附录基因工程操作中常用的溶液和缓冲液生物学试验教学中心.docx

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附录基因工程操作中常用的溶液和缓冲液生物学试验教学中心

附录一分子生物学实验中常用的溶液和缓冲液

一、酸、碱和盐溶液的配制

盐酸(HCl,分子量36.5,重量百分比36%),1mol/L

按以下顺序混合:

912.5mLH2O;87.5mL浓盐酸。

盐酸(HCl,分子量36.5,重量百分比36%),0.25N/L

按以下顺序混合:

978.4mLH2O;21.6mL浓盐酸。

硫酸(H2SO4,分子量98.07,重量百分比96%),1mol/L

按以下顺序混合:

944.8mLH2O;55.6mL浓硫酸。

硝酸(HNO3,分子量63.02,重量百分比71%),1mol/L

按以下顺序混合:

937.5mLH2O;62.5mL硝酸

冰醋酸(CH3COOH,分子量60.05,重量百分比99.5%),1mol/L

按以下顺序混合:

942.5mLH2O;57.5mL冰醋酸。

乙酸(CH3COOH,分子量60.5,重量百分比36%),1mol/L

按以下顺序混合:

840.5mLH2O;159.5mL乙酸。

甲酸(HCOOH,分子量46.02,重量百分比90%),1mol/L

按以下顺序混合:

957.3mLH2O;42.7mL甲酸。

高氯酸(HClO4,分子量100.5,重量百分比70%),1mol/L

按以下顺序混合:

914.5mLH2O;85.5mL高氯酸。

氢氧化钾(KOH,分子量56.1),1mol/L

56.0gKOH溶解于1LH2O中。

氢氧化钠(NaOH,分子量40.0),1mol/L

将40.0gNaOH溶解于450mLH2O中,补加H2O至1L。

氢氧化钠(NaOH,分子量40.0),10mol/L

将400gNaOH溶于450mL水中,补加H2O至1L。

氨水(NH4OH,分子量35.0,重量百分比25%),1mol/L

按以下顺序混合:

924.9mLH2O;75.1mL氨水。

尿素(CH4N2O,分子量60.06),8mol/L

分批将480.5g尿素溶解在600mL蒸馏水中,加H2O定容只至1L,过滤灭菌。

氯化钠(NaCl,分子量58.5),5mol/L

将292.5gNaCl溶于450mLH2O中,补加H2O至1L。

氯化钾(KCl,分子量74.5),1mol/L

将74.5gKCl溶于450mLH2O中,补加H2O定容至1L。

氯化镁(MgCl2,分子量203.3),1mol/L

将203.3gMgCl2·6H2O溶于450mLH2O中,加H2O至1L,高压灭菌。

硫酸镁(MgSO4,分子量246.5),1mol/L

将246.5gMgSO4·7H2O溶于450mLH2O中,加H2O至1L。

氯化钙(CaCl2,分子量147.0或219.1),1mol/L

将147.0gCaCl2·2H2O溶于450mLH2O中,加H2O至1L,

或将219.1gCaCl2·6H2O溶于450mLH2O中,加H2O至1L。

二、各种常见缓冲液和平衡盐的配制

10%SDS(十二烷基硫酸钠盐):

称取100gSDS溶解在800mL水中,置68℃水浴中溶解,加数滴浓盐酸调pH到7.2,定容到1000mL,不需要消毒。

禽血DNA提取裂解液:

2mol/L尿素

100mmol/LTris·HCl(pH8.0)

1%SDS

100mmol/LEDTA

现配现用,无需灭菌。

配制方法:

600mL蒸馏水中,顺序加入120.12g尿素,待溶解后加入100mL1mol/LTris(pH8.0),溶解后加入37.2gNa2EDTA·2H2O,溶解后缓缓加入20%SDS50mL,定容至1000mL。

细菌DNA提取裂解液Ⅰ:

25mmol/LTris·HCl(pH8.0),10mmol/LEDTA(pH8.0),50mmol/L葡萄糖,使用前加溶菌酶(2mg/mL)。

细菌DNA提取裂解液Ⅱ(碱-1%SDS):

1%(W/V)SDS溶解在0.2mol/LNaOH中。

酚(phenol):

(1)现在有商品酚可直接购买,但是要注意酚的pH值。

(2)酚的纯化和配制(提取核酸用的酚溶液):

如果购的酚不纯,例如市售酚含有杂质,常呈粉色或淡黄色,需要重蒸二次:

用前从冰箱中取出,在68℃水浴锅中溶解结晶酚,160℃左右蒸馏后,冷却至0℃,加入8-羟基喹啉(100g酚加0.1g8-羟基喹啉),酚变为黄色,8-羟基喹啉是抗氧化剂,并能部分抑制核糖核酸酶,含8-羟基喹啉的酚用等体积0.5mol/LTris-Cl(pH8.0)磁力搅拌器搅拌20min,约半小时后两相完全分开,用真空抽液器尽可能吸去上层水相,再加入等体积的0.1mol/LTris(pH8.0)至酚中,搅拌20min,再吸去上层水相,反复数次,至酚相pH值大于7.8,加入0.2%β-巯基乙醇和0.1mol/LTris(pH8.0)分装在棕色瓶中,此酚溶液在平衡缓冲液覆盖下4℃可保存1个月,纯化和配制酚溶液都要戴手套,以免损伤皮肤。

酚—氯仿—异戊醇:

酚、氯仿和异戊醇按25∶24∶1(V/V)混合而成,加终浓度为0.1%的8-羟基喹啉,上面覆盖一层1cm厚的0.1mol/LTris(pH8.0),分成几份储存于-20℃,超过6个月则废弃。

它用来除去核酸中的蛋白质,异戊醇能消泡沫,有利于水相和有机相分开,氯仿—异戊醇混合液密闭瓶中保存。

Tris-Cl[Tris(三羟甲基氨基甲烷)],1mol/L

在800mL水中溶解121.1gTris,常温下用浓盐酸调至所需的pH值,常用pH7.4,或pH8.0,混匀后加水定容至1L,高压灭菌。

要获得所需的某一特定pH的0.1mol/LTris·HCl缓冲液的配制,可通过将一定数量的0.1mol/LHCl和100mL0.1mol/LTris溶液混合,如下表附-1所示:

表附-1特定pH的0.1mol/LTris·HCl缓冲液的配制所需的0.1mol/LHCl的毫升数

pH(25℃)

1.1mol/L

HCl(mL)

pH(25℃)

0.1mol/L

HCl(mL)

pH(25℃)

0.1mol/L

HCl(mL)

7.2

89.4

7.8

69.0

8.4

34.4

7.3

86.8

7.9

64.0

8.5

29.4

7.4

84.0

8.0

58.4

8.6

24.8

7.5

80.6

8.1

52.4

8.7

20.6

7.6

77.0

8.2

45.8

8.8

17.0

7.7

73.2

8.3

39.8

8.9

14.0

注意:

Tris缓冲液的pH值随温度变化较大,每1℃可引起大约0.028pH单位的变化。

Tris缓冲液的pH值应调校至待使用温度下的pH值。

因为Tris的pKa值为8.08,因此Tris不应该在大约pH7.2以下和pH9.0以上用作缓冲液。

Tris·HCl,pH6.8,4×:

在40mLH2O中溶解6.05gTris(0.5mol/L),用1mol/LHCl调至pH6.8,补加H2O至整体积100mL,用0.45µm滤膜过滤溶液后于4℃可保存1个月。

Tris•HCl,pH8.8,8×:

在300mLH2O中溶解182gTris(3mol/L),用1mol/LHCl调至pH8.8,补加H2O至整体积500mL,用0.45µm滤膜过滤溶液后于4℃可保存1个月。

Tris•HCl/SDS,pH8.8,4×:

在300mLH2O中溶解91gTris(1.5mol/L),用1mol/LHCl调至pH8.8,补加H2O至总体积500mL,用0.45µm滤膜过滤溶液,再加入2gSDS[0.4%(W/V)],于4℃可保存1个月。

Tris•HCl/SDS,pH6.8,8×:

在40mLH2O中溶解6.05gTris(0.5mol/L),用1mol/LHCl调至pH6.8,补加H2O至总体积100mL,用0.45µm滤膜过滤溶液,再加入0.4gSDS[0.4%(W/V)],于4℃可保存1个月。

Tris•HCl/SDS,pH8.45:

在300mLH2O中溶解182gTris(3.0mol/L),用1mol/LHCl调至pH8.45,补加H2O至总体积500mL。

用0.45µm滤膜过滤溶液,再加入1.5gSDS[0.3%(W/V),于4℃可保存1个月。

MOPS(3-吗啉代丙磺酸,分子量209.3)电泳缓冲液,10×:

0.4mol/LMOPS,pH7.0

0.5mol/LNaAc

0.01mol/LEDTA

HEPES(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-乙磺酸),分子量238.3)缓冲盐水(HeBS):

137mmol/LNaCl

5mmol/LKCl

0.7mmol/LNa2HPO4

6mmol/L葡萄糖

21mmol/LHEPES

调至pH7.05;因为这是一个关键参数,因此应仔细检测。

HEPES缓冲盐水(HeBS),2×:

16.4gNaCl(0.283mol/L),0.2gNa2HPO4(1.5mmol/L)

11.9gHEPES酸(0.023mol/L)加H2O至1L

用5mol/LNaOH调至pH7.05(精确的pH值对有效的转染特别重要),过滤除菌。

许多研究者常配制大量的2×HeBS,对溶液的转染效率进行检测后将其等量分装成50mL一份冻存。

从两批2×HeBS溶液获得的转染效率可能有较大的差异。

每一批新鲜配制的溶液都要检查其转染效率。

通过将0.5mL2×HeBS与0.5mL250mmol/LCaCl2溶液混合并旋涡振荡可快速检测2×HeBS溶液的转染效率。

在显微镜下即可很快观测到微小的沉淀形成。

溶液的转染效率必须一直检查,但如果在检查时溶液中不形成沉淀,这可能发生了某种错误。

Hanks平衡盐溶液(HBss):

5.4mmol/LKCl

0.3mmol/LNa2HPO4

0.4mmol/LKH2PO4

4.2mmol/LNaHCO3

1.3mmol/LCaCl2

0.5mmol/LMgCl2

0.6mmol/LMgSO4

137mmol/LNaCl

5.6mmol/LD-葡萄糖

0.02%(W/V)酚红(可选)

加H2O至1L并调pH至7.4

HBss可从Biofluids或Whittaker公司购买。

不含CaCl2和MgCl2的HBss可配制或购买。

其中可选用的成分通常对实验并无影响,但它们的出现可能对某一过程有损害。

针对单个的方案,决定是否使用这些成分并在“材料”栏中进行了推荐。

TE缓冲液,pH7.4,7.5,或8.0:

10mmol/LTris·HCl,pH7.4,7.5,或8.0

1mmol/LEDTA,pH8.0

TAE(Tris-乙酸)电泳缓冲液:

50×贮存液,pH约8.5:

242gTris碱

57.1mL冰醋酸

37.2gNa2EDTA·2H2O

加H2O至1L

1×工作液:

40mmol/LTris·Ac

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