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weka案例

篇一:

weka之weather实例分析

数据格式

跟很多电子表格或数据分析软件一样,WEKA所处理的数据集是图1那样的一个二维的表格。

图1新窗口打开

这里我们要介绍一下WEKA中的术语。

表格里的一个横行称作一个实例(Instance),相当于统计学中的一个样本,或者数据库中的一条记录。

竖行称作一个属性(Attrbute),相当于统计学中的一个变量,或者数据库中的一个字段。

这样一个表格,或者叫数据集,在WEKA看来,呈现了属性之间的一种关系(Relation)。

图1中一共有14个实例,5个属性,关系名称为“weather”。

WEKA存储数据的格式是ARFF(Attribute-RelationFileFormat)文件,这是一种ASCII文本文件。

图1所示的二维表格存储在如下的ARFF文件中。

这也就是WEKA自带的“weather.arff”文件,在WEKA安装目录的“data”子目录下可以找到。

需要注意的是,在Windows记事本打开这个文件时,可能会因为回车符定义不一致而导致分行不正常。

推荐使用UltraEdit这样的字符编辑软件察看ARFF文件的内容。

下面我们来对这个文件的内容进行说明。

识别ARFF文件的重要依据是分行,因此不能在这种文件里随意的断行。

空行(或全是空格的行)将被忽略。

以“%”开始的行是注释,WEKA将忽略这些行。

如果你看到的“weather.arff”文件多了或少了些“%”开始的行,是没有影响的。

除去注释后,整个ARFF文件可以分为两个部分。

第一部分给出了头信息(Headinformation),包括了对关系的声明和对属性的声明。

第二部分给出了数据信息(Datainformation),即数据集中给出的数据。

从“@data”标记开始,后面的就是数据信息了。

关系声明

关系名称在ARFF文件的第一个有效行来定义,格式为

@relation

是一个字符串。

如果这个字符串包含空格,它必须加上引号(指英文标点的单引号或双引号)。

属性声明

属性声明用一列以“@attribute”开头的语句表示。

数据集中的每一个属性都有它对应的“@attribute”语句,来定义它的属性名称和数据类型。

这些声明语句的顺序很重要。

首先它表明了该项属性在数据部分的位置。

例如,“humidity”是第三个被声明的属性,这说明数据部分那些被逗号分开的列中,第三列数据85908696...是相应的“humidity”值。

其次,最后一个声明的属性被称作class属性,在分类或回归任务中,它是默认的目标变量。

属性声明的格式为

@attribute

其中是必须以字母开头的字符串。

和关系名称一样,如果这个字符串包含空格,它必须加上引号。

WEKA支持的有四种,分别是

numeric-------------------------数值型

-----分类(nominal)型

string----------------------------字符串型

date[]--------日期和时间型

其中将在下面说明。

还可以使用两个类型“integer”和“real”,但是WEKA把它们都当作“numeric”看待。

注意“integer”,“real”,“numeric”,“date”,“string”这些关键字是区分大小写的,而“relation”“attribute”和“date”则不区分。

数值属性

数值型属性可以是整数或者实数,但WEKA把它们都当作实数看待。

分类属性

分类属性由列出一系列可能的类别名称并放在花括号中:

{,,,...}。

数据集中该属性的值只能是其中一种类别。

例如如下的属性声明说明“outlook”属性有三种类别:

“sunny”,“overcast”和“rainy”。

而数据集中每个实例对应的“outlook”值必是这三者之一。

@attributeoutlook{sunny,overcast,rainy}

如果类别名称带有空格,仍需要将之放入引号中。

字符串属性

字符串属性中可以包含任意的文本。

这种类型的属性在文本挖掘中非常有用。

示例:

@ATTRIBUTELCCstring

日期和时间属性

日期和时间属性统一用“date”类型表示,它的格式是

@attributedate[]

其中是这个属性的名称,是一个字符串,来规定该怎样解析和显示日期或时间的格式,默认的字符串是ISO-8601所给的日期时间组合格式“yyyy-MM-ddTHH:

mm:

ss”。

数据信息部分表达日期的字符串必须符合声明中规定的格式要求(下文有例子)。

数据信息

数据信息中“@data”标记独占一行,剩下的是各个实例的数据。

每个实例占一行。

实例的各属性值用逗号“,”隔开。

如果某个属性的值是缺失值(missingvalue),用问号“?

”表示,且这个问号不能省略。

例如:

@data

sunny,85,85,FALSE,no

?

78,90,?

yes

字符串属性和分类属性的值是区分大小写的。

若值中含有空格,必须被引号括起来。

例如:

@relationLCCvsLCSH

@attributeLCCstring

@attributeLCSHstring

@data

AG5,'Encyclopediasanddictionaries.;Twentiethcentury.'

AS262,'Science--SovietUnion--History.'

日期属性的值必须与属性声明中给定的相一致。

例如:

@RELATIONTimestamps

@ATTRIBUTEtimestampDATE"yyyy-MM-ddHH:

mm:

ss"

@DATA

"201X-04-0312:

12:

12"

"201X-05-0312:

59:

55"

稀疏数据

有的时候数据集中含有大量的0值(比如购物篮分析),这个时候用稀疏格式的数据存贮更加省空间。

稀疏格式是针对数据信息中某个实例的表示而言,不需要修改ARFF文件的其它部分。

看如下的数据:

@data

0,X,0,Y,"classA"

0,0,W,0,"classB"

用稀疏格式表达的话就是

@data

{1X,3Y,4"classA"}

{2W,4"classB"}

每个实例用花括号括起来。

实例中每一个非0的属性值用<空格>表示。

是属性的序号,从0开始计;是属性值。

属性值之间仍用逗号隔开。

这里每个实例的数值必须按属性的顺序来写,如{1X,3Y,4"classA"},不能写成{3Y,1X,4"classA"}。

注意在稀疏格式中没有注明的属性值不是缺失值,而是0值。

若要表示缺失值必须显式的用问号表示出来。

Relational型属性

在WEKA3.5版中增加了一种属性类型叫做Relational,有了这种类型我们可以像关系型数据库那样处理多个维度了。

但是这种类型目前还不见广泛应用,暂不作介绍。

数据准备

使用WEKA作数据挖掘,面临的第一个问题往往是我们的数据不是ARFF格式的。

幸好,WEKA还提供了对CSV文件的支持,而这种格式是被很多其他软件所支持的。

此外,WEKA还提供了通过JDBC访问数据库的功能。

在这一节里,我们先以Excel和Matlab为例,说明如何获得CSV文件。

然后我们将知道CSV文件如何转化成ARFF文件,毕竟后者才是WEKA支持得最好的。

面对一个ARFF文件,我们仍有一些预处理要做,才能进行挖掘任务。

.*->.csv

我们给出一个CSV文件的例子(bank-data.csv)。

用UltraEdit打开它可以看到,这种格式也是一种逗号分割数据的文本文件,储存了一个二维表格。

Excel的XLS文件可以让多个二维表格放到不同的工作表(Sheet)中,我们只能把每个工作表存成不同的CSV文件。

打开一个XLS文件并切换到需要转换的工作表,另存为CSV类型,点“确定”、“是”忽略提示即可完成操作。

在Matlab中的二维表格是一个矩阵,我们通过这条命令把一个矩阵存成CSV格式。

csvwrite('filename',matrixname)

需要注意的是,Matllab给出的CSV文件往往没有属性名(Excel给出的也有可能没有)。

而WEKA必须从CSV文件的第一行读取属性名,否则就会把第一行的各属性值读成变量名。

因此我们对于Matllab给出的CSV文件需要用UltraEdit打开,手工添加一行属性名。

注意属性名的个数要跟数据属性的个数一致,仍用逗号隔开。

.csv->.arff

将CSV转换为ARFF最迅捷的办法是使用WEKA所带的命令行工具。

运行WEKA的主程序,出现GUI后可以点击下方按钮进入相应的模块。

我们点击进入“SimpleCLI”模块提供的命令行功能。

在新窗口的最下方(上方是不能写字的)输入框写上javaweka.core.converters.CSVLoaderfilename.csv>filename.arff

即可完成转换。

在WEKA3.5中提供了一个“ArffViewer”模块,我们可以用它打开一个CSV文件将进行浏览,然后另存为ARFF文件。

进入“Exploer”模块,从上方的按钮中打开CSV文件然后另存为ARFF文件亦可。

“Exploer”界面

我们应该注意到,“Exploer”还提供了很多功能,实际上可以说这是WEKA使用最多的模块。

现在我们先来熟悉它的界面,然后利用它对数据进行预处理。

图2新窗口打开

图2显示的是使用3.5版"Exploer"打开"bank-data.csv"的情况。

我们根据不同的功能把这个界面分成8个区域。

区域1的几个选项卡是用来切换不同的挖掘任务面板。

这一节用到的只有“Preprocess”,其他面板的功能将在以后介绍。

区域2是一些常用按钮。

包括打开数据,保存及编辑功能。

我们在这里把"bank-data.csv"另存为"bank-data.arff"。

在区域3中“Choose”某个“Filter”,可以实现筛选数据或者对数据进行某种变换。

数据预处理主要就利用它来实现。

区域4展示了数据集的一些基本情况。

区域5中列出了数据集的所有属性。

勾选一些属性并“Remove”就可以删除它们,删除后还可以利用区域2的“Undo”按钮找回。

区域5上方的一排按钮是用来实现快速勾选的。

在区域5中选中某个属性,则区域6中有关于这个属性的摘要。

注意对于数值属性和分类属性,摘要的方式是不一样的。

图中显示的是对数值属性“income”的摘要。

区域7是区域5中选中属性的直方图。

若数据集的最后一个属性(我们说过这是分类或回归任务的默认目标变量)是分类变量

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