高血压病中医分型的代谢组学研究 3.docx
《高血压病中医分型的代谢组学研究 3.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《高血压病中医分型的代谢组学研究 3.docx(15页珍藏版)》请在冰豆网上搜索。
高血压病中医分型的代谢组学研究3
目的:
中国传统医学(中医)在中国已经实行了几千年年,提供了一个独特的理论和实际应用—可以治疗疾病。
在中医理论中,该概念的“整体”和使用“系统”比隔离是重要的概念,它也适合系统生物学理论。
在本研究中,我们试图气相色谱/质谱的代谢组学方法发现有助于区分高血压中医证型
方法:
中医将原发性高血压的三种证型:
肝阳上亢,痰湿壅盛,阴虚阳亢型。
血清代谢物组剖面健康人和高血压患者获得使用气相色谱/质谱分析。
主成分分析(主成分分析
张力患者获得使用气相色谱/质谱全球分析—
姐姐。
主成分分析(常设仲裁法院),偏最小二乘
判别分析(偏多巴胺),andmahlanobis
距离(博士)是适用于促进代谢
数据分化和prediction.results:
使用
主成分分析和偏多巴胺,它能够区分也不—
正常血压血清样品从这些中医
综合征类型,而没有歧视的三
高血压病中医证型各。
furthermd分析不仅有助于鳍分化,更明确的进展展览,
这三个综合征types.conclusion:
本试验
研究表明,代谢组学方法可能是一个
强大的工具,探索科学的本质
tcmtheory。
关键词代谢综合征类型;超—
张力;气相色谱/质谱法
与现代生命科学发展的,
systembiology涉及新兴领域的应用
基因组学,蛋白质组学,代谢组学,生物信息学
等来研究生物有机体在各级,
从分子,通过细胞的行为—
铝。
其目的是了解生物过程的整体
系统而不是孤立的部分[1]。
中国传统
医学(中医)的一个重要部分是生命科学,和
一个大型复杂系统。
在中医理论,概念
使用的the'whole'andof'system'ratherthan孤立
是重要的概念,它符合系统生物学
理论。
因此,有理由相信中医
理论在本质上是系统生物学与股权结构的关系,
中医现代化是依赖于发展
和系统生物学的应用。
代谢组学,作为系统生物学的一个重要组成部分,将有用的建模工具类分类和预测生理和病理
从代谢概况体液如
尿[2,3]和[4],从剖面的完整的组织
和组织提取物[5]。
事实上,代谢组学的现在广泛应用于研究疾病的诊断,基因的功能,药物发现,毒理学等。
被
了解之间的内在关系中医理论
和系统生物学,一些研究者开始讨论未来的应用代谢组学方法中医理论的科学验证。
然而,没有
单一的报告有关的代谢组学方法,中医
研究已发现在目前的文献。
公关—
介绍研究因此,旨在确定是否
代谢组学的战略是有益的和强大的差异—
中药的辨证分型,采用高压作为一个
模型。
根据中医理论,高血压可
一般分为四种类型,namelyhy—
peractivity肝yangtype
(一)(上火
活),谭石勇shengtype(乙)(湿痰站—
姐姐),阴徐扬kangtype(丙)(阴虚车—
过量阳),andyinyangliangxutype(四)(匮—
细胞bothyinandyang)。
这四个综合征类型
代表不同发展阶段的高血压
在早期阶段,提出了主要的上升
肝火与hyperacitivity的liveryang,在中间
withyindeficiency阶段的肝脏和肾脏的陪同下
与阳,在后期阶段的不足
混合的bothyinandyangand痰湿
血瘀[6]。
然而,从tcmsyndrometypes'theory
概括和总结的临床经验
和regularityfor长期是有益的,为临床诊断—
治疗高血压和治疗。
不过。
其科学内涵仍有待发现
经现代科学手段。
近年来,研究人员竭力试验
探索中医证候的科学内涵
类型的高血压病,从不同的角度
意见包括基因多态性,已知的生物化学
指标等[7]。
然而,这些研究
然而,有限的考虑而不是孤立的—
thology。
在本研究中,我们使用气相色谱/质谱为基础
代谢物组学方法确定生化
概况differenttcmsyndrome类型的高血压,
和fortestingwhetherthe代谢组学方法是战俘—
后的分化oftcmsyndrome类型。
1材料和方法
1.1-双(三甲硅基)三氟化学品—
三甲基氯硅烷,乙酰胺,硬脂酸甲酯[2H3]-肉豆蔻酸(是),和甲氧胺盐酸盐—
骑都购买fromsigma/奥德里奇公司购买—
青衣的所有化学品都是超过98%。
1.2参与者和血液样本收集的渴望
20名健康志愿者和33例高血压—
血压(高血压)被纳入本研究。
所有的
临床诊断和血液样本集合进行欺诈—
管道在心血管系江苏临—
vincial中医医院(南京
中国),和所有的实验被批准了
当地的伦理委员会。
高血压病患者—
sionwere诊断根据他/ishguideline
为管理ofhypertension[11],和concurrentl
经历了tcmsyndrome类型分化的车—
periencedtcmdoctors。
病人,谁收到任何药物
在最近的3天,被排除
这项研究。
三毫升的血液样本,收集
每个主题,离心,获得serumwhichwa
立即保存在-80℃之前的分析。
1.3个样品制备气相色谱/质谱分析,10
我血清从每个样品加入到一个eppendo
是预装了400μ升甲醇含有—
2.5μ克[2H3]-肉豆蔻酸为内标,佛—
由于搅拌10分钟,然后放在冰浴中
1小时后,混合液离心一
22500×gfor10分钟和200μ乐福的supernatantwa
转移到气相色谱小瓶蒸发至干下
n2at室温。
当时我的残留—
thoxymated30μ升15毫克/毫升甲氧胺盐酸盐—
骑在吡啶的16小时,加入30μ衍生蛋白
methyl-n-(三甲硅基)三氟乙酰胺(tmsfa
含1%三甲基氯硅烷为trimethylsilylatio
1小时。
衍生样本进行重组的我
40μln-hexadecane与硬脂酸甲酯在15μ克/mlfo
系统检查。
1.4气相色谱/质谱法分析微量的衍生物
一微升的衍生
样品注入splitlessly到一个Finigan气相色谱法结合质谱(TRACEDSQ)(美国Thermofinigan,)。
GC是配备了一个10
米×0.25mm内径,熔融石英毛细管柱,这
化学键0.25DB1-MS固定
阶段(J&Wscientific,福尔松,加利福尼亚,美国)。
进样口温度为270℃,隔垫吹扫流量
20毫升/分钟,在60秒后打开和清除。
通过色谱柱的气体流量为1毫升/分钟。
“
列的初始温度保持在70℃2分钟。
然后从70到320℃,在温度升高
速率20℃/分钟,2分钟举行。
传输线温度270℃,离子源温度为250
℃。
电离达到70eV的电子束
2.0mA电流。
从50到650m/zwere群众
加速电压时获得的议会模式
打开后的170小号的溶剂延迟
1.5气相色谱/质谱数据处理数据处理
通过xcalibur软件(thermofinigan,美国)。
峰
信噪比(信噪比)的比例低于10被排除。
稀土—
张力时间调整内部标准,迷你—
单相运行错误。
保留指数为每个峰
化合物的保留时间的计算比较
对那些烷烃系列(c8-c40,相应的
保留指数值从800到4000)。
获得交流—
牧师的峰面积的和具体峰/组件—
磅,每一个quantmassescomponentwere
指定的数据进行再加工。
面积
每个峰正常化的内部标准,
[2H3]-肉豆蔻酸,在多元统计分析—
姐姐。
所有compoundswere通过比较确定的
质谱和保留indexwith现有李—
braries,即美国图书馆2(2001年1月31日),
威利图书馆,内部质谱库数据库
建立了中心的发展与研究
药物代谢和药代动力学,中国医药—
ceutical大学。
1。
6个多变量统计分析多元
统计分析(mvsa)进行了使用西姆卡—
11软件(umetrics,于默奥,瑞典)。
逸
矩阵构造的观察/样品在山口—
umns和峰作为变量行。
它可以代表—
提出了在k维空间(如钾是平等的
多变量),并预测和减少
一些主要组成部分,描述了最大
变化的不同群体或样品。
主成分—
热分析(主成分分析)是用来计算的基本模型
和overviewof数据。
偏最小二乘问题—
在latentstructures与判别分析(偏多巴胺)
用于计算模型的区分群体或
类,在此,分离之间的健康控制
高血压病患者,其中threetcmsyndrome类型。
駅—
tistically不同peakswere计算bypls-damodel
有0.99的置信区间和意义水平
0.01。
交叉验证与七个交叉验证
组是使用数的确定
组件mahlanobis距离(博士)的方法是美联社—
使用的计算模型的分类三中医
综合征类型根据shortestmd[12]。
2结果与讨论
2.1气相色谱/质谱分析血清样本吗爸爸—
病人和健康对照的基础上,以前的—
发达的方法[13],气相色谱/质谱参数进行优化—
后为芬妮根气相色谱/质谱系统在本
书房。
该系统可以检测一个大数字—
误码率峰值从气相色谱/质谱chromatogramwithin16分钟
分析周期。
典型的气相色谱/mstic色谱
血清样品进行了图1所示为ehpatient。
六十
峰高强度呈现在ehand健康
控制样品进行鉴定和峰面积
集成furthermvsa。
2.2个代谢物谱的高血压患者和控制数据矩阵的峰面积从
两个高血压和控制受到主成分分析。
主成分分析是一种
常规统计方法在代谢组学的应用—
与之间的关系的样本/意见。
方便的可视化的数据结构,主成分分析
可以减少大量的变量到一个较小的
一些无关变量,即所谓的原则—
帕尔组件。
第一主成分解释
最大的变化数据,二主
组件是独立的(正交)第一
其次,部分解释了变异的
数据很快。
有2种阴谋的主成分分析。
1
“几十块”的意见,或样品。
其他的
is'loadingplots'for变量,或光谱峰。
每个点上的代谢组学分数表示法
所有变量的数据中获得一个频谱,这里60
变量。
因此,所有的样本点群
在一起有更多类似的光谱(因而更西米—
拉尔生化化妆)比那些分开站立。
然而,地块应仔细审查,包括或丢弃
特别的,从大多数自
离群通常有负面影响的建模。
三严重的异常被发现在主成分分析综述
评分阴谋这一数据,因此从毛皮—
在建模。
根据交叉验证,一个five-com—
组件模型计算。
这个模型解释
68.1%(R2)和预测46.9%
(2)的数据,
与firstthree成分贡献53.4%车—
平和38.2%的预测,分别。
由于多样性的性别,年龄和生活习惯,
如食品,活动,采集的样本来自人类—
有可能greatvariationonmetabolome,常规的—
地很难计算好pcamodel到
单独的variousgroups因此找到了内在的差异—
推断群体之间。
偏多巴胺模型应用
数据加强这一分离的和健康的
控制。
目的是研制一种偏多巴胺
可分类别的观测—
在基础oftheirvariables(×)。
theymatrix恩—
代码由一套of'dummy'variables类成员,
在此一柱一和零每班。
然后plsmodel之间装有xvariables和人工—
社会的。
这样,一个判别平面中发现
该意见是根据分离
他们的阶级的成员。
一个非常好的部分
模型计算(图2),这可以解释97.8
和预测94.8%的数据,与第一组件
解释86.1%和83%的预测。
虽然这
是一个有效的模型显示内在差异性
和控制,分数阴谋提供小机械
深入的分子基础,并说明什