实验一微生物拮抗作用Word格式文档下载.docx

1、取8支试管每管加150LDB，第一管中参加50L（2000ng50L）尺度液，充实涡旋后，取50L至第二号管中，同样涡旋后，取50L到第三管；依次稀释到第六管，稀释后的尺度ABA依次为1000ng、500ng、250ng、125ng、62.5ng、31.25ng、15.625ng、7.8125ng50L。3、洗板：从37湿盒中取出滴定板，规复到室温后，弃去包被液，用WB（洗涤缓冲液）洗涤三次，甩干（吸水纸）。4、加样：18孔对应参加ABA标样50L，10号孔相应参加最浓ABA标样，9号孔加50LDB，三排重复；然后每孔加50L抗体，37 45分钟。5、洗板：6、加酶标二抗：每孔加100L，37

2、反响1小时。7、洗板：8、显色：各孔加10LOPD显色液，37 20分钟。9、终止反响：各孔加50L 6NH2SO4。10、读数：490nm读取OD值。其中10号孔调零,而9号孔为最大值（B0）,18号孔的OD值为B。11、结果盘算：以In（B/B0）（1B/B0）为纵坐标，以尺度ABA浓度的常用对数（lgABA）为横坐标,绘制曲线。实验三 质粒DNA的提取及其酶切实验目的 通过本实验学习和掌握碱裂解法提取质粒DNA 。实验原理 碱裂解法提取质粒是凭据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差别来分散它们。 在pH值介于12.012.5这个狭窄的范畴内，线性的DNA双螺旋结构解开而

3、被变性，尽管在这样的条件下，共价闭环质粒DNA的氢键会被断裂，但两条互补链相互相互缠绕，仍会紧密地结合在一起。当参加pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液规复pH 至中性时，共价闭合环状的质粒DNA的两条互补链仍保持在一起，因此复性迅速而准确，而线性的染色体DNA的两条互补链相互已完全离开，复性就不会那木迅速而准确，它们缠绕形成网状结构，通过离心，染色体DNA与不稳定的大分子RNA，卵白质SDS复合物等一起沉淀下来而被撤除。实验步调（一）提取质粒1.将2 ml 含相应抗生素的LB液体培养基参加试管中，接入上述的含pUC19质粒的大肠杆菌单菌落，37振荡培养留宿。2.取培养物倒入微量1.5ml离心管中，4

4、000 r/min 离心 2 min。3.弃上清，吸尽残液，使细胞沉淀尽可能干燥。4.参加100ul溶液，充实混匀，室温安排10 min。 5.加200 ul溶液 （新鲜配制），盖紧管盖，轻轻颠倒数次混匀，将离心管放冰上 5 min 。6.参加150 ul 溶液 （冰上预冷），盖紧管口，颠倒数次使混匀。冰上安排 15 min 。7.12000 r/min ,离心15 min ，将上清转至另一离心管中。8.参加等体积酚：氯仿（1：1）（去卵白），重复混匀，12000 r/min，离心5 min，将上清转移到另一离心管中。9.参加2倍体积无水乙醇，混匀后，室温安排510 min。12000r/mi

5、n离心 5 min。倒去上清液，把离心管倒扣在吸水纸上，吸干液体。10.用1 ml 70% 乙醇洗涤质粒DNA沉淀，振荡并离心，倒去上清液，真空抽干或空气中干燥。11.加50 ul TE缓冲液，其中含有20 ug/ml的胰RNA酶，使DNA完全溶解，20生存。（二）酶切取DNA溶液，加酶切缓冲液，EcoRI酶1 ul，无菌水补至总体积10 ul，37保温3h,加终止液，准备下个实验电泳，阐发质粒DNA的限制性酶切图谱。实验四 琼脂糖凝胶电泳技能实验目的通过本实验学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的要领和技能。实验原理DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的pH溶

6、液中带负电荷在电场中向正极移动。由于糖磷酸骨架在结构上的重复性质，相同数量的双链DNA险些具有等量的净电荷，因此他们能以相同的速度向正极偏向移动。在一定的电场强度下，DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应，即DNA分子自己的巨细和构型。具有差别的相对分子质量的DNA片段泳动速度不一样，可进行分散。DNA分子的迁移速度与相对分子质量对数值成反比干系.。凝胶电泳不但可以分散差别相对分子质量的DNA, 也可以分散相对分子质量相同,但构型差别的DNA分子。如上次实验提取的pUC19质粒，有3种构型：超螺旋的共价闭合环状质粒DNA（covalently closed circular DNA，简称 CCC

7、DNA），开环质粒DNA，即共价闭合环状质粒DNA1条链断裂，（open circular DNA, 简称OCDNA）,线状质粒DNA ，即共价闭合环状质粒DNA2条链产生断裂，（linear DNA，简称L DNA）。这3种构型的质粒DNA分子在凝胶电泳中的迁移率差别。因此电泳后呈3条带，超螺旋质粒DNA泳动最快，其次为线状DNA，开环质粒DNA。 实验步调（一）制备琼脂糖凝胶电泳槽及用胶量将琼脂糖按比例溶入1X TAE缓冲液中，微波炉加热至完全溶化，冷却至60, 参加适量EB, 混匀。 （二）胶板的制备1.取有机玻璃内槽，洗净，晾干，用橡皮膏将有机玻璃内槽的两端边沿封好（一定封严，不能留漏

8、洞）。2.将有机玻璃内槽安排于一水平位置，并放好样品梳子。梳子调解齐3.将冷到60左右的琼脂糖凝胶液，徐徐倒入有机玻璃内槽，直至有机玻璃板上形成一层均匀的胶面（注意不要形成气泡）。4.待胶凝固后，取出梳子，取下橡皮膏，将胶槽放在电泳槽内。5.参加电泳缓冲液至电泳槽中。 （三）加样, 用移液器将已参加上样缓冲液的DNA样品参加样品孔（记载点样顺序及点样量）。 （四）电泳1.接通电泳槽与电泳仪的电源（注意正负极，DNA片段从负极向正极移动）。DNA的迁移速度与电压成正比，最高电压不凌驾5 V/cm。2.当溴酚蓝染料移动到距凝胶前沿12cm处，停止电泳。 （五）染色将电泳后的凝胶浸入溴化乙锭染色液中

9、，染色以视察在琼脂糖凝胶中的带（戴手套操纵）。实验五 真核生物高分子量DNA制备实验原理 利用液氮对植物组织进行研磨，从而破碎细胞。细胞提取液中含有的SDS溶解膜卵白而破坏细胞膜，使卵白质变性而沉淀下来。EDTA抑制DNA酶的活性。再用酚、氯仿抽提的要领去除卵白，得到的DNA溶液经乙醇沉淀。实验质料: 新鲜植物叶片实验步调1.取4g新鲜叶片，在液氮中研磨成粉末状（越细越好）。2.转移至50ml离心管中，参加16ml TENbf，充实混匀。65水浴保温20min。3.从水浴中取出离心管，参加5ml 5 mol/L KCl溶液，混匀，水浴20min。4.4000r/min 离心 20 min。5.

10、将上清液转移到另一50ml离心管中。6.加等体积酚氯仿混匀，12000rmin 离心5min，取上清。7.加等体积氯仿，混匀，12000rmin 离心5min，取上清。8.参加0.61倍体积的异丙醇（沉淀DNA），混匀。安排时间9.离心得到沉淀，70乙醇洗3次。风干沉淀。10.参加500LTE缓冲液，溶解DNA。11.取3L上清液,琼脂糖凝胶电泳检测DNA浓度、质量。实验六 PCR基因扩增实验目的：掌握PCR反响的根本原理与实验技能实验原理：PCR（ Polymerase Chain Reaction）-聚合酶链式反响，可以选择性扩增一段DNA序列。其根本步调是，首先将待扩增的模板DNA变性使

11、之成为单链， DNA样品中，特异性的引物能够与其互补的序列杂交，在dNTPs和Taq酶存在时，就可以合成模板DNA的互补链，反响完成后，将反响混淆物加热使DNA双链变性，温度下降后，过量的引物又可以开始第二轮的合成反响。这种延伸变性退火延伸的循环可以重复多次，使所需要的DNA片段得到特异性的扩增。1变性：加热使模板DNA在高温下（94）变性，双链间的氢键断裂而形成两条单链.2退火：使溶液温度降至5060，模板DNA与引物按碱基配对原则互补结合.3延伸：溶液反响温度升至72，耐热DNA聚合酶以单链DNA为模板，在引物的引导下，利用反响混淆物中的4种脱氧核苷三磷酸（dNTPs），按53偏向复制出互

12、补DNA.上述3步为一个循环，即高温变性、低温退火、中温延伸3个阶段。从理论上讲，每经过一个循环，样本中的DNA量应该增加一倍，新形成的链又可成为新一轮循环的模板，经过2530个循环后DNA可扩增106109倍。典范的PCR反响体系由如下组分组成：DNA模板、反响缓冲液、dNTP、MgCl2、两个合成的DNA引物、耐热Taq聚合酶。一、仪器、实验用品、试剂一、仪器PCR仪冰箱电泳仪微波炉电泳槽离心机紫外检测仪二、试剂PCR BufferTAE（500ml）Ice琼脂糖Tag溴化乙锭d NTPs溴酚蓝模板DNAmarkerPrimer1Primer2石蜡油三、其它用品移液器 （一套）Tip（一套

13、） PCR管 （0.2ml）防护眼镜一次性手套胶带四:时间摆设： 上午 10：30 配反响体系中午 PCR下午 电泳PCR（范提供）反响体系10x Bf 1x 2.5ulTag 5u/ul 0.2ulD NTPs 2.5um 2.0ulPrimer1 10um 2.5ul Primer2 10um 2.5ul DNA 2.0ul-H2O to 25ul混匀，加石蜡油步伐：94 预变性 3 以下35cycle 94 变性 1.5min 50/55 退火 30s 72 延伸 1-2min 最后 72 5min电泳 配制1琼脂糖凝胶，取10ul扩增产物电泳阐发PCR结果bf : KCl 50mmol

14、/L 促进引物退火Tris.HCl 10-50mmol/L PH 8.4BSA 100ug/ml （乙酰化的BSA） 对酶有掩护作用Mg离子: 1.5-2mmol/L 1.与d NTP 结合（PO4离子）2.与引物中的 EDTA结合 3.与模板中的 EDTA结合4. Taq 活性需要游离的Mg离子购 d NTP 为25um, 需稀释10倍至2.5umPrimers: Boo12 F 10D Boo14 R 10D分子量 24bp * 324.5 = 7788质量数 10D 33 33ug摩尔数 33 7788 4.2 n mol浓度 4.2 n mol/84ul H2O = 50um 取母液（

15、50um） 1ul加水至5ul , 稀释5倍，则终浓度为10um二、几种常用反响体系：1.在0.2ml Eppendorf 管内配制25ul反响体系 （华丽PCR kit）摆设 4人一组 每班可分5组 终浓度10x bf 5 ul （MgCl2-free）MgCl2 3 25mmol/L 1.54dNTPs 4 2.5mmol/L/each 0.2P1 2 12.5pmol/ul 0.25P2 2 12.5pmol/ul 0.25 DNA 2 1ng/ul 2 ngTaq 1 3u/ul H2O 31 Total 50ul混匀离心 50ul 石蜡油 离心PCR 步伐 94 5min94 1mi

16、n 60 1min72 1min30 cycle72 5min琼脂糖凝胶电泳阐发PCR结果 配制1琼脂糖凝胶，取10ul扩增产物电泳。 实验七 DNA重组技能酶切、连接实验原理: DNA重组技能是用内切酶分别将载体和外源DNA切开，经分散纯化后，用链接酶将其连接，组成新的DNA分子。限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其四周的特异位点上,并切割双链DNA。如EcoR切割识别序列后产生两个互补的粘性末端。5GAATTC3 5 G AATTC33CTTAAG 5 3 CTTAA G5 构建DNA限制性内切酶图谱有许多要领。通常结合使用多种限制性内切酶，通过综合阐发

17、多种酶单切及差别组合的多种酶同时切所得到的限制性片段巨细来确定种种酶的酶切位点及其相对位置。酶切图谱的使用代价依赖于它的准确性和精确水平。限制性内切酶的一个活性单元U理论上， 1hr,切1ug DNA 样品中所有专一位点的所用酶量实际反响，1U酶：能完全切割1ul DNA的一个位点不能完全 切割1ug 带有4个酶切位点的样品和不纯的样品如果接纳两种限制性内切酶,必须要注意分别提供各自的最适盐浓度。若两者可用同一缓冲液,则可同时水解。若需要差别的盐浓度,则低盐浓度的限制性内切酶必须首先使用,随后调治盐浓度,再用高盐浓度的限制性内切酶水解。限制性内切酶的使用注意事项： 10x bf o 无盐注意混

18、匀 L 低盐H 高盐一.仪器水浴锅（37，65） 凝胶电泳灭菌锅 紫外检测二.试剂及溶液 DNA EcoR IpUC18 无菌水 终止液 （40%蔗糖） 70，100酒精3Mol/L KAc（pH5.2） ice琼脂糖 溴酚蓝TE TAEEB marker三.用品移液器 20ul 一次性手套tip 20ul 防护镜 离心管 0.5ml 吸水纸胶带 浮子PUC 18/19, DNA2人组，一人做 PUC18 酶切 （20ug） Takara 25ug/个 一人作DNA 酶切 （15ug）EcoR1 1ul/人 （10 u） （20ul） Takara 4000u/个四：酶切反响:DNA纯度、缓冲

19、液、温度条件及限制性内切酶自己都市影响限制性内切酶的活性。大部门限制性内切酶不受RNA或单链DNA的影响。当微量的污染物进入限制性内切酶贮存液中时,会影响其进一步使用,因此在吸取限制性内切酶时,每次都要用新的吸管头.注意 1.酶切时所加的DNA溶液体积不能太大，不然DNA溶液中其他身分会滋扰酶反响。 2、酶活力通常用酶单元（U）表现，酶单元的界说是：在最适反响条件下，1小时完全降解1mg DNA的酶量为一个单元，但是许多实验制备的DNA不象DNA那样易于降解，需适当增加酶的使用量。反响液中参加过量的酶是不符合的，除考虑本钱外，酶液中的微量杂质可能滋扰随后的反响。3、市场销售的酶一般浓度很大，为

20、节约起见，使用时可事先用酶反响缓冲液（1）进行稀释。另外，酶通常生存在50%的甘油中，实验中，应将反响液中甘油浓度控制在1/10之下，不然，酶活性将受影响。反响 1. PUC 4ul （0.5ug/ul） buffer 2ul EcoR1 1ul 350u/ul（15u/ul） H2O 15ul - Total 20ul 反响 2. DNA 4ul （1.5ug, 0.4ug/ul） bf 1 EcoR1 1 H2O 4 - Total 10ul37,2hr终止反响 65 10min各取2ul酶解液，电泳EcoRI切割DNA后电泳得到6个片段,长度分别为 21.2, 7.4, 5.8, 5.6

21、, 4.9 和 2.5kb实验八 DNA重组技能（二）连接质粒具有稳定可靠和操纵轻便的优点。如果要克隆较小的DNA片段（10kb且结构简朴,质粒要比其它任何载体都要好。在质粒载体上进行克隆,从原理上说是很简朴的，先用限制性内切酶切割质粒DNA和目的DNA片段, 然后体外使两者相连接, 再用所得到重组质粒转化细菌,即可完成。但在实际事情中, 如何区分插入有外源DNA的重组质粒和无插入而自身环化的载体分子是较为困难的。通过调解连接反响中外源DNA片段和载体DNA的浓度比例,可以将载体的自身环化限制在一定水平之下,也可以进一步接纳一些特殊的克隆计谋,如载体去磷酸化等来最大限度的低落载体的自身环化,还

22、可以利用遗传学手段如互补现象等来辨别重组子和非重组子。外源DNA片段和质粒载体的连接反响计谋有以下几种：1、带有非互补突出端的片段 用两种差别的限制性内切酶进行消化可以产生带有非互补的粘性末端,这也是最容易克隆的DNA片段。2、带有相同的粘性末端 用相同的酶或同尾酶处置惩罚可得到这样的末端。3、带有平末端 是由产生平末端的限制酶或核酸外切酶消化产生，或由DNA聚合酶补平所致。由于平端的连接效率比粘性末端要低得多，故在其连接反响中，T4 DNA连接酶的浓度和外源DNA及载体DNA浓度均要高得多。通常还需参加低浓度的聚乙二醇（PEG 8000）以促进DNA分子凝聚成聚团体的物质以提高转化效率。特殊

23、情况下，外源DNA分子的末端与所用的载体末端无法相互匹配,则可以在线状质粒载体末端或外源DNA片段末端接上符合的讨论（linker）或衔讨论（adapter）使其匹配, 也可以有控制的使用E. coli DNA聚合酶的klenow大片段部门填平3凹端,使不相匹配的末端转变为互补末端或转为平末端后再进行连接。一、 质料 PUC，DNA二、 设备 恒温摇床， 台式高速离心机，恒温水浴锅， 琼脂糖凝胶电泳装置， 电热恒温培养箱 ， 电泳仪无菌，超净事情台， 微量移液枪，Tip. eppendorf管。三、 试剂 10X bf T4 链接酶 琼脂糖 TAE Marker EB 溴酚兰四、 连接反响 P

24、UC （酶切） 5ul DNA （酶切） 5ul T4 ligase 1ul （350u/ul） 10x bf 1.2H2O -Total 12ul 14,O/N. DNA ligase 对温度敏感，15以上失活。 五、电泳实验九 大肠杆菌感觉态细胞的制备及转化实验原理 将质粒载体转移进受体细菌，需诱导受体细菌产生一种短暂的感觉态以摄取外源DNA。转化（Transformation）是将外源DNA分子引入受体细胞,使之得到新的遗传性状的一种手段,它是微生物遗传、分子遗传、基因工程等研究领域的根本实验技能。转化历程所用的受体细胞一般是限制修饰系统缺陷的变异株，即不含限制性内切酶和甲基化酶的突变体

25、（R,M）,它可以容忍外源DNA分子进入体内并稳定地遗传给子女。为了提高转化效率, 实验中要考虑以下几个重要因素：1. 细胞生长状态和密度: 细胞生长密度以刚进入对数生恒久时为好，可通过监测培养液的OD600 来控制。DH5菌株的OD600 为0.5时,细胞密度在5107 个/ml左右（差别的菌株情况有所差别）,这时比力符合。密度过高或不敷均会影响转化效率。2. 质粒的质量和浓度: 1ng的cccDNA即可使50l 的感觉态细胞到达饱和。一般情况下,DNA溶液的体积不应凌驾感觉态细胞体积的5。3. 试剂的质量: 所用的试剂,如CaCl2 等均需是最高纯度的（GR.或AR.）,并用超纯水配制,最

26、好分装生存于干燥的冷暗处。4. 防备杂菌和杂DNA的污染。本实验以E.coli DH5a菌株为受体细胞,并用CaCl2处置惩罚,使其处于感觉态,然后与pBS质粒共保温,实现转化。由于pBS质粒带有氨苄青霉素抗性基因（Ampr ），可通过Amp抗性来筛选转化子。如受体细胞没有转入pBS，则在含Amp的培养基上不能生长。能在Amp培养基上生长的受体细胞（转化子）肯定已导入了pBS。转化子扩增后，可将转化的质粒提取出，进行电泳、酶切等进一步判定。一.仪器 控温摇床（37） 高速冷冻离心机水浴锅 冰箱（-20,70）超净事情台 培养箱（37） 752分光光度计 灭菌锅二.试剂 CaCl2 无菌水,冰胰卵白胨 酵母粉 Amp NaCl三.其他用品移液器， 枪头1.5ml ,50ml 离心管 三角瓶 500ml 200ml 6cm平皿 试剂瓶60ml量筒 烧杯琼脂 甘油酒精灯 三角玻棒酒精棉球 洋火溶液配制 0.1 mol/L CaCl2溶液 配置 灭菌LB液体培养基氨苄青霉素（Amp），用无菌水配制成50_60 mg/mL溶液，抽虑灭菌置20冰箱中生存。四.质料 E.coli.DH5 质粒 DNA 五: 实验步调：（CaCl2） （20人一班，分三组）第一天：从大肠杆菌DH5平板上挑取一个