生化名词解释.docx
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生化名词解释
一、等电点(isoelectricpoint):
在某一pH值的溶液中,氨基酸解离成阴/阳离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,现在溶液的pH值称该氨基酸的等电点。
二、肽单元(肽平面):
参与肽键的6个原子——C-α1,C,O,N,H,C-α2。
位于同一平面,C-α1和C-α2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同一平面上的6个原子组成肽单元。
3、蛋白质一级结构:
蛋白质分子中氨基酸的排列顺序称蛋白质的一级结构。
一级结构的主要化学键是肽键,有的还包括二硫键。
一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。
4、二级结构:
指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,也就是该肽链主链骨架原子的相对空间位置,并非涉及氨基酸残基侧链的构象。
蛋白质二级结构包括α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲。
维持蛋白质二级结构的化学键是氢键。
五、三级结构:
多肽链中全数氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条多肽链所有原子在三维空间的排布位置。
六、亚基:
在蛋白质的四级结构中,每一个具有独立三级结构的多肽链就是一个亚基,亚基与亚基间呈特定的三维空间排布,并以非共价键相连接。
7、四级结构:
由两条或两条以上多肽链组成的蛋白质,每一条多肽链都有其完整的三级结构,称为蛋白质的亚基,亚基与亚基之间呈特定的三维空间排布,并以非共价键相连接,这种蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和彼此作用,称为蛋白质的四级结构。
八、α-螺旋(α-helix):
是蛋白质多肽链主链二级结构的主要类型之一,肽链主链骨架围绕中心轴盘绕成有规律的右手螺旋状。
九、β-折叠(βpleatedsheet):
是蛋白质二级结构的一种,其主要特征是:
①多肽链充分伸展,每一个肽单元以C-α为旋转点,依次折叠成锯齿结构;②氨基酸侧链交替地位于锯齿状结构的上、下方;③两条以上肽链或一条肽链内的若干肽段平行排列,通过链间羰基氧和亚氨基氢形成氢键,从而稳固β-折叠结构;④肽链有顺式平行和反式平行两种。
10、无规卷曲:
没有规律性的肽链结构。
1一、模体(motif):
在蛋白质分子中,有时可发觉两个或三个具有二级结构的肽段,在空间上彼此接近形成一个特殊的空间构象,并通常具有相应的特殊功能,称为模体。
1二、结构域(domain):
蛋白质结构中二级结构与三级结构之间的一个层次。
在较大的蛋白质分子中,由于多肽链相邻时超二级结构紧密联系,形成二个或多个在空间上能够明显区别的局部区域,这种局部区域称为结构域。
13、别构效应(allostericeffect):
蛋白质亚基与配体的结合致使蛋白质空间结构的改变并伴随功能转变的效应,称为别构效应或变构效应。
14、协同效应(synergisticeffect):
蛋白质的四级结构中,若其中一个亚基与配体结合后,能影响其寡聚体中另一亚基与配体的结合能力,这种效应称为协同效应。
14、变性(denaturation):
在某些物理或化学因素的作用下,蛋白质的空间构象被破坏,从而致使其理化性质的改变和生物活性的丧失,称蛋白质的变性。
1五、复性(renaturation):
若蛋白质变性程度较轻,去除变形因素后,有些蛋白质在必然条件下可重建其天然构象,恢复或部份恢复活物活性,称为复性。
16、基因组(Genome):
指生物体的全数遗传信息,即所含的全数DNA的全数核苷酸序列。
17、3’,5’-磷酸二酯键(3’,5’-phosphodiesterbond):
由一个脱氧核苷酸3’的羟基与另一个核苷酸5’的α-磷酸基团缩合形成
18、DNA双螺旋结构(Doublehelix):
两条反向平行的多核甘酸链彼此缠绕形成一个右手的双螺旋结构,内侧碱基与外侧磷酸核糖骨架平行。
直径2.37nm,螺距3.54nm,每螺旋10.5个碱基对,碱基按A-T,G-C配对互补,彼此以氢键相联系。
每碱基对之间相对旋转36°,碱基对垂直距离0.34nm。
维持DNA双螺旋结构的稳固的力主如果碱基堆积力。
双螺旋表面有两条宽窄深浅不一的大沟和小沟。
19、核酸分子杂交:
杂化双链能够在不同的DNA与DNA之间形成,也能够在DNA和RNA分子间或RNA与RNA分子间形成的现象。
20、核酸的变性与复性:
DNA变性(denaturation)在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的进程,其本质是双链间氢键的断裂。
DNA复性(renaturation)当变性条件缓慢地除去后,两条解离的互补链可从头配对,恢恢复来的双螺旋结构的现象
21、核酸(nucleicacid):
是以核苷酸为大体组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。
22、核酶(ribozyme):
具有催化作用的小RNA被称为核酶。
23、酶(enzyme):
是由活细胞合成的、对其特异底物起高效催化作用的蛋白质。
除少数RNA外几乎都是蛋白质
24、全酶(holoenzyme):
酶蛋白与辅助因子组成的复合物,具有催化活性
2五、辅酶(coenzyme):
某些酶在发挥催化作历时所需的一类辅助因子,是一些化学稳固的小分子有机化合物,,其成份中往往含有维生素。
辅酶与酶结合松散,能够通过透析除去。
2六、辅基(prostheticgroup):
是与酶蛋白质共价结合的金属离子或一类有机化合物,用透析法不能除去。
辅基在整个酶促反映进程中始终与酶的特定部位结合。
27、必需基团(essentialgroup):
酶的必需基团指的是酶分子中与酶的活性紧密相关的基团,包括活性中心内的必需基团和活性中心外的必需基团。
2八、活性中心(activecenter):
指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结归并起催化作用的部位。
2九、Km值:
即米氏常数(Michaelisconstant)。
Km值等于酶促反映速度为最大反映速度一半时的底物浓度,可近似表示酶对底物的亲和力.Km是酶的特征性常数之一,只与酶的结构、底物和反映环境(如温度、pH、离子强度)有关,与酶的浓度无关。
同一酶对于不同底物有不同的Km值。
Km值大表示亲和程度小,酶的催化活性低;Km值小表示亲和程度大,酶的催化活性高。
30、竞争性抑制(competitiveinhibition):
有些抑制剂与底物的结构相似,能与底物竞争酶的活性中心,从而阻碍酶-底物复合物的形成。
这种抑制使Km增大而Vmax不变。
这种抑制作用称为竞争性抑制作用。
3一、非竞争性抑制(noncompetitiveinhibition):
有些抑制剂与酶活性中心外的必需基团相结合,不影响酶与底物的结合,酶和底物的结合也不影响酶与抑制剂的结合。
底物和抑制剂之间无竞争关系。
但酶-底物-抑制剂复合物(ESI)不能进一步释放出产物。
这种抑制作用称作非竞争性抑制作用。
这种抑制使Km不变而Vmax变小。
3二、反竞争性抑制(uncompetitiveinhibition):
抑制剂仅与酶和底物形成的中间产物(ES)结合,使中间产物ES的量下降。
如此,既减少从中间产物转化为产物的量,也同时减少从中间产物解离出游离酶和底物的量。
这种抑制作用称为反竞争性抑制作用。
这种抑制使Km和Vmax都变小但Vmax/Km不变。
33、共价修饰(covalentmodification):
在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活性,此进程称为共价修饰。
34、变构调节(allostericregulation):
某些小分子可与酶蛋白特殊部位结合,引发酶分子构象转变,由此改变酶活性。
受别位调节的酶又称别构酶,能使酶发生构象转变的小分子物质称为效应物或变构剂,一般多是代谢物或作用物。
3五、酶原激活:
有些酶在细胞内合成或初分泌时只是酶的无活性前体,此前体物质称为酶原。
酶原激活是在必然条件下,酶原向有活性酶转化的进程。
3六、糖酵解(glycolysis)在缺氧情形下,葡萄糖生成乳酸(lactate)的进程
37、底物水平磷酸化(substratelevelphosphorylation)底物在脱氢或脱水时,分子内能量从头散布形成的高能磷酸根,直接转移给ADP生成ATP的方式
3八、糖的有氧氧化(aerobicoxidation)指在机体氧供充沛时,葡萄糖完全氧化成H2O和CO2,并释放出能量的进程,是机体主要供能方式。
部位:
胞液及线粒体
3九、三羧酸循环(TricarboxylicacidCycle,TAC)也称为柠檬酸循环或Krebs循环,指乙酰CoA和草酰乙酸缩合生成含三个羧基的柠檬酸,反复的进行脱氢脱羧,又生成草酰乙酸,再重复循环反映的进程,反映部位是线粒体。
要点:
通过一次三羧酸循环,消耗一分子乙酰CoA,经四次脱氢,二次脱羧,一次底物水平磷酸化,生成1分子FADH2,3分子NADH+H+,2分子CO2,1分子GTP。
三羧酸循环在三大营养物质代谢中具有重要生理意义,是三大营养素的最终代谢通路,其作用在于通过4次脱氢,为氧化磷酸化反映生成ATP提供还原当量,是糖、脂肪、氨基酸代谢联系的枢纽。
40、乳酸循环也称Cori循环,是指肌肉缺氧时产生大量乳酸,大部份经血液运到肝脏,通过糖异生作用肝糖原作用再生成葡萄糖补充血糖,血糖可再被肌肉利用,这就组成了个循环,此循环称为乳酸循环。
4一、磷酸戊糖途径(pentosephosphatepathway)指机体某些组织以6-磷酸葡萄糖为起始物在6-磷酸葡萄糖脱氢酶作用下形成6-磷酸葡萄糖酸进而生成磷酸戊糖为中间代谢物的进程,生理意义在于生成NADPH和5-磷酸核糖;为核酸的生物合成提供核糖;提供NADPH作为供氢体参与多种代谢反映
4二、糖异生作用由非糖物质转变成葡萄糖或糖原的进程,底物主如果生糖氨基酸、甘油和乳酸,主要器官是肝脏和肾脏。
43、底物循环(substratecycle)作用物的互变别离由不同酶催化其单向反映的互变循环
低血糖空肚血糖浓度低于3.33~3.89mmol/L称为低血糖。
血糖水平太低,会影响脑细胞的功能,从而出现头晕、倦怠无力、心悸等症状,严峻时出现昏迷,称为低血糖休克。
44.脂肪动员(fatmobilization):
贮存在脂肪细胞中的甘油三酯,被脂酶慢慢水解为游离脂酸(freefattyacid,FFA)和甘油(glycerol)并释放入血,通过血液运输至其他组织氧化利用的进程。
45.酮体(ketonebodies):
脂酸在肝细胞氧化分解时产生的特有中间代谢产物,包括乙酰乙酸、β-羟丁酸、丙酮,是肝脏输出能源的一种形式。
46.血脂(bloodfat):
血浆所含脂类的统称。
包括甘油三酯、磷脂、胆固醇及其酯、游离脂酸等。
47.脂蛋白(lipoprotein):
脂质与载脂蛋白结合形成的球形复合物,球体表面为载脂蛋白、磷脂及胆固醇的亲水基团,球体内核为甘油三酯、胆固醇酯等疏水脂质。
血浆脂蛋白是血浆脂质的运输和代谢方式。
按照密度不同,血浆脂蛋白能够分为四种:
CM、VLDL、LDL、HDL。
4八、生物氧化(Biologicaloxidation):
指物质在生物体内进行的氧化,主如果糖、脂肪、蛋白质等在体内分解时慢慢释放能量,最终生成二氧化碳和水的进程。
其中大部份能量转化成ATP,其余能量以热能形式释放。
4九、呼吸链(respiratorychain):
代谢物脱下的成对氢原子通过量种酶和辅酶所催化的连锁反映慢慢传递,最终与氧结合生成水,此进程和细胞呼吸有关,因此称为呼吸链。
50、氧化磷酸化(oxidativephosphorylation):
代谢物脱下的成对氢原子在呼吸链传递进程中偶联ADP磷酸化、生成ATP的进程,是细胞内ATP生成的主要方式。
5一、尿素循环(ureacycle):
指氨与CO2通过鸟氨酸、瓜氨酸、精氨酸生成尿素的进程,又称鸟氨酸循环,是人体血氨的主要代谢途径。
5二、一碳单位(Onecarbonunit):
某些氨基酸(丝、色、组、甘)在分解代谢进程中产生的含有一个碳原子的基团
53、苯酮酸尿症(phenylketonuria):
是由于苯丙氨酸羟化酶缺乏引发苯丙酸堆积的代谢遗传病。
缺乏丙酮酸羟化酶,苯丙氨酸只能靠转氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸。
苯丙酮酸堆积对神经有迫害,使智力发肓出现障碍。
54、多胺(polyamine):
指含有多个氨基的化合物,是调节细胞生长的重要物质。
5五、半保留复制:
DNA生物合成时,母链DNA解开为两股单链,各自作为模板(template)按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。
子代细胞的DNA,一股单链从亲代完整地同意过来,另一股单链则完全从头合成。
两个子细胞的DNA都和亲代DNA碱基序列一致:
5六、半不持续复制:
DNA复制进程中由于侍从链与解链方向相反,复制时需等待DNA解链必然长度后,再合成底物进行完成复制。
在复制延长进程中,又要等待解链必然长度是合成底物再进行复制。
故这种领头链持续复制,侍从链不持续复制的特性称之为DNA复制的不持续性。
57、冈崎片段(Okazakifragment):
DNA复制进程中侍从链上的不持续片段。
5八、复制子(replicon):
相邻两个复制其实点之间的的DNA复制区域。
5九、SSB(单链结合蛋白,singlestrandDNAbindingprotein):
在复制进程中,能与以解链的单链DNA结合,稳固单链DNA构象,维持碱基互补配对,避免单链DNA被核酸酶降解。
60、Telomere:
位于真核细胞染色体结尾的结构。
由DNA和蛋白质一路组成。
具有维持染色体的稳固和遗传物质的完整性的功能。
6一、Reversetranscription:
利用逆转录酶,以RNA为模版合成DNA双链的进程。
6二、Excisionrepairing:
使体内最重要和最主要的DNA损伤修复类型。
其包括:
核酸内外切酶切除损伤的DNA并有DNA-pol填补空虚,最后由DNA连接酶链接DNA双链中单链内的缺口。
63、滚环复制:
是低等生物(噬菌体)的主要DNA复制方式。
复制由具有核算内切酶的A蛋白切开一切口,不需引物直接开始复制,直至复制到切口断时,再次由A蛋白将母链与子链切开。
外环母链在此转动一次,最后合成两个环状DNA。
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64、D环复制:
是线粒体DNA复制的主要方式。
其特点是,复制需要引物,而且复制时内外环的起始位点不在DNA双链的同一名置,且内外环的复制具有时序不同。
6五、转录(transcription):
指以DNA一条链为模板,四种NTP为原料,在DNA指导的RNA聚合酶作用下,依照碱基互补原则合成RNA链的进程。
6六、模板链(templatestrand):
DNA双链中按碱基配对规律能指引转录生成RNA的一股单链也称作成心义链或Watson链。
相对的另一股单链是编码链(codingstrand),也称为反义链或Crick链。
67、核心酶(coreenzyme):
原核细胞的RNA聚合酶由多个亚基组成其中ααββ’是该酶的核心酶,增进RNA链的延长。
6八、核酶(ribozyme):
指具有催化功能(酶的作用)的RNA分子,能催化RNA的自我剪接。
6九、遗传密码子(geneticcodon):
mRNA的编码区内.每3个相邻的核苷酸为一组,代表一种氨基酸(或其他信息),又叫三联密码(tripletcodon)
70、开放阅读框(openreadingframe,ORF):
从mRNA5-端起始密码子AUG到3-端终止密码子之前的核苷酸序列。
7一、密码子简并性(degeneracy):
一种氨基酸可具有2个或2个以上的密码子为其编码。
7二、摆动配对(wobble):
反密码子与密码子之间的配对有时并非严格遵守常见的碱基配对规律的现象
73、S-D序列:
位置:
原核生物mRNA起始AUG上游
特点:
由4~9个核苷酸组成的富含嘌呤碱基
性质:
能与核糖体小亚基16SrRNA的序列互补结合
功能:
核糖体结合位点,原核生物翻译起始进程mRNA准肯定位机制之一
74、翻译后修饰(posttranslationalmodification):
对翻译后的蛋白质一级结构进行共价加工多肽链折叠,包括蛋白质在空间结构的进一步修饰
75、分子伴侣(molecularchaperone)与分子素(chaperonin):
细胞内一类保守蛋白质,可识别肽链的非天然构象,增进各功能域和整体蛋白质的正确折叠或形成四级结构。
76、蛋白质的靶向输送(proteintargeting):
蛋白质合成后通过复杂机制,定向输送到最终发挥生物功能的细胞靶部位的进程。
77、信号序列(signalsequence):
主要为N结尾特异氨基酸序列,引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位,是所有靶向输送的蛋白质结构的分选信号
78、信号肽(signalpeptide):
各类新生分泌蛋白N端的保守氨基酸序列,介导蛋白质的靶向输送。
79、IF(initiationfactor):
即翻译起始因子,真核生物的翻译起始因子是elf。
IF的功能是增进翻译器是复合物的形成。
80、RF(releasefactor)即释放因子,参与翻译终止的蛋白质因子。
原核生物有三种(RF),真核生物有一种(ERF)。
RF的功能一是识别终止密码,二是诱导转肽酶改变成酯酶活性,促使新生肽链从核糖体上释放。
81、基因表达(geneexpression):
是指贮存遗传信息的基因通过一系列步骤表现出其生物功能的整个进程。
典型的基因表达是基因通过转录、翻译,产生有生物活性的蛋白质的进程。
82、管家基因(housekeepinggene):
某些基因产物对生命全进程都是必需的或必不可少的。
这种基因在一个生物个体的各生长阶段和几乎所有细胞中持续表达,通常被称为管家基因。
1一、、顺式作用元件(cisactingelement):
指可影响自身基因表达活性的真核DNA序列。
按照顺式作用元件在基因中的位置、转录激活作用的性质及发挥作用的方式,分为启动子、增强子及沉默子等。
83、反式作用因子(trans-actingfactor):
能直接或间接地识别或结合在各顺式作用元件核心序列上,参与调控靶基因转录速度的一组蛋白质。
84、CpG岛(CpGisland):
基因5’侧翼区的一类特殊的DNA序列,聚集了几百bpCG序列,其中胞嘧啶可被甲基化,甲基化致使下游基因不表达或低表达。
(甲基化范围与基因表达程度成反比)
8五、片段重组体(patchrecombinant):
切开的链与原来断裂的链是同一条链,重组体含有一段异源双链区,其双侧来自同一亲本DNA。
8六、拼接重组体(splicerecombinant):
切开的链与原来断裂的链不是同一条链,重组体异源双链区的双侧来自不同亲本DNA。
87、DNA克隆(DNAcloning):
纯的无性繁衍系统称为克隆。
纯化繁衍DNA就称为DNA克隆或分子克隆,基因的纯化繁衍就称为基因克隆。
8八、限制性内切核酸酶(RestrictionEndonuclease):
能识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶,其存在于细菌体内,与甲基化酶一路组成限制修饰体系,限制外源DNA,保护自身DNA,有利于细菌遗传性状的稳固遗传。
89、cDNA文库(cDNAlibrary):
以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体常常利用噬菌体或质粒载体连接后转化受体菌,则每一个细菌含有一段cDNA,并能繁衍扩增,如此包括着细胞全数mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
基因组含有的基因在特定的组织细胞中只有一部份表达,而且处在不同环境条件、不同分化时期的细胞其基因表达的种类和强度也不尽相同,所以cDNA文库具有组织细胞特异性。
cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中挑选克隆取得细胞特异表达的基因。
但对真核细胞来讲,从基因组DNA文库取得的基因与从cDNA文库取得的不同,基因组。
DNA文库所含的是带有内含子和外显子的基因组基因,而从cDNA文库中取得的是已通过剪接、去除内含子的cDNA。
90、基因重组(GeneticRecombination):
指整段DNA在细胞内或细胞间,乃至在不同物种之间进行互换,并能在新的位置上复制,转录和翻译。
9一、同源重组(HomologousRecombination):
发生在同源序列间的重组,发生依赖于两分子间序列的相同或类似性。
9二、基因载体(Vector):
为携带目的基因,实现其无性繁衍或表达成心义的蛋白质所采用的一些DNA分子。
常常利用载体质粒DNA、噬菌体DNA、病毒DNA。
93、表达载体(expressionvector):
为使插入的外源DNA序列可转录翻译成多肽链而特意设计的载体称为表达载体。
94、质粒(Plasmid):
存在于细菌染色体外的小型环状双链DNA.质粒分子本身是含有复制功能的遗传结构,能在宿主细胞独立自主的进行复制,并在细胞割裂时恒定的传给子代细胞。
9五、转座(transpositionalrecombination):
由插入序列和转座子介导的基因移位或重排称为转座(transposition)。
9六、特异位点重组(SiteSpecificRecombination):
由整合酶催化,在两个DNA序列的特异位点间发生的整合。