1、9600 0.71 2常用核酸的长度与分子量 核酸 核苷酸数 DNA 48502(双链环状) 3.010 7 pBR322 4363(双链) 2.810 6 28SrRNA 4800 1.623SrRNA 3700 1.218SrRNA 1900 6.110 5 19SrRNA 1700 5.55SrRNA 120 3.610 4 tRNA(大肠杆菌) 75 2.53常用核酸蛋白换算数据 (1)重量换算 1g=10 -6 g 1pg=10 -12 g 1ng=10 -9 g 1fg=10 -15 g (2)分光光度换算: 1A 260 双链DNA=50g/ml 1A 260 单链DNA=30g
2、/ml 1A 260 单链RNA=40g/ml (3)DNA摩尔换算:1g 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端 1g pBR322 DNA=0.36pmol 1pmol 1000bp DNA=0.66g 1pmol pBR322=2.8g 1kb双链DNA(钠盐)=6.610 5 道尔顿 1kb单链DNA(钠盐)=3.31kb单链RNA(钠盐)=3.4(4)蛋白摩尔换算:100pmol分子量100,000蛋白质=10g 100pmol分子量50,000蛋白质=5g 100pmol分子量10,000蛋白质=1g 氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿 (5)蛋白质/DNA换
3、算:1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.710 4 MW蛋白质 10,000MW蛋白质=270bp DNA 30,000MW蛋白质=810bp DNA 50,000MW蛋白质=1.35kb 100,000MW蛋白质=2.7kb DNA 4常用蛋白质分子量标准参照物 (1)高分子量标准参照 (2)中分子量标准参照 (3)低分子量标准参照 肌球蛋白 磷酸化酶B 97,400 碳酸酐酶 31,00 212,000 牛血清白蛋白 66,200 大豆脻蛋白酶 21,500 -半乳糖甘酶B 116,000 谷氨酶脱氢酶 55,000 抑制剂 卵白蛋白 42,700 马心肌球蛋白 16,900 醛
4、缩酶 40,000 溶菌酶 14,400 过氧化氢酶 57,000 31,000 肌球蛋白(F1) 8,100 肌球蛋白(F2) 6,200 肌球蛋白(F3) 2,500 5常用DNA分子量标准参照物 DNA/Hind DNA/EcoR /Hind+EcoR pBR322/Hae 23130 21226 21227 587 123 9416 7421 5148 405 104 6557 5804 4973 504 89 4361 5643 4268 458 80 2322 4843 3530 434 64 2027 57 564 1904 234 51 125 1584 213 21 1375
5、 192 18 974 184 11 831 124 7 续上表 pBR322/Hinf 174/Hinf 174/Hae 174/Tap 1631 726 140 1353 2914 517 713 118 1078 1175 506 553 100 872 404 396 500 82 603 327 344 417 66 310 231 298 413 48 281 141 221 311 42 87 220 249 40 54 154 200 24 194 33 151 20 72 二、常用缓冲液 1分子克隆常用缓冲液 TE( pH7.4) 10mmol/L Tris.Cl(pH7.4
6、) 1mmol/L EDTA(pH8.0) TE( pH7.6) 10mmol/L Tris.Cl(pH7.6) 1mmol/L EDTA(pH8.0) TE( pH8.0) 10mmol/L Tris.Cl(pH8.0) 1mmol/L EDTA(pH8.0) STE( 或称 TEN) 10mmol/L Tris. Cl( pH8.0) 1mmol/L EDTA(pH8.0) 0.1mol/L NaCl STET 10mmol/L Tris.Cl( pH8.0) 1mmol/L EDTA(pH8.0) 0.1mol/L NaCl 5%TritonX-100 TNT 10mmol/L Tris
7、.Cl( pH8.0) 150mmol/L NaCl 0.05%Tween20 2磷酸缓冲液 (1)25下0.1mol/L磷酸钾缓冲液的配制 pH 1mol/L K 2 HPO 4 (ml) 1mol/L KH 2 PO 4 (ml) 5.8 8.5 91.5 6.0 13.2 86.8 6.2 19.2 80.8 6.4 27.8 72.2 6.6 38.1 61.9 6.8 49.7 50.3 7.0 61.5 38.5 7.2 71.7 28.3 7.4 80.2 19.8 7.6 86.6 13.4 7.8 90.8 9.2 8.0 94.0 (2)25下0.1mol/L磷酸钠缓冲液的
8、配制 1mol/L Na 2 HPO 4 (ml) 1mol/L NaH 2 PO 4 (ml) 7.9 92.1 12.0 88.0 17.8 82.2 25.5 74.5 35.2 64.8 46.3 53.7 57.7 42.3 68.4 31.6 77.4 22.6 84.5 15.5 89.6 10.4 93.2 :用蒸馏水将混合的两种1mol/L贮存液稀释至1000ml,根据Henderson-Hasselbalch方程计算其pH值:pH=pK+1g(质子受体/质子供体) 在此,pK=6.86(25)。3电泳缓冲液 测序凝胶加样缓冲液 98%去离子甲酰胺 10mol/L EDTA(
9、pH8.0) 0.025%二甲苯青FF 0.025%溴酚蓝 甲酰胺:许多批号的试剂级甲酰胺,其纯度符合使用要求,无须再进行处理。不过,一旦略呈黄色,则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与Dowex XG 8 混合床树脂共同搅拌1小时进行去离子处理,并用Whatman 1号滤纸过滤2次,去离子甲酰胺分装成小份,充氮存于-70。常用的电泳缓冲液 缓冲液 使用液 浓贮存液(每升) Tris-乙酸(TAE) 1:0.04mol/L Tris-乙酸 50242g Tris碱 0.001mol/L EDTA 57.1ml冰乙酸 100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) Tris-磷酸(TPE) :0.
10、09mol/L Tris-磷酸 1010g Tris碱 0.002mol/L EDTA 15.5ml85%磷酸(1.679g/ml) 40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) Tris-硼酸(TBE) a 0.50.045mol/L Tris-硼酸 554g Tris碱 27.5硼酸 20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 碱性缓冲液 b 50mmol/L NaOH 5ml 10mol/L NaOH 1mmol/L EDTA 2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0) Tris-甘氨酸 c 25mmol/L Tris 15.1g Tris 250mmol/L 甘氨
11、酸 94g 苷氨酸(电泳级)(pH8.3) 0.1% SDS 50ml 10% SDS(电泳级) 说明:TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5溶液,出现沉淀后则予以废弃。以片都以1TBE作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小, 故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1TBE以提供足够的缓冲容量。碱性电泳缓冲液应现用现配。Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。2SDS凝胶加样缓冲液:100mmol/L TrisHCl(6.8
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