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根系分析使用说明书文档格式.docx

1、 在样品标记窗口点击确定后,ECA-GX01软件开始分析并显示一个进展条,通过键盘 上的S键分析会停止。分析结束后,点击创建文件(如果鉴定人和操作者在以前保存过数据者此步骤不出现),这时会显示一个窗口,提示保存数据的文件名称,输入名称后保存完成。此时在软件的左侧命令区域同时也会出现测量结果;(Len:根长;SA:跟表面积;VOL:总根体积;PA:总根投影面积;AVGD:跟平均直径)现在您可以看到分析区域上方出现的根系分布图和根系骨架,它指示根系各个部分被测量和他们所属的直径类型;这个时候整个的分析过程结束; 命令区域说明命令区域是为了接受命令和显示信息。1、为获取图标,表示获取图片的方式,在“

2、I图像”点击起始来修改;2、工作模式选择。从上到下分别为:图片编辑、相互式测量和自动分析。图片编辑模式中有可见的图标从上到下分别为:小刷子、中刷子、大刷子和套索工具。黑色、白色、黄色。通过在图像中点击转换,灰色能改变成任何颜色。在放大的因子下面显示选择的颜色。3、区域形态选择。选择分析区域中的根系;矩形区域设置、圆形区域设置、自由选取区域设置。4、图像选择器是去选择展示的图像,从上到下分别为:初始图像、像素分类图像和框架图像。像素分类图像和框架图像内容仅仅在分析之后显示。5、在软件的左下角这些图标的作用为:点击大Z按钮为放大图像,点击小z按钮为缩小图像;这个图标为放大缩小因子,放大因子直接运行

3、到放大或缩小到另一个,点击按钮从隐藏出现的菜单选择需要的放大缩小值;这个图标的作用是隐藏或显示图表区域; 测量数据说明缩写 测量参数L 总根长LT-L Tennant统计方法和益康农非统计方法差异的百分比SA 总根表面积PA 总根投影面积V 总根体积AD 根平均直径n Links 连接数VS 土壤体积NTips 总根尖数(活+死+老)Forks 分枝数Cross 交叉数Diam mm 点击位置的根直径 Kink# 鼠标点击区域最近的连接数 软件使用问题说明一、建立区域 1、当ECA-GX01软件在自动分析模式时,分析和排除区能创建不同时刻的分析(这个图标为黄色时候表示为自动分析模式)。软件自动

4、进入这个模式:1)获取图像之后;2)激活分析/取消分析/重新启动分析;3)当软件启动时,在你激活区域定义排除区之后,一个排除区可能被建立。下面三段描述了如何去建立不同形状的区域。1-1 长方形图像区1.在命令区点击长方形区域形状选择器(黄色表示启动);2.安放鼠标点确定键来固定长方形的一个边;3.按下鼠标压住拉动;4.向对角线相反的方向拖动鼠标;5.松开鼠标按钮;1-2 圆形图像区 1.在命令区点击圆形形状选择器(黄色表示启动);2.安放鼠标点确定键来固定圆心的中心;4.按键盘上下键调整圆的边界直到扩大或缩小到需要的周长;1-3 自由形态图像区1.在命令区点击圆形形状选择器(黄色表示启动);2

5、.安放鼠标确定区域中一点的位置;3.压住移动鼠标勾勒出区域的边缘(必须把定点和最后的点重合);4.松开鼠标按钮;2、活动区的概念 当多个区存在于同一个图像时其中一个区域都属于一个活动区。活动区的框架用连续的绿色线标记,不活跃区的边界用带点的绿色线标记。激活一个区直接用鼠标在区域上点击即可选择这个区域。3、区域调整大小 一个活动分析区在创建感觉这个区域大或小需要进行调整时,把鼠标放置到这个区域的边界处移动鼠标直到指针变成双向箭头指示时,点击鼠标并压住按钮,移动鼠标到需要的位置,松开后区域就被重新选择并测量。二、工作模式ECA-GX01软件有三种工作模式:1)图片编辑;2)交互式测量;3自动分析;

6、这些模式如下所述通过在命令区点击它相应的工作模式选择器激活。1-1图像编辑模式 图像编辑模式允许您去修改或改进图片内容或增加根系去分析。1-2交互式测量模式 交互式测量模式时为了通过软件改进连接高级分析模式。1-3自动分析模式 去分析一个图像或创建一个分析区这个模式一定要是活动的。软件自动进入这个模式1)获取图像2)激活分析/取消分析/重新分析3)启动分析。手动进入分析模式需要在命令区点击分析模式图标;2、分析前的图像编辑 分析之前图像编辑如果需要完成的,那么调整初始图像会影像进一步的分析(形态、连接、分形、根尖、分枝数、交叉数等),这是因为所有用ECA-GX01软件分析的图像来源于初始图像。

7、下面我们来解释下如何移动与根系接触的种子。种子将被北京颜色所替代。2-1首先你必须选择你想要编辑的颜色,此功能里有三种预置颜色从上到下分别是黑、白、红,您也可以定义自己的颜色。软件处于图像编辑模式时,命令区铅笔颜色工具是可见的。它允许去选择颜色,图像编辑进行后操作的像素将被这个颜色所代替。2-2 预置的白色背景亮对分析物的编辑容易被看到,所以用白色和黑色编辑图像对分析有负面的影像,因为修改后会出现痕迹,软件很难区分根系和背景的像素点,这样做许多根系可能在分析中丢失。我们的建议是不去修改原始图或用和原始图背景相似的颜色,这样结果会更加的精准。2-3 选择图像的背景色:用红色铅笔工具。压住shif

8、t键,在您需要的颜色区域点击背景。颜色出现在命令区域的左小角,用这个颜色区去编辑图像。2-4 通过用圆刷子或一个套索工具在图像上画来实现图像编辑。首先必须点击命令区三个大小不同的铅笔选择器中的一个或自由套索工具,然后在图像上去画,移动鼠标到想要编辑的地方,点击鼠标按住按钮,这时候刷子覆盖的像素点被选择的颜色填充。当所有希望更改的像素都改变时松开鼠标。当用套索工作去画时候,首先在命令区点击它的图标并通过画出区域的轮廓来编辑图像。移动鼠标到区域的末端,点击鼠标按钮按住后拖动鼠标包围的更改区域,当松动按钮时区域被所选择的颜色填充。3、分析后的图像编辑 图像编辑完成,这个更改仅对形态分析完成,但不会影

9、像其它分析,在下面的例子中我们手动添加根到分析中3-1 分析中的图像有些会有失掉的根系,点击图像编辑工作模式同根系大小的铅笔盒色彩选择器,这次只能用刷子而不能用套索工具来编辑。只能选择同当前失掉根系大小相似的铅笔,因为根系需要被增加到上面所选择的根系直接类中。颜色的选择同上述图像编辑一样。3-2 移动鼠标到需要编辑的地方,点击鼠标按住按钮,当鼠标移动到丢失的根上面时,像素被带颜色的刷子覆盖住,当根系被完全覆盖时松开鼠标。3-3 在图像上画跟段,它不会增加分析数据知道你点击主窗口的任意地方。在这段时间中可以把所有丢掉的根系补充完整,然后点击主窗口,分析更新。从那一刻起画笔将不能使用。保存数据分析

10、行表头翻译序号英文内容中文翻译1ImgType-PxsizeH-PxSizeV图像类型2AnalysedRgn整个图像被分析3Left-Top-right-Bottom图像分析区的长方形边界4NExclusions被操作者交互式定义的排除区数目5CalibMethod扫描本来的校准方法6Pxclassif颜色分类7Filters滤镜8Fractal-PxMin-Max分形分析9SoilVol输入样本标识的土壤体积10Length总根长11LengthTen用Tennant方法测定总根长12ProjArea总投影面积13ProjAeraTen用Tennant方法测定投影面积14SurfArea总

11、根表面积15SurfAreaTen用Tennant方法测定总根表面积16AvgDiam平均根系直径17AvgDiamTen用Tennant方法测定平均根系直径18LenPerVol单位平方米土壤总根长19LenPerVolume用Tennant方法测定单位平方米土壤总根长20RootVolume总根体积21FractalDimension分形维数22FractalDeviation分形偏差23Tips根尖数24Forks分枝数25Crossings交叉数26Noflinks链接数27Altitude根系系统高度28ExternalPathLength根系系统扩展路径长度29LinkAvglen

12、gth所有链接平均根长30LinkAvgProjAera所有链接平均投影面积31LinkAvgSurfArea所有链接平均表面积32LinkAvgDiam所有链接平均直径33LinkAvgBrAngle所有链接平均分枝角度34NumberOfClasses根系分布图表类数目35AA。L=BB直径在AA和BB之间的根长36BB。L=CC直径在BB和CC之间的根长。YY。L=ZZ直径在YY和ZZ之间的根长SA=BB直径在AA和BB之间的根表面积SA=ZZ直径在YY和ZZ之间的根表面积PA=BB直径在AA和BB之间的投影面积PA=ZZ直径在YY和ZZ之间的根投影面积V=BB直径在AA和BB之间的根体积

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