奥维森基因扩增子样品质检报告模板.docx
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奥维森基因扩增子样品质检报告模板
报告单号:
D********
奥维森基因扩增子样品质检报告
一、项目信息
合同编号
AWGT********
项目名称
青岛市口腔医院86个血液DNA样本16SV3-V4区MiseqPE300测序分析ZWY
合作单位
【张文怡】青岛市口腔医院
客户姓名
张文怡
样品接收人
戴璐敏
接收日期
2019-10-18
样品检测人
魏凌峰
检测日期
2019-10-29
报告撰写人
张洋
发布日期
2019-12-02
报告审核人
张洋
二、样品检测方法
MetaAmpliconDNA样品检测方法:
PCR扩增。
三、样品检测结果
序号
样品名称
样品编号
扩增区域
检测结果
检测等级
备注
1
N5
SD********
16SV3-V4
不合格
D
2
N55
SD********
16SV3-V4
不合格
D
3
N52
SD********
16SV3-V4
不合格
C
4
N45
SD********
16SV3-V4
不合格
C
5
N44
SD********
16SV3-V4
不合格
C
6
N51
SD********
16SV3-V4
不合格
C
7
N24
SD********
16SV3-V4
不合格
C
8
N67
SD********
16SV3-V4
不合格
C
9
N46
SD********
16SV3-V4
不合格
C
10
N1
SD********
16SV3-V4
不合格
D
11
N28
SD********
16SV3-V4
不合格
C
12
N14
SD********
16SV3-V4
合格
B
13
N6
SD********
16SV3-V4
合格
B
14
N61
SD********
16SV3-V4
不合格
C
15
N48
SD********
16SV3-V4
合格
B
16
N15
SD********
16SV3-V4
合格
B
17
N59
SD********
16SV3-V4
不合格
C
18
N26
SD********
16SV3-V4
不合格
C
19
Q43
SD********
16SV3-V4
不合格
C
20
Q43B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
21
Q43c
SD********
16SV3-V4
不合格
C
22
ZX
SD********
16SV3-V4
不合格
C
23
Q40B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
24
Q40C
SD********
16SV3-V4
不合格
C
25
Q57
SD********
16SV3-V4
不合格
C
26
Q57B
SD********
16SV3-V4
合格
B
27
Q57C
SD********
16SV3-V4
不合格
C
28
Q61
SD********
16SV3-V4
不合格
C
29
Q61B
SD********
16SV3-V4
合格
B
30
Q61C
SD********
16SV3-V4
不合格
C
31
Q55
SD********
16SV3-V4
不合格
C
32
Q55B
SD********
16SV3-V4
不合格
D
33
Q55c
SD********
16SV3-V4
不合格
C
34
Q69
SD********
16SV3-V4
不合格
C
35
Q69B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
36
Q25
SD********
16SV3-V4
不合格
C
37
Q25B
SD********
16SV3-V4
合格
B
38
Q25C
SD********
16SV3-V4
合格
B
39
Q28
SD********
16SV3-V4
合格
B
40
Q28B
SD********
16SV3-V4
合格
B
41
Q28C
SD********
16SV3-V4
不合格
C
42
JLH
SD********
16SV3-V4
不合格
C
43
Q33B
SD********
16SV3-V4
合格
A
44
Q33C
SD********
16SV3-V4
合格
B
45
Q38
SD********
16SV3-V4
不合格
C
46
Q38B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
47
Q50
SD********
16SV3-V4
不合格
C
48
Q50B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
49
Q50C
SD********
16SV3-V4
合格
B
50
Q23
SD********
16SV3-V4
合格
B
51
QL2
SD********
16SV3-V4
合格
B
52
Q23C
SD********
16SV3-V4
不合格
D
53
Q26
SD********
16SV3-V4
合格
B
54
Q26B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
55
Q26C
SD********
16SV3-V4
合格
A
56
Q34
SD********
16SV3-V4
合格
A
57
Q34B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
58
Q34C
SD********
16SV3-V4
合格
B
59
Q35
SD********
16SV3-V4
不合格
C
60
Q35B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
61
Q35C
SD********
16SV3-V4
不合格
C
62
Q36
SD********
16SV3-V4
合格
B
63
Q36B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
64
Q36C
SD********
16SV3-V4
不合格
C
65
Q37
SD********
16SV3-V4
不合格
A
66
Q37B
SD********
16SV3-V4
合格
B
67
Q54
SD********
16SV3-V4
合格
B
68
Q54B
SD********
16SV3-V4
合格
B
69
Q54C
SD********
16SV3-V4
合格
B
70
Q58
SD********
16SV3-V4
不合格
C
71
Q58B
SD********
16SV3-V4
合格
A
72
Q47
SD********
16SV3-V4
不合格
D
73
QB
SD********
16SV3-V4
不合格
C
74
Q24
SD********
16SV3-V4
不合格
C
75
Q24B
SD********
16SV3-V4
不合格
D
76
Q24C
SD********
16SV3-V4
不合格
D
77
Q27
SD********
16SV3-V4
不合格
C
78
Q27B
SD********
16SV3-V4
不合格
C
79
Q27C
SD********
16SV3-V4
不合格
D
80
Q19
SD********
16SV3-V4
不合格
C
81
Q19B
SD********
16SV3-V4
合格
B
82
Q19C
SD********
16SV3-V4
不合格
D
83
Q18B
SD********
16SV3-V4
不合格
D
84
Q18C
SD********
16SV3-V4
不合格
D
85
Q21
SD********
16SV3-V4
不合格
C
86
Q21B
SD********
16SV3-V4
不合格
D
*注:
1.检测结果和备注是依据DNA样品判定标准,对被检测样品是否符合要求给出的意见和解释,检测结果类别分类要求如下:
A类:
PCR产物目的条带大小正确,且总量满足2次或者2次以上建库需要;
B类:
PCR产物目的条带大小正确,且总量满足1次但不足2次建库需要;
C类:
PCR产物有非特异性条带,目的条带浓度低,可风险建库但不保证测序质量;
D类:
PCR产物无目的条带或浓度低不能满足建库要求,不建议使用,需重新送样。
四、附件
1.检测前处理
将样品在冰上融化后,离心并充分混匀,Nanodrop检测样品质量,取30ng进行PCR扩增。
2.PCR扩增体系
试剂成分
体积
DNA样品
X(30ng)
ForwardPrimer(5uM)
1μL
ReversePrimer(5uM)
1μL
BSA(2ng/μL)
3μL
2xTaqPlusMasterMix
12.5μL
ddH2O
7.5-XμL
Total
25μL
3.扩增引物序列
第一轮:
扩增区域
引物序列
16SV3-V4
AGAGTTTGATCMTGGCTCAG
TACGGYTACCTTGTTACGACTT
第二轮:
扩增区域
引物序列
16SV3-V4
GTACTCCTACGGGAGGCAGCA
GTGGACTACHVGGGTWTCTAAT
4.PCR扩增程序
第一轮:
94℃5min
94℃60s
30Cycles
55℃30s
72℃120s
72℃7min
4℃end
第二轮:
94℃5min
94℃30s
30Cycles
50℃30s
72℃60s
72℃7min
4℃end
5.琼脂糖凝胶电泳检测参数
胶浓度:
1%;电压:
170V;电泳时间:
30min
6.琼脂糖凝胶电泳检测结果
点孔
次数
样品名称
稀释倍数(×)
上样量(μL)
扩增区域
1
N5
1
3
16SV3-V4
2
N