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生物化学课程作业
绪论
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第一章核酸8/10/3
[课后小结]熟悉核酸的分类和生物学功能、分子组成、化学结构特点。
掌握DNA一级结构、高级结构、核小体、核酸的变性、复性、分子杂交。
理解核酸(DNA与RNA)结构与功能的关系。
熟悉核酸重要的理化性质、变性和复性及其应用。
了解核酸酶的概念分类
名词解释(英语解释)
单核苷酸(mononucleotide)3′,5′-磷酸二酯键(phosphodiesterbonds)
碱基互补规律(complementarybasepairing)核酸的变性与复性(denaturation、renaturation)
退火(annealing)增色效应(hyperchromiceffect)发夹结构(hairpinstructure)
DNA的熔解温度(meltingtemperatureTm)分子杂交(molecularhybridization)
环化核苷酸(cyclicnucleotide)
DNA复性(退火)一般在低于其Tm值约20℃的温度下进行的。
填空题
1.DNA双螺旋结构模型是___于___年提出的。
2.核酸的基本结构单位是___。
3.脱氧核糖核酸在糖环___位置不带羟基。
4.两类核酸在细胞中的分布不同,DNA主要位于___中,RNA主要位于___中。
5.核酸分子中糖环与碱基之间的连键为___键。
核苷与核苷之间通过___键连接成多聚体。
6.核酸的特征元素___。
7.B型DNA双螺旋的两条多核苷酸连为___、___方向的螺旋,螺距为___,每匝螺旋有___对碱基,每对碱基的转角是___。
8.在DNA分子中,一般来说G-C含量高时,比重___,Tm(熔解温度)则___,分子比较稳定。
9.在___条件下,互补的单股核苷酸序列将缔结成双链分子。
10.___RNA分子指导蛋白质合成,___RNA分子用作蛋白质合成中活化氨基酸的载体。
11.DNA变性后,紫外吸收___,粘度___、浮力密度___,生物活性将___。
12.因为核酸分子具有___、___,所以在___nm处有吸收峰,可用紫外分光光度计测定。
13.维持DNA双螺旋结构稳定的主要因素是___,其次,大量存在于DNA分子中的弱作用力如___,______和___也起一定作用。
14.常见的环化核苷酸有___和___。
其作用是___,他们核糖上的___位与___位磷酸-OH环化。
问答
1、将核酸完全水解后可得到哪些组分?
DNA和RNA的水解产物有何不同?
2、画出核苷中两种C-N糖苷键,注意N1与N9。
3、几种重要的核苷酸结构:
ATP、GTP;cAMP、cGMP。
4、画出A=T碱基配对的分子构造(包括氢原子)。
5、简述B型DNA双螺旋结构模型的要点。
6、在稳定的DNA双螺旋中,哪两种力在维系分子立体结构方面起主要作用?
7、核酸变性特征,引起变性的因素,以及核酸变性时,伴随的物理化学性质的改变。
8、核酸含量测定方法与原理。
9、对一双链DNA而言,若一条链中(A+G)/(T+C)=0.7,则:
(1)互补链中(A+G)/(T+C)=?
(2)在整个DNA分子中(A+G)/(T+C)=?
(3)若一条链中(A+T)/(G+C)=0.7,则互补链中(A+T)/(G+C)=?
(4)在整个DNA分子中(A+T)/(G+C)=?
第二章蛋白质
名词解释(英语解释)
两性离子(dipolarion)必需氨基酸(essentialaminoacid)
等电点(isoelectricpoint,pI)非蛋白质氨基酸(nonproteinaminoacid)
构型(configuration)与构象(conformation)蛋白质的一级结构(proteinprimarystructure)
蛋白质的二级结构(proteinsecondarystructure)结构域(domain)
蛋白质的三级结构(proteintertiarystructure)蛋白质的四级结构(proteinquaternarystructure)
疏水键(hydrophobicbond)盐析(saltingout)
蛋白质的变性(denaturation)蛋白质的复性(renaturation)
凝胶电泳(gelelectrophoresis)层析(chromatography)
填空题
1.蛋白质多肽链中的肽键是通过一个氨基酸的___基和另一氨基酸的____基连接而形成的。
2.大多数蛋白质中氮的含量较恒定,平均为___%,如测得1克样品含氮量为10mg,则蛋白质含量为___%。
3.在20种氨基酸中,酸性氨基酸有___和____2种,具有羟基的氨基酸是___和___,能形成二硫键的氨基酸是___。
4.蛋白质中的___、___和___3种氨基酸具有紫外吸收特性,因而使蛋白质在280nm处有最大吸收值。
5.精氨酸的pI值为10.76,将其溶于pH=7的缓冲液中,并置于电场中,则精氨酸应向电场的___方向移动。
6.组成蛋白质的20种氨基酸中,含有咪唑环的氨基酸是___,含硫的氨基酸有___和___。
7.蛋白质的二级结构最基本的有两种类型,它们是___和___。
8.α-螺旋结构是由同一肽链的___和___间的___键维持的,螺距为___,每圈螺旋含___个氨基酸残基,每个氨基酸残基沿轴上升高度为___。
天然蛋白质分子中的α-螺旋大都属于___手螺旋。
9.在蛋白质的α-螺旋结构中,在环状氨基酸___存在处局部螺旋结构中断。
10.球状蛋白质中有___侧链的氨基酸残基常位于分子表面而与水结合,而有___侧链的氨基酸位于分子的内部。
11.氨基酸与茚三酮发生氧化脱羧脱氨反应生成___色化合物,而___与茚三酮反应生成黄色化合物。
12.维持蛋白质的一级结构的化学键有___和___;维持二级结构靠___键;维持三级结构和四级结构靠___键,其中包括___、___、___和___。
13.稳定蛋白质胶体的因素是___和___。
14.GSH的中文名称是___,它的活性基团是___,它的生化功能是___。
15.加入低浓度的中性盐可使蛋白质溶解度___,这种现象称为___,而加入高浓度的中性盐,当达到一定的盐饱和度时,可使蛋白质的溶解度___并___,这种现象称为___,蛋白质的这种性质常用于___。
16.用电泳方法分离蛋白质的原理,是在一定的pH条件下,不同蛋白质的___、___和___不同,因而在电场中移动的___和___不同,从而使蛋白质得到分离。
17.氨基酸处于等电状态时,主要是以___形式存在,此时它的溶解度最小。
18.鉴定蛋白质多肽链氨基末端常用的方法有___和___。
19.测定蛋白质分子量的方法有___、___和___。
20.谷氨酸的pK1(α-COOH)=2.19,pK2(α-NH+3)=9.67,pKR(R基)=4.25,谷氨酸的等电点为___。
21.将分子量分别为a(90000)、b(45000)、c(110000)的三种蛋白质混合溶液进行凝胶过滤层析,它们被洗脱下来的先后顺序是___。
问答
1、蛋白质有哪些重要生物学功能?
2、什么是蛋白质的一级结构?
为什么说蛋白质的一级结构决定其空间结构?
3、什么是蛋白质的空间结构?
蛋白质的空间结构与其生物功能有何关系?
4、什么是蛋白质的变性?
变性的机制是什么?
举例说明蛋白质变性在实践中的应用。
?
5、下列试剂和酶常用于蛋白质化学的研究中:
CNBr、异硫氰酸苯酯、丹黄酰氯、脲、6mol/LHCl、β-巯基乙醇、水合茚三酮、过甲酸、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶。
其中哪一个最适合完成以下各项任务?
(1)测定小肽的氨基酸序列。
(2)鉴定肽的氨基末端残基。
(3)不含二硫键的蛋白质的可逆变性;如有二硫键存在时还需加什么试剂?
(4)在芳香族氨基酸残基羧基侧水解肽键。
(4)在蛋氨酸残基羧基侧水解肽键。
(5)在赖氨酸和精氨酸残基羧基侧水解肽键。
第三章酶
名词解释(英语解释)
米氏常数(Km值)底物专一性(substratespecificity)
辅基(prostheticgroup)单体酶(monomericenzyme)
多酶体系(multienzymesystem)激活剂(activator)
抑制剂(inhibitorinhibiton)必需基团(essentialgroup)
变构酶(allostericenzyme)同工酶(isozyme)
诱导酶(inducedenzyme)酶原(zymogen)
酶的比活力(enzymaticcompareenergy)活性中心(activecenter)
NAD+(nicotinamideadeninedinucleotide)FAD(flavinadeninedinucleotide)
THFA(tetrahydrofolicacid)NADP+(nicotinamideadeninedinucleotidephosphate)
FMN(flavinmononucleotide)CoA(coenzymeA)
填空题
1.酶是___产生的,具有催化活性的___。
2.酶具有___、___、___和___等催化特点。
3.影响酶促反应速度的因素有___、___、___、___、___和___。
脲酶只作用于尿素,而不作用于其他任何底物,因此它具有___专一性;甘油激酶可以催化甘油磷酸化,仅生成甘油-1-磷酸一种底物,因此它具有___专一性。
4.与酶催化的高效率有关的因素有___、___、___、___、___等。
5.丙二酸和戊二酸都是琥珀酸脱氢酶的___抑制剂。
6.变构酶的特点是:
(1)___,
(2)___,它不符合一般的___,当以V对[S]作图时,它表现出___型曲线,而非___曲线。
它是___酶。
7.一条多肽链Asn-His-Lys-Asp-Phe-Glu-Ile-Arg-Glu-Tyr-Gly-Arg经胰蛋白酶水解可得到个多肽。
8.全酶由和组成,在催化反应时,二者所起的作用不同,其中___决定酶的专一性和高效率,___起传递电子、原子或化学基团的作用。
9.辅助因子包括___、___和___等。
其中___与酶蛋白结合紧密,需要___除去,___与酶蛋白结合疏松,可以用___除去。
10.根据国际系统分类法,所有的酶按所催化的化学反应的性质可分为六类___、___、___、___、___和___。
11.根据国际酶学委员会的规定,每一种酶都有一个唯一的编号。
醇脱氢酶的编号是EC1.1.1.1,EC代表___,4个数字分别代表___、___、___和___。
12.酶的活性中心包括___和___两个功能部位,其中___直接与底物结合,决定酶的专一性,是发生化学变化的部位,决定催化反应的性质。
13.酶活力是指___,一般用___表示。
14.通常讨论酶促反应的反应速度时,指的是反应的___速度,即___时测得的反应速度。
15.pH值影响酶活力的原因可能有以下几方面:
影响___,影响___,影响___。
16.温度对酶活力影响有以下两方面:
一方面___,另一方面___。
17.酶促动力学的双倒数作图(Lineweaver-Burk作图法),得到的直线在横轴的截距为___,纵轴上的截距为___。
18.判断一个纯化酶的方法优劣的主要依据是酶的___和___。
19.根据维生素的___性质,可将维生素分为两类,即___和___。
20.叶酸以其___起辅酶的作用,它有___和___两种还原形式,后者的功能作为___载体。
21.生物素可看作由___,___,___三部分组成,是___的辅酶,在___的固定中起重要的作用。
22.维生素C是___的辅酶,另外还具有___作用等。
问答
1、简述酶作为生物催化剂与一般化学催化剂的共性及其个性?
2、试指出下列每种酶具有哪种类型的专一性?
(1)脲酶(只催化尿素NH2CONH2的水解,但不能作用于NH2CONHCH3);
(2)β-D-葡萄糖苷酶(只作用于β-D-葡萄糖形成的各种糖甘,但不能作用于其他的糖苷,例如果糖苷);
(3)酯酶(作用于R1COOR2的水解反应);
(4)L-氨基酸氧化酶(只作用于L-氨基酸,而不能作用于D-氨基酸);
(5)反丁烯二酸水合酶[只作用于反丁烯二酸(延胡索酸),而不能作用于顺丁烯二酸(马来酸)];
(6)甘油激酶(催化甘油磷酸化,生成甘油-1-磷酸)。
3、称取25mg蛋白酶配成25mL溶液,取2mL溶液测得含蛋白氮0.2mg,另取0.1mL溶液测酶活力,结果每小时可以水解酪蛋白产生1500μg酪氨酸,假定1个酶活力单位定义为每分钟产生1μg酪氨酸的酶量,请计算:
(1)酶溶液的蛋白浓度及比活。
(2)每克纯酶制剂的总蛋白含量及总活力。
4、Vmax与米氏常数可以通过作图法求得,试比较V~[S]图,双倒数图,V~V/[S]作图,[S]/V~[S]作图及直接线性作图法求Vmax和Km的优缺点?
5、
(1)对于一个遵循米氏动力学的酶而言,当[S]=Km时,若V=35μmol/min,Vmax是多少μmol/min?
(2)当[S]=2×10-5mo/L,V=40μmol/min,这个酶的Km是多少?
(3)计算[S]=1.0×10-6mol/L和[S]=1.0×10-1mol/L时的v?
(4)假如每一个反应体系中酶浓度增加到4倍时,Km,Vmax是多少?
6、在很多酶的活性中心均有Ser与His残基参与,请解释?
7、举例说明酶抑制剂在临床医学中的应用。
第四章生物氧化8/10/3
名词解释(英语解释)
生物氧化(biologicaloxidation)呼吸链(respiratorychain)
三羧酸循环(TCAcycle)解偶联剂(uncouplingagent)
氧化磷酸化(oxidativephosphorylation)磷氧比P/O(P/O)
底物水平磷酸化(substratelevelphosphorylation)能荷(energycharge)
糖酵解(glycolysis)光合作用(photosynthesis)
填空题
1.生物氧化有3种方式:
___、___和___。
2.生物氧化是氧化还原过程,在此过程中有___、___和___参与。
3.△G0'为负值是___反应,可以___进行。
5.△G0'与平衡常数的关系式为___,当Keq=1时,△G0'为___。
6.生物分子的E0'值小,则电负性___,给出电子的倾向___。
7.生物体内高能化合物有___、___、___、___、___、___等类。
8.在无氧条件下,呼吸链各传递体都处于___状态。
9.NADH呼吸链中氧化磷酸化的偶联部位是___、___、___。
10.举出三种氧化磷酸化解偶联剂___、___、___。
11.生物氧化是___在细胞中___,同时产生___的过程。
12.高能磷酸化合物通常指水解时___的化合物,其中最重要的是___,被称为能量代谢的___。
13.真核细胞生物氧化的主要场所是___,呼吸链和氧化磷酸化偶联因子都定位于___。
14.以NADH为辅酶的脱氢酶类主要是参与___作用,即参与从___到___电子传递作用;以NADPH为辅酶的脱氢酶类主要是将分解代谢中间产物上___的___转移到___反应中需电子的中间物上。
15.在呼吸链中,氢或电子从___的载体依次向___的载体传递。
典型的呼吸链包括___和___两种,这是根据接受代谢物脱下的氢的___不同而区别的。
16.解释氧化磷酸化作用机制被公认的学说是___,它是英国生物化学家___于1961年首先提出的。
17.化学渗透学说主要论点认为:
呼吸链组分定位于___内膜上。
其递氢体有___作用,因而造成内膜两侧的___差,同时被膜上____合成酶所利用、促使ADP+Pi→ATP
18.每对电子从FADH2转移到___必然释放出2个H+进入线粒体基质中。
完成反应方程式
1、4-细胞色素a3-Fe2++O2+4H+→4-细胞色素a3-Fe3++(),催化此反应的酶是:
()
2、NADH+H++0.5O2+3ADP+()→NAD++3ATP+4H2O
问答(解题要点)
1、简述电子传递和氧化磷酸化场所、作用常见的呼吸链电子传递抑制剂有哪些?
它们的作用机制是什么?
2、氰化物为什么能引起细胞窒息死亡?
其解救机理是什么?
3、描述三羧酸循环作用、场所、伴随的能量代谢情况以及参与的其它生物合成途径(氨基酸、糖、核苷酸)。
4、ATP生成有哪几种方式?
试述ATP生成的主要过程。
在体内ATP有哪些生理作用?
5、有人曾经考虑过使用解偶联剂如2,4-二硝基苯酚(DNP)作为减肥药,但很快就被放弃使用,为什么?
6、某些植物体内出现对氰化物呈抗性的呼吸形式,试提出一种可能的机制。
7、什么是铁硫蛋白?
其生理功能是什么?
8、何为能荷?
能荷与代谢调节有什么关系?
9、氧化作用和磷酸化作用是怎样偶联的?
第五章中心法则
名词解释(英语解释)
半保留复制(semiconservativereplication)不对称转录(asymmetrictrancription)
逆转录(reversetranscription)冈崎片段(Okazakifragment)
复制叉(replicationfork)半不连续复制(semidiscontinuousreplication)
RNA引物(RNAprimer)领头链(leadingstrand)
随后链(laggingstrand)IF(initiationfactor)
EF(elongationfactor)RF(releasefactor)
hnRNA(heterogeneousnuclearRNA)fMet-tRNAf
内含子(intron)DNA拓扑异构酶(DNAtopoisomerase)
泛素蛋白(Ubiquitin)信号肽(signalpeptide)
填空题
1.DNA复制是定点双向进行的,___股的合成是___,并且合成方向和复制叉移动方向相同;___股的合成是___的,合成方向与复制叉移动的方向相反。
2.岗崎片段的生成是因为DNA复制过程中___和___的不一致。
3.大肠杆菌RNA聚合酶全酶由___组成;核心酶的组成是___。
参与识别起始信号的是___因子。
4.DNA合成时,先由引物酶合成___,再由___在其3′端合成DNA链,然后由___切除引物并填补空隙,最后由___连接成完整的链。
5.以RNA为模板合成DNA称___,由___酶催化。
6.基因有两条链,作为模板指导转录的那条链称___链。
7.转录的三个阶段:
___、___、___;一个转录单位一般应包括___序列、___序列和___顺序。
8.在真核细胞中,基因中___被___分隔,而在成熟的mRNA序列被拼接起来。
编码蛋白质的基因多为___。
编码的序列还保留在成熟mRNA中的是___,编码的序列在前体分子转录后加工中被切除的是___。
9.蛋白质的生物合成是以___作为模板,___作为运输氨基酸的工具,___作为合成的场所。
10.细胞内多肽链合成的方向是从___端到___端,而阅读mRNA的方向是从___端到___端。
11.蛋白质的生物合成通常以___作为起始密码子,有时也以___作为起始密码子,以___,___,和___作为终止密码子。
某个tRNA的反密码子是GGC,它可识别的密码子为___。
12.SD序列是指原核细胞mRNA的5ˊ端富含___碱基的序列,它可以和16SrRNA的3ˊ端的___序列互补配对,而帮助起始密码子的识别。
13.原核生物蛋白质合成的起始因子(IF)有___种,延伸因子(EF)有___种,终止释放(RF)有___种;而真核生物细胞质蛋白质合成的延伸因子通常有___种,终止释放因子有___种。
14.原核生物蛋白质合成中第一个被掺入的氨基酸是___。
15.已发现体内大多数蛋白质正确的构象的形成需要___的帮助。
16.基因表达包括___和___。
17.遗传密码的特点有方向性、连续性___和___。
18.蛋白质翻译后的加工方式有___、___、___、___、___。
19.启动子一般可分为___、___、___三个区段。
20.写出下列核苷酸符号的中文名称:
cDNA___、dNTP___、cAMP___、hnRNA___。
在真核生物中DNA复制的主要酶有___。
问答
1.简述tRNA的结构特征及其作用与作用机制。
2.比较原核生物与真核生物基因表达调控的异同点。
3.遗传密码的性质。
4.简述转录的基本过程。
5.简述原核和真核细胞在蛋白质翻译过程中的差异。
6.试比较原核和真核细胞的mRNA的异同。
7.试比较复制与转录在模板、底物、聚合酶、碱基氢键配对等方面有何不同?
第六章基因表达调控
名词解释(英语解释)
操纵子(operon)阻遏物(repressor)
cDNACRP/CAP
回文序列(palindromicsequence)micRNA
信号肽(signalpeptide)上游启动子元件(upstreampromoterelement)
反式作用因子(trans-actingfactor)顺式作用元件(cis-actingelement)
限制性内切酶(restrictionenzyme)串联重复序列(tandemrepeatsequences)
转运RNA结构(thestructureoftransferribonucleicacid)内含子(intron)
ThetrpOperonSD序列((Shine-Dalgarnosequence)
RNA编辑(RNAediting)
填空题
1.在分解代谢阻遏中调节基因的产物是___,它能与___结合而被活化,帮助___与启动子结合,促进转录进行。
2.乳糖操纵子的诱导物是___,色氨酸操纵子的辅阻遏物是___。
3.色氨酸是一种___,能激活___,抑制转录过程。
4.乳糖操纵子的结构基因包括___、___和___。
5.操纵子包括___,___和___。
6.人类基因组的概念,内容和意义___、___、___┉
7.近年分子生物学的进展___、___和___┉
问答
1.简述乳糖操纵子的正负调控机制。
2.操纵子中的诱导剂和辅阻遏对基因表达的调控有何不同?
3.细胞内第二信使包括哪些物质?
它们是怎样产生的,有何作用?
4.PCR和细胞内DNA复制两者有哪些主要的相同点和不同点?
5.真核基因在原核表达的难题及对策。
6.DNA结合域/激活域的几种结构。
7.人类基因组计划已经完成,今后生物化学与分子生