF4的转录。这意味着ORF4编码的蛋白质的功能是什么?ORF4有可能参与合成Arg吗?4、(1)有人得到一种哺乳动物的细胞系:它的一个基因的启动子被细菌的强启动子序列(-35区和-10区一致序列)取代,因此,可以被细菌的RNA聚合酶有效识别。然而,当他将带有原核生物转录所有必需成分的质粒(独立的实验证明,这些质粒能够高表达出有功能的蛋白质)导入到上述细胞系的时候,发现这个受原核生物启动子驱动的基因表达的
25、效率很低,最后只产生很少的mRNA。对此现象试提出两种可能的机制给予解释。(2)在真核细胞内,RNA聚合酶发生磷酸化修饰是基因表达十分重要和关键的一步。试回答:催化磷酸化的激酶是什么?磷酸化的具体对象是什么?磷酸化的主要功能是什么?习题四 翻译及其后加工1、Shine-Dalgarno sequence2、wobble rule3、signal hypothesis4、N-end rule5、translational frameshift1、翻译的时候肽链延伸的方向总是_,而阅读mRNA模板的方向总是_。2、核糖体上与tRNA结合的部位有A、P和E,其中与空载tRNA结合的是_,与起始tRN
26、A结合的部位是_。3、翻译的起始密码子通常是_,有时也可以是_。然而,它们都编码_。终止密码子则有_、_和_。4、原核生物和真核生物在翻译的时候第一个被参入的氨基酸分别是_和_。5、原核生物在蛋白质生物合成的时候,参与起始阶段的起始因子有3种,其中与起始tRNA结合的是_;参与延伸阶段的延伸因子有3种,其中与氨酰-tRNA结合的是_;终止释放因子有3种,其中能够水解GTP的是_。1、通过封闭多肽离开通道起作用的抗生素一定结合在核糖体的小亚基上。2、抑制转肽酶活性的抗生素通常与核糖体的大亚基结合。3、根据摆动法则,tRNA上的反密码子在第三个位置的核苷酸处于摇摆的位置。4、如果将细胞质中的mRNA导入到线粒体基质内翻译,通常得不到有功能的蛋白质产物。5、参与糖酵解和糖异生途径的酶都没有信号肽。6、甲硫氨酸的密码子只有一个(AUG),但起始密码子可以是AUG,也可以是GUG或UUG。由于GUG和UUG编码的是其他氨基酸,故如果以它们作为起始密码子的话,第一个参入的氨基酸将
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