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微生物方面Word下载.docx

1、这些细菌的传播途径包括吸入和接触(洗澡),前者见于呼吸道感染,后者见于皮肤或脑部病变。11.1.1 不动杆菌属概述不动杆菌属是革兰氏阴性、氧化酶阴性、无动力的球杆菌(短圆杆状)。由于命名单个种和生物变型比较困难,所以在一些分类方法中,醋酸钙不动杆菌属细菌复合群这一术语涵盖了此属的所有亚群,包括鲍曼不动杆菌, 鲁氏不动杆菌以及琼氏不动杆菌。对人类健康的影响不动杆菌属细菌通常是共生生物,偶尔引起感染,主要感染医院内易感患者。该菌为机会病原菌,可引起泌尿道感染、肺炎、菌血症、继发性脑膜炎以及伤口感染。这些疾病继发于恶性肿瘤、烧伤、大型外科手术或发生于免疫力低下人群如新生儿和老年人。引发院内感染的多药

2、耐药醋酸钙不动杆菌属的出现及传播,值得引起医疗卫生工作者的关注。感染源及发病不动杆菌属细菌广泛存在于土壤、水及污水环境中。97% 的天然地表水样品中可分离到不动杆菌属细菌,含菌量高达100/ml。该菌属占饮用水样品中HPC 菌群的1.05.5%。在分配水样中的分离率为592%。美国关于未处理地下水系的一项调查表明,不动杆菌属细菌在地下水系中的检出率为38%,算数平均密度为8/100 ml。该研究还揭示,不动杆菌属细菌的一种毒力因子粘液产生能力,在井水分离菌和临床菌株之间无明显差别,表明地下水中的细菌具有某种病原潜能。不动杆菌属细菌是皮肤正常菌群的组分,偶见于健康人呼吸道。感染途径环境感染源以及

3、人与人之间传播可能是大多数院内暴发感染的感染源。感染常与接触外伤及烧伤有关或是易感个体经吸入途径感染。对于不动杆菌菌血症患者来说,静脉内插管已被确定为感染源。感染的暴发与淋浴和使用室内加湿器有关。食入不是常见的感染方式。对于饮用水的意义虽然处理过的饮用水供水系统中经常可以检测到不动杆菌属细菌,但该菌属细菌的存在与临床疾病是否相关尚未确定。尚没有关于人群因饮用含不动杆菌属细菌的饮用水而引起胃肠道感染的证据。但通过饮用水引起易感个体中非胃肠道感染的传播却是有可能的,尤其是在医疗卫生机构或医院内。正如第章所述,包括医院及其他医疗卫生机构在内的建筑物应采用特殊的饮水安全计划(WSPs)。这些计划应考虑

4、居住者的特殊敏感性。不动杆菌属细菌对消毒剂如含氯消毒剂敏感,在消毒剂残留物中的数量很低。可限制细菌在水分配系统中生长的控制措施包括清除有机碳的优化处理,限制水在分配系统中的停留时间以及保持消毒剂残余浓度。HPC可用于检测不动杆菌属细菌,也可和其他参数如消毒剂残余量一起使用,作为指示该环境条件是否支持这些微生物生长的指标。但大肠杆菌(或耐热大肠菌)不能用作指示不动杆菌属细菌是否存在的指标。参考文献Bartram J et al., eds. (2003) Heterotrophic plate counts and drinking-water safety: the signi.cance o

5、f HPCs for water quality and human health. WHO Emerging Issues in Water and Infectious Disease Series. London, IWA Publishing.Bergogne-Berezin E, Towner KJ (1996) Acinetobacter as nosocomial pathogens: microbiological,clinical and epidemiological features. Clinical Microbiology Reviews,9:148165.Bifu

6、lco JM, Shirey JJ, Bissonnette GK (1989) Detection of Acinetobacter spp. in rural drinking water supplies. Applied and Environmental Microbiology, 55:2214-2219.Jellison TK, McKinnon PS, Rybak MJ (2001) Epidemiology, resistance and outcomes of Acinetobacter baumannii bacteremia treated with imipenem-

7、cilastatin or ampicillin-sulbactam. Pharmacotherapy, 21:142148.Rusin PA et al. (1997) Risk assessment of opportunistic bacterial pathogens in drinking-water. Reviews of Environmental Contamination and Toxicology, 152:5783.11.1.2 气单胞菌属气单胞菌属是革兰氏阴性、无芽孢、兼性厌氧杆菌,属弧菌科,这些细菌与肠杆菌科菌有很多相似之处。该属细菌分为两群,仅由一个种组成的嗜冷无

8、动力产气单胞菌群以及专性鱼病原菌杀鲑气单胞菌群,对于后者,此处不多述。 噬温动力(单极鞭毛)产气单胞菌群被认为对人类健康具有潜在意义,该群由噬水气单胞菌、豚鼠气单胞菌、维氏气单胞菌亚种温和气单胞菌、中间气单胞菌、维氏气单胞菌亚种维氏气单胞菌及舒氏气单胞菌组成。该类细菌通常存在于淡水中,也可从水、土壤及多种食物尤其是肉类和牛奶中分离到。气单胞菌属可引起人类感染,包括败血症、伤口感染和呼吸道感染,对免疫受损的患者尤易引起败血症。有人称气单胞菌属可引起胃肠道疾病,但缺乏统一的流行病学证据。尽管气单胞菌属在体外可产生大量毒素,但尚不能引起实验动物或人类自愿者的腹泻。气单胞菌属存在于水、土壤及食物尤其是

9、肉、鱼和奶中。通常在多数淡水中都可发现气单胞菌属,在很多处理过的饮用水供水系统中也能检测到该菌,这主要是由于细菌在水分配系统中生长的结果。导致水分配系统中出现气单胞菌属的因素尚未完全弄清,但已发现有机物含量、温度、水在水分配网络中停留的时间以及残余氯的存在可影响菌群的数量。伤口感染与污染的土壤及接触水的活动如游泳、潜水、划船和捕鱼有关,伤口感染可引发败血症。免疫受损的个体自身胃肠道的气单胞菌属即可导致败血症。尽管饮用水中常可分离到气单胞菌属,但没有有力的证据支持该菌的水源传播。饮用水中常分离到的气单胞菌属与胃肠炎患者中分离到的菌不具有DNA的同源性。饮用水供应系统中存在气单胞菌属通常被认为是一

10、种公害。充分消毒可减少进入水分配系统中的气单胞菌属数量。可限制该菌在水分配系统中生长的控制措施包括清除有机碳的优化处理,限制水在分配系统中的停留时间以及保持消毒剂残余浓度。HPC可用于检测气单胞菌属细菌,也可和其他参数如消毒剂残余量一起使用,作为指示该环境条件是否支持这些微生物生长的指标。但大肠杆菌(或耐热大肠菌)不能用作指示气单胞菌属细菌是否存在的指标。 the signicance of HPCs for water quality and human health. WHO Emerging Issues in Water and Infectious Disease Series. L

11、ondon, IWA Publishing.Borchardt MA, Stemper ME, Standridge JH (2003) Aeromonas isolates from human diarrheic stool and groundwater compared by pulsed-eld gel electrophoresis. Emerging Infectious Diseases, 9:224228.WHO (2002) Aeromonas. In: Guidelines for drinking-water quality , 2nd ed. Addendum: Mi

12、crobiological agents in drinking water. Geneva, World Health Organization.11.1.3 芽孢杆菌属芽孢杆菌属是大的(410um), 革兰氏阳性,严格需氧或兼性厌氧的有荚膜的杆菌。该属细菌的重要特性是能够产生对不利条件具有特殊抵抗力的芽孢。芽孢杆菌属可分为以下亚群:多粘芽孢杆菌、枯草杆菌(包括蜡样杆菌和地衣芽孢杆菌)、短芽孢杆菌和炭疽芽孢杆菌。大多数芽孢杆菌属细菌是无害的,但有一些对人和动物致病。蜡样杆菌可引起食物中毒,症状与金葡菌食物中毒相似。一些菌株在食物中可产生热稳定的毒素,该毒素与芽孢出芽有关,在被食入后1-5小时

13、出现呕吐症状。其他菌株产生不耐热肠毒素,在食入后1015小时内引起腹泻。已知蜡样杆菌可引起免疫受损患者的菌血症以及其他症状如呕吐和腹泻。炭疽杆菌可引起人和动物炭疽。芽孢杆菌属通常可见于很多自然环境,如土壤和水中。他们是HPC菌的组成成分,HPC菌在大多数饮用水供应系统中很容易检测到。芽孢杆菌属感染与食用多种食物尤其是米饭、意大利面条、蔬菜以及未加工牛奶和肉制品有关。食入微生物或微生物产生的毒素均可致病。饮用水未被确认为病原性芽孢杆菌属包括蜡样杆菌的感染源,芽孢杆菌属胃肠炎的水源传播也未被证实。对饮用水的意义饮用水供应系统中常可检测到芽孢杆菌属,经合格程序处理和消毒过的水中也不例外。这主要是由于

14、芽孢对消毒程序具有抵抗力的缘故。由于没有确切证据说明水源性芽孢杆菌属具有临床意义,所以尚未要求对饮用水进行特殊处理。11.1.4 类鼻疽伯克氏菌类鼻疽伯克氏菌是革兰氏阴性杆菌,常见于土壤及泥水中,主要存在于热带地区如澳大利亚北部和东南亚。该菌耐酸,在缺乏营养的状态下仍可在水中长期存活。类鼻疽伯克氏菌可引起类鼻疽,该病在澳大利亚北部和其他地区流行。最常见的临床表现是肺炎,此种肺炎可致命。在这些地区中的某些地方,类鼻疽是社区感染肺炎的最常见原因。全年均有发病但发病高峰期为雨季。某些患者肺炎症状较轻,对适当的抗生素治疗反应较好,但有些是严重的败血症肺炎。其他症状包括皮肤脓肿或溃疡,内脏脓肿以及不常见

15、的神经系统疾病如脑干脑炎和急性下身麻痹。尽管类鼻疽也可发生于健康儿童及成人,该病主要还是见于因基础疾病导致抗感染机制受损或因营养不良或生活条件差导致健康状态不良的个体。该菌主要见于热带地区,常见于土壤及地表积聚的泥水中,从这些地方进入生水源以及饮用水供应系统。饮用水中该菌达到多少数量才具有感染风险尚不清楚。大多数感染似乎是因皮肤切口或擦伤接触污染水所致。在东南亚,稻田是很重要的感染源。也可通过其他途径感染尤其是吸入和食入。这些感染途径的重要程度如何尚不清楚。澳大利亚两次鼻疽暴发事件中,自患者及饮用水供水系统中分离到的类鼻疽伯克氏菌基本相同。其中一次饮用水供水系统中检测到细菌是在更换水管和氯化处

16、理失败之后,而另外一次供水系统则未经氯化处理。饮水安全计划中,可对此菌提供有效保护的控制措施包括对饮用水进行确定的处理和消毒,同时保护水分配系统不受污染,措施包括系统修理和维护。HPC及消毒剂残余量可作为衡量水处理措施效力及适当的排水管修理程序是否能够保护饮用水免于类鼻疽伯克氏菌污染的指标。由于类鼻疽伯克氏菌在环境中存在,所以大肠杆菌(或耐热大肠菌)不是指示该菌是否存在的适宜指标。Ainsworth R, ed. (2004) Safe, piped water: Managing microbial water quality in piped distribution systems. I

17、WA Publishing, London, for the World Health Organization, Geneva.Currie BJ. (2000) The epidemiology of melioidosis in Australia and Papua New Guinea. Acta Tropica, 74:121127.Currie BJ et al. (2001) A cluster of melioidosis cases from an endemic region is clonal and is linked to the water supply usin

18、g molecular typing of Burkholderia pseudo- mallei isolates. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 65:177179.Inglis TJJ et al. (2000) Outbreak strain of Burkholderia pseudomallei traced to water treatment plant. Emerging Infectious Diseases, 6:5659.11.1.5 弯曲杆菌弯曲杆菌属是微嗜氧(需减量氧)、嗜二氧化碳(需增量二氧化

19、碳)的革兰氏阴性弯曲螺旋形杆菌,带有单个无鞘极生鞭毛,弯曲杆菌属是引起全球急性胃肠炎最重要的病因之一。空肠弯曲杆菌是急性腹泻患者中最常分离到的种,小部分患者中还分离到大肠弯曲杆菌、海鸥弯曲菌及胚胎弯曲杆菌。两个密切相连的属:螺杆菌和弓形杆菌,包括原分类为弯曲菌属的一些种。与其它病原相比,空肠弯曲杆菌的一个重要特性是较高的传染力。1000个菌即可引起感染。大多数有症状的感染发生在婴幼儿。疾病潜伏期通常为24天。空肠弯曲杆菌感染的典型临床症状是腹痛、腹泻(便中带或不带血及白细胞)、呕吐、寒战、发热。感染是自限性的,37天恢复。510%未治疗的患者会复发。人感染空肠弯曲菌的其他临床表现包括反应性关节

20、炎和脑膜炎。几份病例报告表明空肠弯曲杆菌感染与一种急性周围神经脱髓鞘疾病格林-巴利综合征有关。弯曲杆菌属存在于多种环境中。野生和家养动物,尤其是禽类、野鸟和牛是重要的宿主。宠物和其他动物也可作为宿主。食物,包括肉和未消毒的牛奶,是重要的弯曲杆菌感染源。水也是重要的感染源。地表水中是否存在弯曲杆菌取决于降雨、水温以及是否存在水禽。多数弯曲杆菌感染为散发,食物被认为是常见的感染源。人类被传染通常是由于食用动物制品所致。肉类,尤其是禽类制品及未消毒的牛奶是重要的感染源。已确认被污染的饮用水供水系统是疾病暴发的根源。暴发病例数由几例到几千例不等,感染源包括未氯化处理或未经充分氯化处理的地表水供应系统以

21、及被野鸟粪便污染的水库水。污染的饮用水供水系统是弯曲菌病暴发的重要感染源。水源性疾病暴发以及病例数似乎日益增多。自患者及其饮用的饮用水中分离到同样的菌株,证实了疾病的水源性传播。饮水安全计划中,可避免弯曲杆菌属潜在危险的控制措施包括:保护生水不被动物和人类废物污染,在水分配过程中进行充分处理和保护,处理和消毒过的水储存库应避免被鸟粪污染。弯曲杆菌属是粪源性病原,对消毒处理没有特殊的抵抗力。所以,大肠杆菌(或耐热大肠菌)可作为指示该菌在饮用水供应系统中是否存在的适宜指标。Frost JA .(2001) Current epidemiological issues in human campyl

22、obacteriosis. Journalof Applied Microbiology, 90:85S95S.Koenraad PMFJ, Rombouts FM, Notermans SHW. (1997) Epidemiological aspects of thermophilic Campylobacter in water-related environments: A review. Water Environment Research, 69:5263.Kuroki S et al. (1991) Guillain-Barr syndrome associated with C

23、ampylobacter infec- tion. Pediatric Infectious Diseases Journal, 10:149151.11.1.6 致病性大肠杆菌大肠杆菌在人和动物肠道内大量存在,是肠道正常菌群的一部分,通常无害。但在身体的其他部分,大肠杆菌可引起严重疾病如泌尿系感染、菌血症和脑膜炎。少量肠道病原菌株可引起急性腹泻。根据不同的毒力因子确定了几类肠道致病大肠杆菌: 肠出血性大肠埃希菌(EHEC)、肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)、肠致病性大肠埃希菌 (EPEC)、肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)、肠凝集性大肠埃希菌(EAEC)以及扩粘型大肠埃希菌 (DAEC)。人们对

24、前四类大肠杆菌了解较多,但对EAEC 和 DAEC菌株的致病性和流行情况却知之甚少。 EHEC 的某些血清型如大肠杆菌O157:H7和大肠杆菌O111, 可引起腹泻,疾病程度轻重不一,从轻度非血便到重度血便均可出现,后者类似出血性结肠炎。2% 到7% 的患者会出现潜在致命的溶血尿毒症综合征(HUS),该病特征为急性肾衰和溶血性贫血。岁以下儿童最易患HUS。EHEC菌株的感染力明显高于其他菌株。100 个EHEC菌就可引起感染。ETEC 可分别或同时产生不耐热或耐热大肠杆菌肠毒素,是发展中国家尤其是儿童腹泻的重要病因。ETEC感染的症状包括轻度水样便、腹部痛性痉挛、恶心和头痛。EPEC感染可引起

25、婴儿严重慢性非出血性腹泻,呕吐和发热。EPEC 感染在发达国家少见,但在发展中国家营养不良、低体重、生长迟缓的婴儿中很常见。EIEC引起水样腹泻,如菌株侵袭结肠细胞时偶可引起血便,其致病机制与志贺氏菌类似。肠致病性大肠杆菌是肠道微生物,人是主要宿主,尤其对EPEC、ETEC和EIEC菌株来说,更是如此。家畜,如牛和羊,以及山羊、猪和鸡是EHEC菌株的主要来源。EHEC感染还与食用生蔬菜如豆芽有关。这些病原在多种水环境中都可检测到。感染主要通过人与人之间传播,与动物和食物接触以及饮用污染水也可导致感染。在疗养所和日间护理中心这样存在个体间密切接触的社区中,人与人之间的传播是主要的传染方式。再生水

26、和污染的饮用水可造成病原性大肠杆菌的水源性传播,这一点已得到公认。加拿大安大略省Walkerton镇的农场社区曾暴发了一次大肠杆菌O157:H7A(和空肠弯曲杆菌)引起的水源性疾病流行,这一事件已被广为报道。该次疾病暴发发生在2000年5月,导致7人死亡,2300多人发病。 该次事件是因饮用水供水系统被流入的含有牛排泄物的雨水污染所致。在饮用水安全计划中,可防止潜在肠致病性大肠杆菌污染的控制措施包括保护生水不受人及动物废物的污染,以及在水分配过程中进行充分的处理和保护。没有迹象表明肠致病性大肠杆菌菌株对水处理和消毒程序的反应与其他大肠杆菌有何不同,所以,传统的检测大肠杆菌(或耐热大肠菌)的方法

27、可作为指示饮用水中肠致病性血清型的适宜指标,但标准的检测方法通常不能用于检测EHEC菌株。Nataro JP, Kaper JB (1998) Diarrheagenic Escherichia coli. Clinical Microbiology Reviews, 11:142201.OConnor DR (2002) Report of the Walkerton Inquiry: The events of May 2000 and related issues. Part 1: A summary. Toronto, Ontario, Ontario Ministry of the

28、Attorney General, Queens Printer for Ontario.11.1.7 幽门螺杆菌幽门螺杆菌最初被分类为幽门弯曲杆菌,是革兰氏阴性、微需氧、螺旋形有动力的无芽孢杆菌。螺杆菌至少包括14个种,但只有幽门螺杆菌被确认为人类病原菌。幽门螺杆菌自胃中被发现,该菌与慢性胃炎有关,可进一步导致胃十二指肠溃疡和胃溃疡,但大多数感染无症状。该菌是否是这些疾病的真正病因尚不清楚。大多数幽门螺杆菌感染发生在儿童时期,未经治疗为慢性感染,感染在发展中国家更常见,与拥挤的居住环境有关。家庭间聚集现象常见。人似乎是幽门螺杆菌的主要宿主。其他宿主可能包括家猫。有证据表明幽门螺杆菌对胆盐敏感,这将减少粪便排泄的可能性,不过幼儿粪便中已分离到该菌。该菌也已在水中检出。虽然幽门螺杆菌不大可能在环境中生长,但已发现该菌在生物膜上可存活3周,在地表水中可存活20-3

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