Graphpad Prism5简易制作8种图.docx
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GraphpadPrism5简易制作8种图
用 Graphpad Prism5 快速做出 8 种符合 SCI 投稿要求的统计图
1. 折线图
折线图作为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因
此每个数据点都有一个相应的 X 轴值和 Y 轴值,所以我们在用 graphpad 做折线图时在数据表类
型的选择上一般选 XY 图(XY graphs)。
如下文实例。
1.1 根据 Table1 的 1 组原始数据(4 个样本在 4 个时间点分别测得的 OA 值)做折线图
Time (days)
OA
0.
4.
24.
48.
0.942
0.717
0.408
0.451
0.846
0.836
0.367
0.409
0.691
0.653
0.342
0.335
0.515
0.483
0.231
0.196
打开 Graphpad prism 5 软件,选择 XY 图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要
软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的 Y 值的样本数是多少,这边的样本数是 4,因
此我们把样本数设为 4,如下图
在 Data 分栏中将数据粘贴进去,如下图
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,
如下图一幅漂亮的折线图就做好了。
1.2 根据 Table2 的原始数据(治疗组和对照组的 4 个样本在 4 个时间点分别测得的 OA 值做折线
图
Time (days)
Control
Treated
0.0.717
4.0.836
0.942
0.527
0.691
0.988
0.303
0.321
0.942
0.717
0.846
0.836
0.691
0.653
0.515
0.483
24.
48.
0.653
0.483
0.401
0.342
0.691
0.776
0.169
0.917
0.408
0.451
0.367
0.409
0.342
0.335
0.231
0.196
打开 insert 菜单的 New Data Table 功能,加入一张新的数据表,见下图
仍然选择 XY 图(XY graphs),告诉软件样本数是 4
在 Data 栏中输入数据
软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图
1.3 用已经处理好的 1 组数据做折线图
如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism 也可以帮
你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用
Table3 的 1 组数据做折线图
Table3
OA
Time (days)
Mean
SD
0.
4.
24.
48.
1.000
1.725
2.133
1.859
0.17
0.21
0.41
0.56
新建一个数据表,仍然选择 XY 图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
在 data 栏中粘贴数据,如下图
打开 Graphs 栏目下的 Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出
下图所示的折线图了
1.4 用已经处理好的 2 组数据做折线比较图
如果要用 Table4 所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和 1.3 的一样。
Control
Treated
Time (days)
Mean
SD
Mean
SD
0.
4.
24.
48.
1.000
1.725
2.133
1.859
0.17
0.21
0.41
0.56
3.604
2.534
3.381
3.913
0.31
0.43
0.74
0.93
仍然选择 XY 图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
将数据粘贴进去
软件即时生成的图如下图所示
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
2. 柱状图
柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的 X 轴对应的是
组别而不是数值,因此在 GraphPad 分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
2.1 根据 Table 5 的原始数据做柱状图
Table 5
Sample1
Sample2
Sample3
Sample4
Control A
0.942
0.846
0.691
0.515
Control B
0.717
0.836
0.653
0.483
选择 Column graphs 栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需
选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
在 Data 分栏中输入以下数据
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图
2.2 根据 Table6 的原始数据做两组数据比较的柱状图
Table 6
Group A
Group B
Control
0.9420.846
Treated0.4080.367
0.691
0.342
0.515
0.231
0.717
0.451
0.836
0.409
0.653
0.335
0.483
0.196
这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择 grouped 栏,图表类型选择柱状图,因为 Grouped
栏并不是像 Column graphs 栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样
本数是 4,因此我们相应地设置样本为 4,见下图。
在 Data 分栏中输入以下数据
软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
2.3 如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到 Graphpad,现在我们用 Table7
中的数据做一个柱状图
Table 7
Control
A
B
C
D
Mean
1.000
1.725
2.133
1.859
SD
0.17
0.21
0.41
0.56
仍然选择 Grouped 栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
软件及时生成柱状图,如下图
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
用 Table 8 的数据做成两组比较的柱状图
Control
Treated
A
B
C
D
1.000
1.725
2.133
1.859
0.17
0.21
0.41
0.56
3.604
2.534
3.381
3.913
0.31
0.43
0.74
0.93
操作步骤和 2.3 一样,只需多输入一组数据,仍然选择 Grouped 栏,告诉软件你输入的值是已经
计算好的,如下图
在 data 栏中输入数据
软件即时生成的图如下图
折线图和柱状图的处理都讲完了,在 graphpad 数据表类型的选择上小编总结出了 2 条规律
一. 折线图,散点图这种有一一对应的 X,Y 值一般都选择 XY 栏
二. 柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择 column 栏,处理加工过的数据一
般选择 group 栏。
3. 组合和导出图片
点击 layout 栏,出现下图所示界面
根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是 6 张图分成 3 排排列
将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
然后导出图片
点击 File 目录下的 Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关 SCI 杂志要求的格式,分辨
率和宽度,如下图
点击 ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
4.压缩图片
由于导出的图片文件太大,不利于投稿时的网络传输,我们需要使用 photoshop 对图片进
行无损压缩。
我们用 photoshop 打开这张刚导出的图片。
用 photoshop 打开图片后你可以做一些自己需
要癿修改,这个就看你的需要了。
然后我们点击”文件“ -”存储“(或存储为)。
保存的时候我们依然选择 tiff 格式。
注意如果你在 photoshop 中修改过图片,特别是新建过图
层的话,保存的时候要确保下面癿”图层“前面的勾没有勾上(保存图层会让图片大小增大不便
于网络传输)。
保存癿时候会跳出 tiff 选项,如下图。
这里我们选择 LZW 压缩。
(这是一种无损压缩。
你可以形象癿理解为不压缩前,图片连续癿白色部分有比如 10000 个像素,要连续记录一万次。
而采用 LZW 压缩癿时候图片采叏另外一种记录方式”接下来有一万个像素“。
通过这样的方式
可以大大的减少这种有很大白色面积的线条图的大小。
当然啦,只是便于你理解。
真实的压缩算
法不是这样的。
图表类图、黑白的图、都建议用 LZW 压缩方式)
保存后我们看看现在的图片吧,如下图。
大小压缩到 241KB,依然是尺寸上 3734*3024 像
素。
由于是无损压缩,图片质量是没有任何损失的。