64位linux vasp安装文档格式.docx

1、基本分三个区/boot区（ext3），/区（ext3），swap区。这里直接下一步修改主机名（例如linux也可以不修改），这里我们是单机运行，所以没有配置网关和DNS。选择时区输入“root”密码这里我们选择Software Development ，如果前面没有注册的话，这里可能没有Virtualization这一项。如果你想选择你需要的软件的包，那就选择Customize now，我们选择Customize later这一项，一般按默认安装就已经能满足我们的需要。选择“Next”开始安装程序安装完成后，光盘弹出，重启系统。系统安装完成后，安装vasp需要以下的安装软件：编译器和数学库，我

2、们选择intel的，编译器和数学库是在一起的；fftw（傅里叶变换）；vasp库和vasp源代码；vasp所需的赝势库；mpi并行包。这些软件放在指定的目录里：/home/film/yanghua/。在这个目录下，分别建立四个文件夹ifort，fftw，mpich2，vasp，将这些软件对应放入各自的文件夹。二 安装intel编译器和数学库首先进入压缩包所放的目录/home/film/yanghua/ifort （目录可以更改）下，在此目录下打开一个终端，输入命令：解压 tar zxvf l_fcompxe_intel64_2011.4.191.tgz进入安装包 cd l_fcompxe_in

3、tel64_2011.4.191安装 ./install.sh 回车选择 1 view the license agreement一直敲空格读完输入： accept 回车选择 3 alternative activation*necessary选择 2 use a licensefile输入 ifc.lic 文件所在的全路径，到文件。选 1，选1，回车= OK设置环境变量，输入如下命令：vi /.bashrc出现下面一个文本，按字母I进入插入模式，加入以下两行后：export PATH=/opt/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/:$PATHexp

4、ort LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/composerxe-2011.4.191/mkl/lib/ intel64/:$ LD_LIBRARY_PATH按 esc建退出插入模式，输入：“：wq”回车保存。输入命令: source /.bashrc 永久保存。在终端输入：which ifort 出现/opt/intel/composerxe-2011.4.191/bin/ intel64/ifort，或者输入：ifort -V出现版本的相应信息，说明编译器安装成功。三 安装fftw-3.1.2事先将安装包放在指定目录/home/film/yanghua/fftw（目录可以

5、更改）下，进入后打开终端，输入以下命令进行安装：解压 tar -zxvf fftw-3.1.2.tar.gz进入安装包 cd fftw-3.1.2检查环境并指定安装目录./configure -prefix=/home/film/soft/fftw GCC=ifort F77=ifort -enable-mpi，安装路径可以更改。进行编译 make编译安装 make install all到此，fftw-3.1.2安装成功。四 安装VASP库进入事先指定的目录/home/film/yanghua/vasp （目录可以更改）下，进入后打开终端，输入以下命令进行安装：解压tar -zxvf vas

6、p.5.lib.tar.gz进入安装包 cd vasp.5.lib显示安装包中文件 ls更改文件名字 cp make.linux_ifort_P4 makefile新生成makefile，打开进行修改，将FC=ifc修改为FC=ifort，保存退出。进行编译 make。五 VASP 串行编译进入指定目录/home/film/yanghua/vasp（目录可以更改）下，进入后打开终端，输入以下命令进行安装：解压tar -zxvf vasp.5.2.tar.gz进入安装包 cd tar -zxvf vasp.5.2将/home/film/yanghua/fftw-3.1.2/api/fftw3.f

7、 拷贝到解压后的VASP安装源代码文件夹下（/home/film/yanghua/vasp/vasp.5.2）。修改makefile文件。如下所示，如何更改见红色标记。# all CPP processed fortran files have the extension .f90SUFFIX=.f90#-# fortran compiler and linkerFC=ifort# fortran linkerFCL=$（FC）# mkl.10.0# set -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV in the CPP lines#BLAS=-L/opt/intel/mkl

8、100/lib/em64t -lmkl -lpthreadBLAS=-L/opt/intel/composerxe-2011.4.191/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_core -lmkl_sequential -lpthread# even faster for VASP Kazushige Gotos BLAS# http:/www.cs.utexas.edu/users/kgoto/signup_first.html# parallel goto version requires sometimes -libverbs#BLAS= /opt

9、/libs/libgoto/libgoto.so# LAPACK, simplest use vasp.5.lib/lapack_double#LAPACK= ./vasp.5.lib/lapack_double.o# use the mkl Intel lapackLAPACK=-L/opt/intel/composerxe-2011.4.191/mkl/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_core -lmkl_sequential -lpthread# fft libraries:# VASP.5.2 can use fftw.3.1.X （http:/w

10、ww.fftw.org）# since this version is faster on P4 machines, we recommend to use it#FFT3D = fft3dfurth.o fft3dlib.o# alternatively: fftw.3.1.X is slighly faster and should be used if availableFFT3D = fftw3d.o fft3dlib.o /home/film/soft/fftw/lib/libfftw3.a然后保存退出，输入命令 ：make。make之后会在文件夹/home/film/yanghua

11、/vasp/vasp.5.2生成一个二进制文件vasp。将vasp二进制文件复制到/bin/输入 cp vasp /bin/（在超级用户下完成）。六 MPI（mpich2-1.0.8）安装进入进入指定目录/home/film/yanghua/mpich2（目录可以更改）下，进入后打开终端，输入以下命令进行安装：解压 tar -zxvf mpich2-1.0.8.tar.gz进入安装包 cd mpich2-1.0.8输入命令 export F90=ifort FC=ifort检查环境指定目录 ./configure -prefix=/home/film/soft/mpich2/ -enable-

12、f90 -enable-f77修改环境变量 vi /.bashrc，加入以下两句export PATH=/home/film/soft/mpich2/bin/:export LD_LIBRARY_PATH=/home/soft/mpich2/lib/:$LD_LIBRARY_PATHulimit -s unlimited保存 source /.bashrc。输入 mpd &之后会出现这样的提示：configuration file /shared/home/kwanous/.mpd.conf not foundA file named .mpd.conf file must be presen

13、t in the users homedirectory （/etc/mpd.conf if root） with read and write accessonly for the user, and must contain at least a line with:MPD_SECRETWORD=One way to safely create this file is to do the following: cd $HOME touch .mpd.conf chmod 600 .mpd.confand then use an editor to insert a line like MPD_SECRETWORD=mr45-j9zinto the file. （Of course use some other secret word than mr45-j9z.）就按提示操作，输入命令：cd $HOMEto