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RNA提取方法步骤

实验前:

离心机预冷(4℃)。

锡箔纸包着的干烤过的研钵和杵。

实验主要在铺着报纸的桌上进行,不要在空调口等空气流动很快的地方。

操作要求戴口罩,手套要求新的,枪头,EP管全部无酶。

实验原理:

细胞内的大部分RNA是以核蛋白复合体的形式存在。

trizol含有异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体解离,即分离RNA和与之结合的蛋白质,并将RNA释放到溶液中。

当加入氯仿的时候,它可抽提酸性苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可以形成水相层和有机层。

其中水相层在上,有机层在下,中间层是DNA和蛋白质。

就是说会有三层,而RNA在水相层内,即上层中。

异丙醇的作用是沉淀RNA。

乙醇的作用是洗掉异丙醇。

一、从组织中提取总RNA

1)液氮研磨(磨的时候小心组织样品飞掉,如果飞掉,我们一般是用镊子夹回来的),组织块直接放入研钵中,加入少量液氮,迅速研磨,待组织变软(最好不要等组织变软(实际证明软一次没关系。

乘它软的时候,把它压薄,然后加液氮后变硬很容易研磨,其实加液氮不仅防止RNA降解而且更利于研磨),变软后RNA容易降解,若液氮挥发完要迅速补充液氮,一直让样品保持冻着的状态。

研磨这步很重要,研磨既要充分又不能让RNA降解),再加少量液氮,再研磨,如此三次(肯定超过三次的),按50-100mg组织/mlTrizol加入Trizol(一般1000ml,加Trizol前聚组织于一堆,这样方便吸),转入离心管进行第2步操作。

2)匀浆(组织用研钵研磨时要研磨充分,之后就不需要再匀浆了。

):

组织样品按50-100mg/mlTrizol加入Trizol。

另外,组织体积不能超过Trizol体积的10%,否则匀浆效果会不好,用电动匀浆器充分匀浆约需1-2分钟。

二、从细胞中提取总RNA

1)培养贴壁细胞:

不须消化,可直接用Trizol进行消化、裂解,Trizol体积按10cm2/ml比例加入。

2)悬浮细胞可直接收集、裂解,每1mlTrizol可裂解5×106动物、植物或酵母细胞,或107细菌细胞。

三、操作步骤

1、细胞或组织加Trizol后,室温放置10min(一般会超过这个时间,因为液氮冷冻掉了),使其充分裂解,然后吸入1.5ml无酶的Ep中

注:

天热需在冰上放置,此时可放入-80℃长期保持。

2、12,000rpm离心5min,弃沉淀。

注:

提取细胞RNA时,此步骤可以省略。

(我们是省略的)

3、按200ul氯仿/mlTrizol加入氯仿,剧烈振荡30s(这步混匀一定要充分,可适当增加混匀时间,是否混匀充分对蛋白质去除效果影响很大,这是个关键步骤),室温放置15min(5min)。

注:

需要时可在冰上放置,禁用漩涡振荡器,以免基因组DNA断裂。

4、4℃12,000g离心15min。

5、吸上清于另一个Ep管中,重复步骤3和4一次(注意加氯仿后吹打混匀)。

(为了尽量去掉蛋白质,得到高质量的RNA,要至少再重复一次氯仿抽提的步骤,如果组织中的蛋白含量比较多,就要再多抽提几次。

6、吸取上层水相,至另一离心管中。

注:

千万不要吸取中间界面(宁愿少吸一点上清液也不能吸到中间层,其实RNA有一点就够用了,做这步时切忌不要贪心。

);若同时提取DNA和蛋白质,则保留下层酚相存于4℃冰箱,若只提RNA,则弃下层酚相。

7、按0.5ml异丙醇/mlTrizol加入异丙醇混匀(加入与所吸上清液等体积的异丙醇,一般为500ul),室温放置5-10min(-20℃,30min以上,所以做到这步可以先吃饭)。

注:

RNA量过少可以在-20℃放置过夜。

8、4℃12,000g离心10min(15-20mim),弃上清,RNA沉于管底。

9、按1ml75%乙醇/mlTrizol加入75%乙醇,温和振荡离心管,悬浮沉淀。

10、4℃8,000g离心5min,尽量弃上清。

注:

应用枪尽量吸干净,减少干燥时间。

11、室温晾干或真空干燥5-10min(倒扣于滤纸上,EP管的盖子打开)。

注:

RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。

12、可用10-30ul(我们用的是10ul)的DEPC水溶解沉淀,由RNA沉淀的量决定(注意吹打混匀)。

13、测O.D值(按19ulDEPC水和1ul的RNA溶液稀释测OD值,注意测的时候吹打混匀,12中的RNA-80℃保存,13中的稀释液测完后弃掉)

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