卫生部全国细菌耐药监测网上传数据标准.docx

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卫生部全国细菌耐药监测网上传数据标准

全国细菌耐药监测网信息系统

数据上报标准V5.2

（此文档最后修改于2014年4月14日）

全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统”收集所有成员单位的耐药监测数据，系统具备完善的数据筛选和容错处理功能，系统所支持上传的数据文件格式为WHONET5.6软件所导出的通用数据文件格式，但后缀必需为“.dbf”。

除此以外，系统还支持Excel表格，包括Excel2003以下版本生成的（*.xls）以及Excel2007/2010所生成的*.xlsx。

一、科室代码设置

监测网成员单位首次登录时须先使用【本院科室管理】功能，登记注册医院临床科室并将其映射至系统所要求的标准科室分类上，该映射关系可随着本院的科室变化随时进行调整（增加、删除、修改），调整之后不影响曾经上传过的文件，仅影响在调整时间点后上传的数据。

而各医院临床科室对应上报数据文件中的WARD字段保存的值，可以是本院临床科室名称也可以是本院的临床科室代码，取决于各院在WHONET中是如何管理的，或者是如何从LIS系统导出的。

完成医院科室设置后，在上传本院数据时，系统会自动将已经设置好的本院科室信息与系统标准的科室分类进行映射，并将映射结果直接写入DEPARTMENT字段，不影响WARD字段中上传的原始值，也就是说，DEPARTMENT字段实际上可以不填写，甚至是整列都不存在。

其实，更好的做法是在上报的数据文件中直接将DEPARTMENT字段设置成系统内置的标准科室代码（3位字符）。

二、数据文件各字段要求

1、来源ORIGIN

非必填字段，最长1个字符。

若填写，则其必须为“h”，若不填写，数据上传后系统会自动补充，若填写值不为“h”，系统将自动替换成“h”。

2、国家COUNTRY_A

非必填字段，最长3个字符。

若填写，则其必须为“CHN”，若未填写，数据上传后系统会自动补充。

3、医院INSTITUT

非必填字段，为卫生部统一分配的标准代码，标准6字符，前两位为国家标准省级代码（如北京为11，福建为35等），后4位为各省编码（从0001开始），例如福建省立医院为350001，若未填写，数据上传后系统自动补充已注册的医院标准代码，若填写则必须与本院的代码一致，否则系统会自动替换为正确代码，在数据上传时此字段不建议填值。

4、实验室LABORATORY

非必填字段，最长3个字符。

系统不再将此作为医院标识，无具体格式要求，只要不超长，系统均可接受。

5、病历号PATIENT_ID

对于门诊病历不要求必须填写，对于住院病历要求必须填写，并且填写总量至少占住院病历数据量的95%，否则会导致整个数据文件系统无法接收，该字段最长16个字符。

6、姓氏LAST_NAME、名字FIRST_NAME、姓名FULL_NAME

系统原则上要求FULL_NAME必填，如果未填写系统可根据LAST_NAME和FIRST_NAME自动推算FULL_NAME的值。

因此请根据本院实际情况填写如上三个字段中的任意一个字段即可，如果考虑到本院病人隐私问题，可将病人姓名加密，只要不超长，系统依然可以正常接收。

以上三个字段的长度要求分别为：

LAST_NAME（30字）、FIRST_NAME（20字）、FULL_NAME（50字）。

7、性别SEX

此字段要求必填，最长1个字，WHONET要求只能填写“f”或者“m”，系统提供了相关的容错处理机制，允许填写“男”和“女”，系统会自动将“男”替换成“m”，将“女”替换成“f”。

8、年龄字段AGE

此字段要求必填，最长3个字符。

（1）不带任何后缀的1~3位整数或者2位数字+"y"后缀，代表年龄是按岁计算。

（2）2位数字+"d"即代表年龄按天计算。

（3）2位数字+"w"即代表年龄按周计算。

（4）2位数字+"m"即代表年龄按月计算。

（5）空值或其它字符，系统会认为是非法值，需补充修改后才能上报。

9、年龄类别PAT_TYPE

非必填字段，系统会根据年龄AGE自动生成，即使是数据中已经填写了该值系统也会强制替换，因此，该字段可以不填，若要填写，长度必须为3位字符，且要符合系统的计算规则，具体计算规则如下：

1）当AGE后缀为“d”代表“天”时：

A.<=28d，生成“new”代表“新生儿”；

B.>28d，生成“ped”代表“儿童”；

2）当AGE后缀为“w”代表“周”时：

A.<=4w，生成“new”代表“新生儿”；

B.>4w，生成“ped”代表“儿童”；

3）当AGE后缀为“m”代表“月”时：

A.0m，系统无法识别，需修正后才能上报；

A.>=1m，生成“ped”代表“儿童”；

4）当AGE为纯数字，代表“岁”时：

B.0或者0y，系统无法识别，需修正后才能上报；

C.>=1或者>=1y并且<=14或者<=14y，生成“ped”代表“儿童”；

D.>=15或者>=15y并且<=65或者<=65y，生成“adu”代表“成人”；

E.>65或者>65y，生成“ger”代表“老年”。

10、科室（送检科室）WARD

为必填项，最大长度为15字，中英文不限，此字段所填写的值应该对应为本院科室维护模块中所录入的信息，可以是本院科室代码也可以是本院科室名称，而填写的值不在本院科室列表中时，系统会认为该值为非法值，需要修改之后再上传。

11、科室类别WARD_TYPE

为非必填项，最大长度为3个字。

如果不填写，系统不进行校验，如果填写，则必须与WHONET内置的代码要求一致，见附表1。

12、专业类别DEPARTMENT

为100%必填项，最大长度为3个英文字符，此字段所填写的值，必须为系统所规定的标准专业类别代码，见附表2。

未在该附表中的值为非法值，无法通过系统校验。

系统提供了容错处理，可直接通过WARD字段自动推算此列的值。

因此，此字段其实可以不填写。

13、标本类型英文代码SPEC_TYPE

本字段为必填项，最低校验通过率为100%，要求100%必填，不能为空白，否则将导致整个文件校验失败，系统拒绝接收！

系统只接受WHONET标准【标本字典】中的英文代码，见附表3。

意外情况：

如果本字段所填写值，与从【SPEC_CODE】字段所推算出来的值不匹配，则同样会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收，必须改正之后才可以重新上传，且不仅仅是影响单列通过率的问题！

例如：

痰标本的英文代码为“sp”，数字代码应该对应为“3”，如果填写了其它数字代码，会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收，必须改正之后才可以重新上传！

14、数字代码SPEC_CODE

本字段为必填项，最低校验通过率为100%，要求100%必填，不能空，否则将导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收！

校验规则如下：

系统只接WHONET标准【标本字典】中的数字代码，具体请参照或者下载《全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准》文档中的《附表3：

SPEC_TYPE与SPEC_CODE对照字典》中的【SPEC_CODE】列。

除此以外的值，均为非法值，如果有一项填写错误，将导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收！

意外情况：

如果本字段所填写值，与从【SPEC_TYPE】字段所推算出来的值不匹配，则同样会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收，必须改正之后才可以重新上传！

例如：

容错处理：

如果本字段未填写值，则系统会自动从【SPEC_TYPE】字段推算出本列的值，并且会给出警告提示，这不影响通过率，但这会影响高质量数据占比。

15、关于标本字段的其它规则

如果标本代码的确没有在系统所给出的字典库中列中，可以将SPEC_TYPE填写为“ot”将SPEC_CODE填写为“89”，代表“其它”。

如果出现了SPEC_TYPE与SPEC_CODE两者都填写了值，但两值并不匹配的情况，例如：

痰标本的英文代码为“sp”，数字代码应该对应为“3”，如果填写了其它数字代码，系统会给出提示，要求修正不匹配的数据后再次上传。

超出附表（3）内的标本类型系统视为非法值，需修正后才能上报数据。

另外，当标本类型为质控标本（即SPEC_TYPE为qc并且SPEC_CODE为75或者SPEC_TYPE为ex并且SPEC_CODE为99）时系统会忽略这些数据，并给出提示并自动忽略该条数据。

14、标本编号SPEC_NUM字段

100%必填字段，最大长度30字。

15、检验结果（细菌）ORGANISM

100%必填字段，标准3位英文字符代码，此代码为WHONET5.6标准细菌代码；注意！

系统仅接收革兰阳性菌与革兰阴性菌，见附表（4），不接受真菌，支原体，厌氧菌和分枝杆菌等。

当发现在附表（4）所规定的标准代码外的数据时，系统会给出提示并自动忽略该条数据。

16、细菌类别ORG_TYPE

系统仅接受革兰阳性菌“+”和革兰阴性菌代码“-”，最大允许1字符，此字段可不填写。

当系统发现未填写时会自动根据ORGANISM字段的值推导出来，当系统发现本字段中填写的值与系统所推导的合法值不匹配的时候，会自动将其替换成合法值。

17、β-内酰胺酶BETA_LACT

非必填字段，1字符，且值仅能为“+”或“-”，若填写为“n”、“ne”、“neg”、“negative”或者中文全角“－”，系统会自动将其修正为半角英文“-”，若填写为“p”、“po”、“pos”、“positive”或者中文全角“＋”，系统会自动将其修正为半角英文“+”。

18、超广谱β-内酰胺酶ESBL

规则同上。

19、耐甲氧西林葡萄球菌检测试验MRSA_SCRN

规则同上。

20、诱导型克林霉素耐药试验INDUC_CLI

规则同上。

21、霍奇试验HODGE

非必需字段，规则同上。

22、碳青酶烯酶CARBAPENEM

规则同上。

23、送检日期（标本日期）SPEC_DATE

本字段为必填项，最低校验通过率为100%！

系统只接收特定的日期格式，例如2014年11月5日可以有如的表示方式：

20141105（长度必须为8位）

20141105或者2014115

2014-11-05或者2014-11-5

2014/11/05或者2014/11/5

2014年11月05日或者2014年11月5日

Nov052014，其中Nov为英文的11月简写

Nov-05-2014，其中Nov为英文的11月简写

Nov/05/2014，其中Nov为英文的11月简写

05Nov2014，其中Nov为英文的11月简写

05-Nov-2014，其中Nov为英文的11月简写

05/Nov/2014，其中Nov为英文的11月简写

201405Nov，其中Nov为英文的11月简写

2014-05-Nov，其中Nov为英文的11月简写

2014/05/Nov，其中Nov为英文的11月简写

2014Nov05，其中Nov为英文的11月简写

2014-Nov-05，其中Nov为英文的11月简写

2014/Nov/05，其中Nov为英文的11月简写

错误的日期格式举例：

2014115中间没有任何分隔符，并且长度不为8位，系统将无法识别。

英文月份的简写请参照下表：

月份

英文代码

月份

英文代码

Jan

Jul

Feb

Aug

Mar

Sep

Apr

Oct

May

Nov

Jun

Dec

24、报告日期（数据录入日期）DATE_DATA

为非必填字段，规则同上。

25、抗生素

所有抗生素代码采用Whonet5.6标准代码。

抗生素代码见附表（5）。

纸片法（K-b法）：

填写结果只能为6至80之间的整数，否则视为填写错误，系统会将该值忽略，这会影响该列的通过率。

对应的字段名应为：

抗生素英文代码+“_ND”+抗生素含量，例如：

AMK_ND30、AMX_ND25。

切记：

不能为（S、I、R）、不能有小数、不能带任何符号（.><=等等）。

MIC法：

对于除高浓度庆大霉素和高浓度链霉素以外的MIC法字段，系统要求只能为小数或者1、2、4、8、16、32、64、128、256、512，不在这些数字范围内的，均为非法值。

可以有前导【>、<、=】符号。

合法情况举例：

等于纯整数数字或者小数数字：

4、4.0；大于或者大于等于上述两类数字：

>4、>=4、>4.0、>=4.0；小于或者小于等于上述两类数字：

<4、<=4、<4.0、<=4.0；对应的字段名应为：

抗生素英文代码+“_NM”；例如：

AMK_NM、AMX_NM；切记：

不能为（S、I、R）不能为非2的平方数如6、7、99、100等等。

MIC法特殊字段-【GEH_NM】高浓度庆大霉素的填写规则：

以下特殊规则将直接替代普通MIC法的校验规则，具体如下：

1、仅允许出现如下值：

250，256，500，512，513，1000，1024，1025，不在这些数字范围内的，均为非法值，影响通过率。

2、可以有前导【>、<、=】符号

3、如果填写了【SYN-S】，系统将自动替换为【<=500】

4、如果填写了【SYN-R】，则将自动替换为【>=1000】

MIC法特殊字段-【STH_NM】，高浓度链霉素的填写规则：

以下特殊规则直接替代普通MIC法的校验规则，具体如下：

1、仅允许出现如下值：

500，512，1000，1024，2000，2048，2049，不在这些数字范围内的，均视为非法值

2、可以有前导【>、<、=】符号

3、如果填写了【SYN-S】，系统将自动替换为【<=1000】

4、如果填写了【SYN-R】则将自动替换为【>=2000】

MIC法特殊字段-【SXT_NM】复方新诺明的填写规则：

该结果上传后系统自动将数据为320的字符替换为16，160替换为8，80替换4，40替换为2，20替换为1，10替换为0.5，其余字符保持原始数据。

A.系统会将数据中出现的一些特殊字符替换为合法字符，具体如下：

a）全角“≧”或“≥”将替换为半角“>=”

b）全角“≦”、“≤”将替换为半角“<=”

c）全角“＞”将替换为半角“>”

d）全角“＜”将替换为半角“<”

e）全角“＝”将替换为半角“=”

f）全角“．”与“。

”将替换为半角“.”

在数据中若出现未在附表（5）中的其它抗生素字段，系统会自动忽略该字段的数据，不予保存。

本系统目前抗菌药物敏感性执行标准为CLSIM100-S23，上传数据如果有未达到该折点标准的数据，系统会将该组数据中的未达到CLSIM100-S23标准的抗生素结果忽略。

如某一抗生素，CLSIM100-S23折点为S:

<=2，I:

4-8，R:

>=16，测定结果为<=8，这样的数据系统无法判断是敏感还是中介，系统在统计的时候会自动将该组数据中的这个抗生素结果给忽略掉，不予统计。

2014新版细菌耐药监测信息系统具备了强大的数据容错处理功能，能将上传的不合格数据自动修正或删除，处理为合格的数据文件，同时具备一定的学习功能，用户可以下载经容错处理后的数据发现并纠正错误，不断改进，提高数据质量，同时可将修正后数据用于本机构细菌耐药监测统计分析。

附表1：

WARD_TYPE字典

代码

含义

out

门诊病人

住院病人

inx

住院病人（非-ICD）

icu

重症监护病房

int

过度监护病房

eme

急诊

nur

家庭护理

com

社区

hos

其它医院

lab

实验室

aba

Abattoir（屠宰场）

vet

Veterinaryclinic（兽医诊所）

far

Farm（农场）

fie

Field（野外）

sto

Store/Market（商店/超市）

res

Restaurant（饭店）

zoo

Zoo（动物园）

mix

混合

unk

未知（不明来源）

oth

其他

附表2：

系统内置标准科室分类字典

代码

名称

代码

名称

neu

神经内科

obg

妇产科

car

心内科

ped

儿科

res

呼吸内科

pes

小儿外科

dis

消化内科

neo

新生儿科

end

内分泌内科

oph

眼科

hem

血液内科

oto

耳鼻咽喉科

nep

肾脏内科

sto

口腔科

ger

老年病内科

der

皮肤性病科

rhe

风湿免疫科

inf

感染疾病科

med

（大）内科

chi

中医科

oim

其它内科

rad

放射治疗科

sur

外科

onc

肿瘤科

ort

骨科

eme

急诊科

urs

泌尿外科

out

门诊科

ces

胸外科

icu

重症医学科

cas

心脏外科

rcu

呼吸监护室

bus

整形烧伤外科

ccu

心脏监护室

nes

神经外科

ecu

急诊监护室

vas

介入血管外科

reh

康复医学科

ots

其它外科

oth

其它

附表3：

SPEC_TYPE与SPEC_CODE对照字典

名　称

SPEC_CODE数字代码

SPEC_TYPE英文代码

名　称

SPEC_CODE

数字代码

SPEC_TYPE

英文代码

鼻腔拭子

水

咽拭子

食物

痰

不明标本

支气管分泌物

质控

耳部标本

头发

100

眼分泌物

指甲

101

口腔拭子

鼻咽拭子

102

皮肤拭子

足拭子

103

关节拭子

尸检标本

104

导尿管尿

异物

105

尿液

胎粪

106

血液

子宫内避孕器

107

脑脊液

前段尿

108

肺穿刺液

脐部拭子

109

腹水

隔离标本

110

胃液

腹部脓肿

111

排泄物

烧伤标本

112

液体

永久导管

113

胆汁

角膜标本

114

伤口拭子

脓胸

115

外科手术伤口拭子

胸膜脓肿

116

脓肿

硬膜下脓肿

117

脓液

人工心脏瓣膜

118

羊水

小支气管肺泡灌洗液

119

气管插管

起博器

120

窦道拭子

胰腺标本

121

棉签

心包积液

122

吸气管

导管尖端

123

无菌体液

人工骨

124

器官

人工分流管

125

宫颈拭子

人工血管

126

脐带标本

保护性导管刷

127

阴道拭子

扁桃体穿刺液

128

活检组织

褥疮溃疡

129

组织

非导管尿

130

脑部组织

肾穿刺尿

131

心脏标本

未知来源尿

132

心脏瓣膜

扁桃体脓肿

133

肝脏穿刺液

牙龈脓肿

134

粪便

肛周脓肿

135

直肠拭子

皮肤脓肿

136

肌肉标本

阑尾

137

手部拭子

外周导管

138

手臂拭子

培养基

140

腋窝拭子

前庭大腺囊肿

141

结膜拭子

引流液

142

中耳拭子

心内膜

143

外耳拭子

附睾标本

144

瘘管

会厌拭子

145

生殖器拭子

食管拭子

146

男性外生殖器拭子

输卵管

147

女性外生殖器拭子

疖

148

胎盘组织

胆囊标本

149

乳房穿刺液

髋关节标本

150

乳汁

髋关节液

151

精液

昆虫

152

尿道拭子

关节腔积液

153

清洁中段尿

膝盖拭子

154

分泌物

膝关节液

155

骨组织

喉拭子

156

骨髓

唇拭子

157

支气管肺泡灌洗液

恶露

158

胸水

卵巢组织

159

下呼吸道标本

阴茎拭子

160

上呼吸道标本

阴茎分泌物

161

气管抽出液

会阴拭子

162

外部溃疡标本

血浆

163

内部溃疡标本

前列腺组织

164

筛选标本

前列腺液

165

筛选MRSA标本

直肠子宫陷凹穿刺液

166

筛选VRE标本

检测寄生虫用透明胶带

167

科研标本

血清

168

实验室标本

分流液

169

外部质控

脾组织

170

呼吸道标本

抗酸染色痰

171

溃疡标本

诱导痰

172

膀胱尿

吞线试验检测寄生虫

173

肾脏尿

睾丸穿刺液

174

耻骨弓上穿刺尿

牙齿

175

肾脏标本

蠕虫

176

子宫拭子

胸部伤口拭子

177

十二指肠液

腹部拭子

178

纵膈拭子

血管

179

囊液

头部拭子

181

囊肿穿刺液

唾液腺穿刺液

182

淋巴结穿刺液

腿部拭子

183

腺体穿刺液

颈部拭子

184

其它

神经

185

导管

盆腔积液

186

透

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