如何使用pubmed进行-文献检索PPT推荐.ppt

1、,一、PubMed简介,很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间，却不愿花上几个小时去认真研究一下PubMed。君欲善其事，必先利其器，PubMed就好像一把功能强大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹，更重要的是，你要知道如何利用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到及至。,一、PubMed简介,3.Pubmed的特点收录生物医学权威期刊最多 世界上70多个国家的7000多种权威期刊多种检索方法，多条检索途径时效性极强（每周更新）回溯年代久远（1948年至今）利用MeSH作为转换词表，标引质量高部分文献可以免费获取全文检全率、检准率高,一、PubMed简介,Publisher

2、 supplied citations（出版商提供的书目信息）,PreMedline,MEDLINE,与NCBI其它数据库的链接,4.PubMed的数据收录范围,一、PubMed简介,4.1 MEDLINE基本情况出版：美国国家医学图书馆（National Library of Medicine,NLM）。印刷版 1879联机版 1971光盘版 1983网络版 1997,MEDLINE数据库简介,收录范围：收录7538种（2009.10.11）权威期刊，包含50种语言，涉及70多个国家（其中中国48种），约40万篇/年，已经累计2100余万篇。内容涉及生物医学各个领域；85%原文为英语。回溯年

3、代：1948年至今每条记录标有indexed for MEDLIEN标记,学科范围：基础生命科学 临床生命科学 生物科学 解剖学组织学 化学与药物心理学 社会医学农业 医技设备学 医技工业学 医学信息学使用词表：MeSH（医学主题词表）,MEDLINE数据库简介,4.2 PreMEDLINE,是一种由正在加工处理中的文献记录组成的数据库，这些新记录还未被标引，暂时存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新，经过标引（增加主题词、文献类型、数据库存取号等字段）以后转入Medline，一旦记录被转入到Medline数据库，就被从PreMEDLINE数据库中删除。每条记录标有in Process标

4、记。,Pre-Medline最新信息,Medline,New Data,Collect,PubMed,Process,一周以后,（出版商提供的书目信息）出版商直接向PubMed提供的非Medline收录的电子刊物，如：Science或Nature中的地质学文献等。每条记录标有 as supplied by publishers标记。,4.3 Publisher-Supplied Citation,PubMed-indexed for MEDLINE,PubMed-as supplied by publisher,PubMed-in process,PubMed与MEDLINE的区别,4.4与N

5、CBI其它数据库的链接,Nucleotide：DNA序列数据库Protein：蛋白质序列数据库Genome：基因组序列数据库Structure：分子结构模型数据库OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库PMC:PubMed中心，免费全文期刊检索,与NCBI其它42个数据库的链接,页面介绍,PubMed主页 http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,高级检索入口,基本检索输入框,个人空间,检索指南,检索工具：特定文献检索临床咨询专题咨询,其他资源：主题词数据库期刊数据库临床试验等,Pubmed简介,二、检索规则及检索技术,检索规则,1、自动转换匹配 PubMed具有对检索词

6、的自动转换匹配功能。对于输入检索框的检索词，PubMed按4个转换表进行对照、匹配和转换，然后进行检索。MeSH表：包括MeSH的主题词、副主题词、款目词。期刊刊名表：所收录的刊名全称、缩写和ISSN短语表：文献篇名或文摘中出现的短语。著者索引表：PubMed所收录的的作者姓名组成。,1、自动转换匹配,如果在4个词表的任何一个中找到匹配的内容，则匹配结束。例如：如果输入的检索词在主题词转换表中找到与其相匹配的主题词，则使用该主题词进行检索并结束匹配，不会在其他词表中进行匹配。,检索规则,1、自动转换匹配,检索规则,如果输入的单个词在4个词表中都未找到匹配的内容，其将被在All fields中进

7、行检索；如果输入的词组未找到匹配的内容，该词组将被拆成单词并分别对其进行匹配后将匹配结果以AND连接。输入的检索词被自动匹配后的具体检索式可通过检索结果页面右侧的Search details栏中查看。,如：renal failure renal insufficiencyMeSH Terms OR（renalAll Fields AND insufficiencyAll Fields）OR renal insufficiencyAll Fields OR（renalAll Fields AND failure,结果显示页右侧Details显示系统自动匹配转换的检索词,检索规则,2、短语检索：如

8、果在短语上加双引号，PubMed将不执行自动转换功能，也不进行MeSH词的扩检。例：“lung cancer”,常用的检索技术,1.布尔检索,1.布尔检索,2.截词检索（又称通配符检索）,2.截词检索,3.字段限制检索,Pubmed常用字段,文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期,常用字段标识符,电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释基金编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号期刊

9、全称,最后修订日期规范词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号,作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式（纸张或电子）参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号,4.扩展检索,5.加权检索（主要用于Mesh主题词检索）,加权检索的基本方法是：在每个提问词后面给定

10、一个数值表示其重要程度，这个数值称为权，在检索时，先查找这些检索词在数据库记录中是否存在，然后计算存在的检索词的权值总和。权值之和达到或超过预先给定的阈值，该记录即为命中记录。加权检索的侧重点于判定检索词或字符串在满足检索逻辑后对文献命中与否的影响程度。运用加权检索可以命中核心概念文献，因此它是一种缩小检索范围提高检准率的有效方法。,三、检索方式与途径,1、基本检索 2、高级检索3、主题词检索4、期刊检索5、题录检索6、临床咨询7、临床试验,在检索栏中输入:一个或多个检索词（系统默认空格为AND检索）例：aloe psoriasis（芦荟治疗牛皮癣的文献）,1、基本检索,1.1 自由词检索,对

11、于输入PubMed的多词词组，PubMed会查询词组索引，如果查到相应词组则将其作为一个检索词来检索。如果未查到相应词组，则将其拆分成单个词，分别进行检索并以逻辑和（AND）进行组配。,1、基本检索,1.2 词组检索,如：single cell相当于检索single AND cell。可通过如下方式强制将其作为一个词组进行检索：1.加双引号：“single cell”2.加标段标识tw:single celltw 3.使用短横线“-”将两词连接起来：single-cell 4.使用截词符*：single cell*,1、基本检索,1.2 词组检索,1、基本检索,1.3 字段限制检索,常用字段标

12、识符,AffiliationAD：第一作者所属单位和地址AuthorAU：作者姓名LanguageLA：原文语种 chinese la 或 chi la（前3个字母）MeSH TermsMH：主题词 自动扩展下位主题词；如需关闭该功能，使mh:noexp MeSH SubheadingsSH：副主题词 自动扩展下位副主题词；如需关闭该功能，使用 sh:noexp,常用字段标识符,Publication DateDP：出版时间 1998/03dp;1998dp;1996:1998/01:1998/04 dpPublication TypePT：出版类型 reviewptTitleTI：文章题名T

13、ext WordsTW：文本词 包括Title,Abstract,MeSH Terms,MeSH Subheadings,Chemical Substance Names,Personal Name as Subject 等字段Title/AbstractTIAB：题名摘要刊名:SourceSO、JournalJour、Journal Title AbbreviationTA,1、基本检索,1.3 字段限制检索（标题、语种）,在检索栏中输入:liver cancerti AND chinesela,1、基本检索,1.3 字段限制检索（刊名）,在检索栏中输入:刊名输全称或MEDLINE认可的标准

14、缩写形式,so 例：JAMA so,1、基本检索,在检索栏中输入:刊名输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式,jour 例：JAMA jour,1.3 字段限制检索（刊名）,1、基本检索,1.3 字段限制检索（刊名）,在检索栏中输入:刊名输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式,ta 例：JAMA ta,1、基本检索,1.4 著者检索,作者书写格式西方人姓名书写格式：First name、Middle Name、Last name。如：美国肯尼迪总统名为：John Frank Kenedy，Kenedy为Last name（姓）。Frank为Middle name，比较少看到，多看到 Joh