实验室常用液体配制标准操作规程Word文件下载.docx

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每1000mL加分析纯NaCl10g,蛋白胨10g,酵母粉5g,用ddH2O配制,再用10MNaOH调pH至(1000mL一般加450ul),高压蒸汽灭菌15min冷却后使用。

2、固体培养基:

LB培养基中加入琼脂至%,高压蒸汽灭菌15min后使用。

3、10%(g/V)氨苄青霉素钠(Ap):

注射用氨苄青霉素钠(粉末)50g溶于500ml无菌去离子水中,溶解后分装入4ml灭菌的EP管,全程超净工作台内操作,避免染菌,分装后-20度保存,培养细菌时做1000×

使用。

注:

如果购买的氨苄青霉素粉末不是无菌包装的,溶解后需用滤膜过滤除菌后再分装。

4、%(g/V)硫酸卡那霉素(Kan)

注射用硫酸卡那霉素(液体)通常是2ml/支,内含卡那霉素。

取25支药剂(50ml),加入450ml无菌去离子水中,分装入4ml灭菌的EP管,全程超净工作台内操作,避免染菌,分装后-20度保存,培养细菌时做1000×

如果购买的卡那霉素是粉末状的非无菌包装,溶解后需用滤膜过滤除菌后再分装。

5、细菌培养:

配制相应抗性培养基,每试管倒入3~4ml培养基(卡那霉素抗性培养采用标记试管),无菌牙签挑取单克隆至试管中,于37℃,220rpm培养。

剩余培养基做好抗性和日期标记,置于4℃保存。

6、化学感受态制备:

1)原理:

细菌处于容易吸收外源DNA的状态叫感受态,这时的菌细胞称为感受态细胞(Competentcell)。

将细菌置于0℃,低渗CaCl2溶液中时,菌细胞壁和膜的通透性增强,菌体膨胀成球型。

外源DNA与Ca2+形成抗DNase的羟基-钙磷酸复合物黏附于细胞表面,在经42℃短暂的热冲击处理(一般热休克90s)后能促进细胞吸收外源DNA复合物。

2)仪器、材料与试剂:

①超净工作台、低温离心机、摇床、-80℃冰箱,装液氮的泡沫盒及液氮、50ml的离心管2个,50ml的注射器及小过滤器各1个。

高压灭菌的纸张、透气膜、的EP管约350-500个,两块10cm的平皿板及接种环。

②TB缓冲液:

每200ml液体中含、、Kcl、PIPES。

(注:

在电子天平上的误差<

50mg,因在PH=易溶故先将其它药品用超纯水溶解,并用KOH及HCL调PH至。

在加入溶解后用超纯水定溶至相应的量,采用50ml的注射器及小过滤器过滤,一般储存在-20℃,时间<

25天,否则易被氧化颜色呈粉红。

③LB液体培养基:

参见前面介绍。

④LB固体培养基:

⑤1管DH5α的菌种

3)步骤:

①倒无抗性的固体培养板,用接种环沾取感受态甘油菌画线,置于37℃恒温培养箱中培养过夜。

②在超净台里采用小枪尖挑取培养板中的单克隆菌(菌落的大小约2~3mm)转接于200~250ml的LB液体培养基中,盖上透气膜。

③置于摇床上,18℃、200-250rpm速度摇约需3~5天,使OD600=~(对数生长期或对数生长前期)时开始制备。

④取出TB缓冲液及无菌的50ml离心管置于4℃冰浴中,预冷低温高速离心机(4℃、2500rpm、10min)。

⑤在50ml的离心管中加入约35ml-45ml的菌液,在4℃中冰浴10min。

⑥取出后放置于离心机上离心4℃、2500rpm、10min。

⑦弃上清液,在灭过菌的吸水纸上扣干(可重复多次收集菌体),先用约5~15ml的TB缓冲液重悬,再加至35ml的量(在冰上操作)冰浴10min。

⑧重复⑥+⑦的步骤一次。

⑨在35ml的TB缓冲液重悬后缓慢加入终浓度为7%的DMSO,混匀后在冰上冰浴10min。

⑩分装成100-150ul/管(的EP管)浸入液氮中速冻,分装约300多管后转移放置于-80℃冰箱保存。

4)转化效率的评估:

①采用小量质粒快转(冰浴10min→42℃热休克90s→冰浴2min→加无抗性LB液体培养基200ul→37℃摇床复温培养30min)。

②涂Kn、AP抗性板并做阴性对照(采用ddH20代替鉴定用的大提标准质粒),可以评价出是否有染菌、突变、转化效率。

③可以用Er2566等感受态做平行对照,评估其的生长快慢情况及转化效率的高低。

转化效率=转化子总数/质粒DNA加入量(1ug/ul),标准质粒为大提用的N31-EGFP。

5)注意事项:

①严格按照标准操作步骤,整个操作过程要注意温度(4℃冰上操作)且洁净的超净台环境防止污染。

②直接从-80℃取出的菌株培养致敏后比连续使用或4℃短期保存的细菌的转化率要高,一般是受体菌应处于对数生长期或生长前期即OD600=~。

③转化鉴定时,42℃准确热休克90s不要振荡,迅速置于冰上2min,按照标准操作步骤进行评估。

一般是感受态制备好在-80℃冰箱冻存2天后再做鉴定,更准确评估。

④质粒分子量的大小对转化效率也有影响,一般来说,随着质粒分子量的增大,其转化效率会相应地降低。

但当质粒在~时,所得的转化率基本一致。

7、电转感受态制备:

1)准备工作:

(提前一天)

1、250mlLB液体盛于1L三角瓶中;

2、1L超纯水;

500mL离心管两支;

10%甘油400mL;

3、离心管和200ul枪头若干

以上物品,120℃灭菌20分钟后置于4℃保存备用

4、电转杯经纯水洗净后这置于75%乙醇浸泡

5、挑ER2738菌单克隆,接种于4mlTet抗性的LB中,于37℃190rpm过夜振荡培养。

2)感受态制备:

1、取前一夜扩增的菌液3ml接种于250mlTet抗性LB中,37℃240rpm振荡培养,约2-3小时OD值可达(其间每1小时测一次OD,其值在之间均可,但在时效率最好);

2、将菌液置于冰水混合物中冷浴30分钟。

同时将前一夜置于4℃保存的物品取出,置于冰水混合物中冷浴30分钟,同时将离心机预冷到4℃;

3、将菌液全部转入500ml离心管中,2500rpm,4℃离心10分钟;

4、弃上清,向离心管中加入约100ml预冷的无菌水,在冰水混合物中摇晃瓶身,使沉淀充分悬起,然后再补加200ml无菌水,与离心机中4000rpm,4℃下离心10分钟;

5、重复步骤4两次;

6、以10%甘油代替无菌水重复步骤4一次;

在离心的过程中将离心管插入冰中预冷;

7、充分弃上清,加入200ul10%甘油,要换瓶身,使沉淀充分悬起,用预冷的枪头按100ul/支分装细胞于离心管中;

8、将分装好的细胞放入-80℃保存。

3)质量控制:

将电转杯从乙醇中取出,置于超净台中,用无菌风吹4小时

从-80℃取出一支感受态,立即放入冰盒里;

取1ul标准质粒(1ug/ml)加入感受态中,混匀后,加入预冷的电转杯中;

将电转条件设为,电击2-3秒,立即加入1mlSOC培养基并混匀;

将混合物转入离心管中于37℃,200rpm振荡恢复半小时;

用LB将培养物稀释至103涂于Amp固体培养基上,倒置于37℃温箱中,过夜培养。

计算效率:

效率=菌落数×

103×

103。

二、DNA操作系统

1、溶液I:

葡萄糖50mmol/L,EDTA10mmol/L,Tris-HCl25mmol/L,。

2、溶液II:

NaOHL,SDS1%,用ddH2O现配现用。

3、溶液Ⅲ:

取5mol/LNaAc60mL,冰乙酸,混合后加ddH2O至100mL。

4、酚-氯仿-异戊醇(25:

24:

1)

以25:

24:

1的比例混匀平衡酚、氯仿、异戊醇,保存于棕色玻璃瓶中,上覆一层Tris-Cl水相,4℃储存备用。

5、TE缓冲液:

10mmol/LTris-Cl,1mmol/LEDTA,灭菌后使用。

实验室中配有100×

的TE母液,用时可用ddH2O稀释成1×

使用液,灭菌后使用。

6、LCaCl2:

在适量纯水中溶解54g,定容至100mL,高压除菌后保存于4℃备用。

7、10×

DNA上样buffer:

母液:

以500ml为例:

蔗糖:

200g,溴酚蓝:

,取去离子水定容至500ml,完全溶解后放置于4℃保存。

*该母液配制完正常颜色为棕红色,颜色与pH值有关;

存储时间较长,每次使用时需摇匀,并注意是否长菌。

染料:

SYBERGreenI(MolecularProbe)10,000×

每次取50ul染料加入50ml母液中,充分摇匀。

分装于避光管中,即为10×

DNA上样buffer,配制好的buffer均需避光4℃保存。

*配制者需督促使用者及时将避光管放回4℃,并经常检查溶液存量,染料需提前订购。

8、RNaseA(DNasefree):

RNaseA干粉(Ameresco)溶解于L的CH3COONa(pH)中,使终浓度为1mg/ml,加热至100℃,15min,室温冷却。

用体积的1MTris-Cl调pH至后,分装,于-20℃冻存。

*500ul/管分装,供分子克隆实验使用;

3ml/管分装,供大提质粒使用。

RNaseA干粉需提前订购,及时检查使用情况。

三、蛋白质操作系统

(一)、电泳

1、30%丙烯酰胺

将29g丙烯酰胺和1gN,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中,于磁力搅拌器上搅拌至完全溶解。

补加水至终体积为100ml。

以μm孔径过滤溶液,去除不溶性杂质。

查证该溶液的pH值应不大于,置棕色瓶中保存于室温。

注意事项:

丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收,其作用具累积性。

称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具。

可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能会含有少量未聚合材料。

2、Tris-HCl

400ml水中溶解Tris-Base,浓盐酸调PH至后定容至500ml

3、Tris-HCI

4、10%SDS

900ml水中溶解100g电泳级SDS,加热至68℃助溶,加入几滴浓盐酸调节pH值至,加水定容至1L,分装备用。

5、10%过硫酸铵

称取过硫酸铵2g,适量水溶解后,定容至20mL,分装成1mL/管,于-20℃保存备用。

6、蛋白上样Buffer(6×

蛋白加样缓冲液)

称取十二烷基硫酸钠12g、溴酚蓝,1MTris-Cl(pH=30ml、甘油60ml、β-巯基乙醇5ml,定容至100ml。

7、蛋白质电泳buffer(5×

称取三羟甲基氨基甲烷、甘氨酸、十二烷基硫酸钠,在水中溶解并定容至1L。

(二)染色

1、染色液(考马斯亮蓝染液)

甲醇45%,冰乙酸10%,去离子水45%,加考马斯亮蓝R-250或G-250至%,过滤后使用。

2、10×

脱色液

称取KCl,加水定容至1L

3、蛋白快速银染所需溶液

(1)固定液:

400mL甲醇,500uL甲醛,加水定容至1L;

(2)20%AgNO3溶液:

20gAgNO3加水定容至100mL;

(3)Na2S2O3溶液:

Na2S2O3·

3H2O,加水定容至1L;

(4)显色液(未加甲醛):

30gNaCO3,20mL上述Na2S2O3溶液,加水定容至1L,(临用前加入甲醛,甲醛量如何确定?

)。

(5)柠檬酸:

C6H8O7·

3H2O,加水定容至1L。

(三)杂交

1、电转液:

称取Tris-Base,甘氨酸,

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