2012年12月02日 Evolution 字号 小 中 大 评论 3 条 阅读 3,872 次 点击加入在线收藏夹 一、序列文本的准备构树之前先将目标基因序列都分别保存为txt文本文件中(或者把所有序列保存在同一个txt文本中,可以用“基因名称”作为第一行,然后重起一行 编辑基因序列),序列只包含序列字母(ATCG或氨基酸简写字母)。文件名名称可以已经您的想法随意编辑。二、序列导入到Mega 5软件(1)打开Mega 5软件,界面如下OK选择分析序列类型(如果是DNA序列,点击DNA,如果是蛋白序列,点击Protein)出现新的对话框,创建新的数据文件选择序列类型导入序列导入序列成功。(3)序列比对分析点击工具栏中“W”工具,进行比对分析,比对结束后删除两端不能够完全对齐碱基(4)系统发育分析关闭窗口,选择保存文件路径,自定义文件名称三、系统发育树构建根据不同分析目的,选择相应的分析算法,本例子以NJ算法为例Bootstrap 选择1000,点击Compute,开始计算计算完毕后,生成系统发育树。根据不同目的,导出分析结果,进行简单的修饰,保存本方法来自网络,经小编microibs编辑,修改补充,如果转载请注明PLoB出处。