中科院分子生物学试题.docx
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中科院分子生物学试题
2008年中科院分子生物学试题
生化试题最后一道是NFkappaB的蛋白调控方式
1、表观遗传,及调控方式,还有蛋白质通过哪些共价修饰调控其功能?
2、蛋白质与DNA结合的方法和比较,EMSA和DNase1足迹法?
3、密码子改造研究新蛋白药物,原理,关键和方法
4、设计研究未知基因(预测两个跨膜区域)功能的实验方案(不低于4个)
5、质粒改造原则
6、诱导全能干细胞的方法,实验方案等。
(去年的nature上发表的)
分子生物学试题1000
1.证明DNA是遗传物质的两个关键性实验是:
肺炎球菌在老鼠体内的毒性和T2噬菌体感染大肠杆菌。
这两个实验中主要的论点证据是:
()
2.1953年Watson和Crick提出:
(DNA双螺旋结构模型)
3.双链DNA中的碱基对有:
()
4.DNA双螺旋的解链或变性打断了互补碱基间的氢键,并因此改变了它们的光吸收特性。
以下哪些是对DNA的解链温度的正确描述:
()
5.DNA的变性:
()
6.在类似RNA这样的单链核酸所表现出的“二级结构”中,发夹结构的形成:
()---(选择题)
7.DNA分子中的超螺旋:
()---(选择题)
8.DNA在10nm纤丝中压缩多少倍(长度)?
(7)---(选择题)
9.DNA在30nm纤丝中压缩多少倍?
(42)---(选择题)
10.DNA在染色体的常染色质区压缩多少倍?
(8400)---(选择题)
11.DNA在中期染色体中压缩多少倍?
()---(选择题)
12.组蛋白的净电荷是:
()---(选择题)
13.核小体的电性是:
()---(选择题)
14.当新的核小体在体外形成时,会出现以下哪些过程?
()
15.1953年Watson和Crick提出:
()(e)分离到回复突变体证明这一突变并非是一个缺失突变---(选择题)
16.当一个基因具有活性时:
()---(问答题)
17.在高盐和低温条件下由DNA单链杂交形成的双螺旋表现出几乎完全的互补性,这一过程可看作是一个复性(退火)反应.---(判断题)
18.在核酸双螺旋(如DNA)中形成发夹环结构的频率比单链分子低。
发夹结构的产生需要回文序列使双链形成对称的发夹,呈十字结构。
---(判断题)
19.B型双螺旋是DNA的普遍构型,而Z型则被确定为仅存在于某些低等真核细胞中。
---(判断题)
20.病毒的遗传因子可包括1到300个基因。
与生命有机体不同,病毒的遗传因子可能是DNA或RNA(但不可能同时兼有!
)因此DNA不是完全通用的遗传物质。
---(判断题)
21.Cot1/2与基因组大小相关。
---(判断题)
22.Cot1/2与基因组复杂性相关。
---(判断题)
23.非组蛋白染色体蛋白负责3nm纤丝高度有序的压缩。
---(判断题)
24.碱基对间在生化和信息方面有什么区别?
---(简答题)
25.在何种情况下有可能预测某一给定的核苷酸链中“G”的百分含量?
---(简答题)
26.真核基因组的哪些参数影响C0t1/2值?
---(简答题)
27.请问哪些条件可促使DNA复性(退火)?
---(简答题)
28.为什么DNA双螺旋中维持特定的沟很重要?
---(简答题)
29.大肠杆菌染色体的分子量大约是2,5x1000000000Da,核苷酸的平均分子量是330Da。
邻近核苦酸对之间的距离是0.34nm;双螺旋每一转的高度(即螺距)是0.34nm,
(1)该分子有多长
(2)该DNA有多少转?
---(简答题)
30.曾经有一段时间认为,DNA无论来源如何,都是4个核苷酸的规则重复排列(如ATCG.ATCG,ATCG,ATCG…),所以DNA缺乏作为遗传物质的特异性。
第一个推翻该四核苦酸定理的证据是什么?
---(简答题)
31.为什么在DNA中通常只发现A—T和C—G碱基配对?
---(简答题)
32.列出最先证实是DNA(或RNA)而不是蛋白质是遗传物质的一些证据。
---(简答题)
33.为什么只有DNA适合作为遗传物质?
---(简答题)
34.什么是连锁群?
举一个属于连锁基因座的例子。
---(简答题)
35.什么是顺反子?
用“互补”和“等位基因”说明“基因”这个概念。
---(简答题)
36.假定你在25℃条件下用如下浓度的DNaseI:
0,0.1,1.0及10.0mg/ml,对鸡红细胞细胞核的染色质进行酶切20分钟。
将这些样品与分子量标记一起上样于6%变性聚丙烯酰胺凝胶,下图是凝胶电泳的结果。
但由于你混淆了样品,因此弄不清每个泳道对应的样品是什么。
惟一可以确信的是分子量标记上样于左边的泳道,但忘记了各带对应的分子量大小(图1.1)。
(1)请回忆起在各泳道分别使用的是哪一浓度的DNaseI?
(2)请指出分子量标记泳道(用M表示)各带的大约分子量。
(3)描述各泳道所显示的染色质结构特征,证实所记忆的数字是正确的。
---(分析题)
37.假定你从一新发现的病毒中提取了核苷酸,请用最简单的方法确定:
(1)它是DNA还是RNA?
(2)它是单链还是双链?
---(分析题)
38.RNA是由核糖核酸通过()键连接而成的一种()。
几乎所有的RNA都是由()DNA()而来,因此,序列和其中一条链()。
---(填空题)
39.多数类型的RNA是由加工()产生的,真核生物前体tRNA的()包括()的切除和()的拼接。
随着()和()端的序列切除,3’端加上了序列()。
在四膜虫中,前体TRNA的切除和()的拼接是通过()机制进行的。
---(填空题)
40.RnaseP是一种(),含有()作为它的活性部位,这种酶在()序列的()切割()。
---(填空题)
41.C0t1/2实验测定的是()。
---(填空题)
42.假定摆动假说是正确的,那么最少需要()种TRNA来翻译61种氨基酸密码子。
---(填空题)
43.写出两种合成后不被切割或拼接的RNA:
()和()。
---(填空题)
44.原核细胞信使RNA含有几个其功能所必需的特征区段,它们是:
()---(选择题)
45.tRNA参与的反应有:
()---(选择题)
46.氨酰tRNA的作用由()决定.---(选择题)
47.I型内含子能利用多种形式的鸟嘌吟,如:
()---(选择题)
48.I型内含子折叠成的复杂二级结构:
()---(选择题)
49.RNaseP:
()---(选择题)
50.锤头型核酶:
()---(选择题)
51.DNA的复制需要DNA聚合酶和RNA聚合酶。
---(判断题)
52.复制叉上的单链结合蛋白通过覆盖碱基使DNA的两条单链分开,这样就避免了碱基配对。
---(判断题)
53.只要子链和亲本链,其中的一条或两条被甲基化,大肠杆菌中的错配校正系统就可以把它们区别开来,但如果两条链都没有甲基化则不行。
---(判断题)
54.大肠杆菌、酵母和真核生物病毒DNA的新一轮复制是在一个特定的位点起始的,这个位点由几个短的序列构成,可用于结合起始蛋白复合体。
---(判断题)
55.拓扑异构酶I之所以不需要ATP来断裂和重接DNA链,是因为磷酸二酯键的能量被暂时贮存在酶活性位点的磷酸酪氨酸连接处。
---(判断题)
56.酵母中的拓扑异构酶Ⅱ突变体能够进行DNA复制,但是在有丝分裂过程中它们的染色体不能分开。
---(判断题)
57.靠依赖于DNA的DNA聚合酶所进行的DNA复制要求有作为一个引发物的游离3’—0H的存在。
游离的3’—0H可以通过以下三种途径获得:
合成一个RNA引物、DNA我引发的或者一个末端蛋白通过磷酸二酯键共价结合到一个核苷酸。
---(判断题)
58.当DNA两条链的复制同时发生时,它是由一个酶复合物:
DNA聚合酶Ⅲ负责的,真核生物的复制利用3个独立作用的DNA聚合酶,Polδ的一个拷贝(为了起始)和Polδ的两个拷贝(DNA多聚体化,当MFl将RNA引发体移去之后填入).---(判断题)
59.从oriλ开始的噬菌体复制的起始是被两个噬菌体蛋白O和P所控制功,在大肠杆菌E.coli中O和P是DnaA和DnaC蛋白的类似物。
基于这种比较,O蛋白代表一个解旋酶而P蛋白调节解旋酶和引发酶结合。
---(判断题)
60.描述Meselson-Stahl试验,说明这一实验加深我们对遗传理解的重要性。
---(简答题)
61.请列举可以在线性染色体的末端建立线性复制的三种方式。
---(简答题)
62.为什么一些细菌完成分裂的时间比细菌基因组的复制所需的时间要少?
为什么在选择营养条件下,E.coli中可以存在多叉的染色体或多达4个以上的开环染色体拷贝,而正常情况下染色体是单拷贝的?
---(简答题)
63.在DNA聚合酶Ⅲ催化新链合成以前发生了什么反应?
---(简答题)
64.DNA复制起始过程如何受DNA甲基化状态影响?
---(简答题)
65.请指出在oriC或фX型起点起始的DNA复制之间存在的重要差异.---(简答题)
66.大肠杆菌被T2噬菌体感染,当它的DNA复制开始后提取噬菌体的DNA,发现一些RNA与DNA紧紧结合在一起,为什么?
---(简答题)
67.DNA连接酶对于DNA的复制是很重要的,但RNA的合成一般却不需要连接酶。
解释这个现象的原因。
---(简答题)
68.曾经认为DNA的复制是全保留复制,每个双螺旋分子都作为新的子代双螺旋分子的模板。
如果真是这样,在Meselso立和Stahl的实验中他们将得到什么结果?
---(简答题)
69.描述Matthew和Franklin所做的证明DNA半保留复制的实验.---(简答题)
70.解释在DNA复制过程中,后随链是怎样合成的.---(简答题)
71.描述滚环复制过程及其特征.---(简答题)
72.E.coliOH157生长得特别快。
在正常(较差的环境)条件下,这些菌60一70分钟后分裂表明复制和细胞的分裂是连续的过程,一个仅在另一个完成后才起始。
假如有机会生长在一个多汁的暖和的牛肉饼上,加倍的时间接近20分钟,这比复制过程所需的标准时间快l倍。
请解释原因。
详细描述原核生物中DNA的复制过程(如:
结构和功能特征及一系列过程)。
涉及多基因组拷贝的复制却没有发生碰撞,其复制机制如何?
---(分析题)
73.图3.1中的DNA片段两端为双链,中间为单链,上面一条链的极性已标出。
(1)下面一条链中所示的磷酸所连的是片段的5'端还是3'端?
(2)能设想在细胞中这个缺口怎样在DNA修复过程中被修复的?
(3)如果缺口在含有脱氧核苷三磷酸和DNA聚合酶的无细胞系统中被修复,那么底部那条链将包括几个片段?
---(分析题)
74.除了聚合作用外,DNA聚合酶I还具有3’→5’校正核酸外切酶的活性,在把错配碱基从新合成DNA链末端切去的校正过程中发挥作用。
为了鉴定这种活性,你制备了人工合成的po1yA链和po1yT链作为底物,其中po1yT链上含一段磷32标记的dT残基同时其3’端还连了几个3H标记的dC残基,如图3.2所示。
分别统计在没有任何dTTP存在,DNA不可能合成以及有dTTP存在,DNA可以合成的两种情况下,标记dT和dC残基的丢失,结果如图3.3所示。
---(分析题)
75.大肠杆菌的dnaB基因编码一个在复制叉上可将DNA解折叠的解旋酶(DnaB)。
已利用如图3.4所示的人工底物对它的特性进行了研究。
实验方法是在多种条件下培养底物,然后把样品进行琼脂糖凝胶电泳。
如果短单链DNA与长的DNA已退火结合在一起,那么泳动速率就会快些,但如果它已解折叠且已变性,则泳动速率就会慢些。
把短链进行放射性标记就可选择性地跟踪它的迁移,然后用放射自显影检查它的位置。
图3.5所示为几个实验的结果,底物1没有尾巴的杂交体,不被DnaB解折叠(图3.5,第1,第2泳道);但是有尾的底物和DnaB、ATP在37℃下温育同样能释放出大量解折叠的小片段(第6,第10泳道)。
对于底物3,只有3’半片段是解折叠的(第10泳道),所有的解折叠产物都绝对依赖于ATP的水解。
‘加DNA单链结合蛋白(SSB)可在一定程度上加强这种解折叠(比较一下第5泳道第9泳道与第10泳道)。
有趣的是,SSB必须在DnaB加后3分钟加入,否则会抑制解折叠。
(1)为什么解折叠需要ATP水解?
(2)DnaB沿长单链DNA的哪个方向移动?
这个方向和它在先导链还是后随链上的移动方向是否一致?
(3)为什么在加入DnaB前加入SSB会抑制解折叠而在其后加入SSB又会促进解折叠?
---(分析题)
76.一个研究小组正在利用一个环状双链DNA作为一种动物病毒的基因组来研究它的生命周期。
实验的第一步是要确定复制区的位置,同时决定复制是沿起点的单向还是向进行。
为此目的,先分离出复制中的分子,用限制酶在一个位点切割病毒基因组使其成为一个线性分子,然后用电镜来观察所得到的分子。
图3.6是所观察到的一些分子(注意:
电镜下不可能区分DNA分子的两端)。
根据这一结果,如何判断:
(1)复制起点是单个还是多个?
(2)复制是单向还是双向?
---(分析题)
77.在大肠杆菌中发现了()种DNA聚合酶。
DNA修复时需要DNA聚合酶()。
---(填空题)
78.真核生物中有5种DNA聚合酶,它们是:
()()()()()。
---(填空题)
79.在DNA修复过程中,需要第二种酶(),作用是将DNA中相邻的碱基()起来。
()DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性。
有两种外切核酸酶的活性,它们分别从()和()降解DNA。
DNA聚合酶()只有()外切核酸酶活性。
---(填空题)
80.只有真核DNA聚合酶()和()显示()外切核酸酶活性。
---(填空题)
81.DNA大多数自发变化都会通过称之为()的作用很快被校正。
仅在极少情况下,DNA将变化的部分保留下来导致永久的序列变化,称为()。
---(填空题)
82.偶然情况下,在同一基因两个稍微不同拷贝(等位基因)间发生重组的过程中,一个等位基因经过()过程会被另一等位基因代替。
---(填空题)
83.通过()基因重组,游动DNA序列和一些病毒可进入或离开一条目的染色体。
---(填空题)
84.DNA修复包括3个步骤:
()酶对DNA链上不正常碱基的识别与切除,()酶对已切除区域的重新合成,()酶对剩下切口的修补。
---(填空题)
85.一种主要的D以修复途径称(),包括一系列酶,它们都能识别并切去DNA上不正常碱基。
---(填空题)
86.()途径可以切去任何造成DNA双螺旋大片段改变的DNA损伤。
---(填空题)
87.大肠杆菌中,任何由于DNA损伤造成的DNA复制障碍都会诱导()的信号,即允许跨过障碍进行复制,给细胞一个生存的机会。
---(填空题)
88.在()中,基因交换发生在同源DNA序列间,最常见是发生在司一染色体的两个拷贝间。
---(填空题)
89.在交换区域,一个DNA分子的一条链与另一个DNA分子的一条链相互配对,在两个双螺旋间形成一个()。
---(填空题)
90.通过(),两个单链的互补DNA分子一起形成一个完全双链螺旋,人们认为这个反应从一个慢的()步骤开始。
---(填空题)
91.大肠杆菌的染色体配对需要();它与单链DNA结合并使同源双链DNA与之配对。
---(填空题)
92.一般性重组的主要中间体是(),也用它的发现者名字命名为()。
---(填空题)
93.关于DNA的修复,下列描述中,哪些是不正确的?
()---(选择题)
1.DNA最普遍的修饰是甲基化,在原核生物中这种修饰的作用有:
()---(选择题)
2.单个碱基改变是DNA损伤的一种形式,它们:
()---(选择题)
3.错配修复是基于对复制期间产生的错配的识别。
下列叙述正确的是:
()---(选择题)
4.非均等交换:
()---(选择题)
5.许多细菌在它们的基因组中几乎平均分配重组敏感热点,这些热点在大肠杆菌E.coli中称为chi,它们是:
()---(选择题)
6.拓扑异构酶I和Ⅱ可以使DNA产生正向超螺旋。
---(判断题)
7.拓扑异构酶I解旋需要ATP酶。
---(判断题)
8.RNA聚合酶I合成DNA复制的RNA引物。
---(判断题)
9.线粒体DNA的复制需要使用DNA引物。
---(判断题)
10.入噬菌体整合到大肠杆菌基因组上是由一个位点专一的拓扑异构酶(k整合酶)催化的,它可以识别在两条染色体上短的特异DNA序列。
---(判断题)
11.在真核生物染色体DNA复制期间,会形成链状DNA。
---(选择题)
12.所有已知的基因转变都需要一定量的DNA合成。
---(判断题)
13.根据不同物种同一蛋白质中氨基酸的不同来估计突变率往往较实际的突变率低,因为一些突变体由于危及蛋白质功能,在选择压力下从种群中消失。
---(判断题)
14.因为组蛋白H4在所有物种中都是一样的,可以预期该蛋白基因。
在不同物种中也是一样的。
---(判断题)
15.DNA修复机制有很多种,但所有这些机制都依赖于二倍体染色体上两套遗传信息的存在。
---(判断题)
16.自发的脱嘌呤作用和由尿嘧啶DNA糖基化酶切去一个已脱碱基的胞嘧啶都会产生可被无嘌呤嘧啶内切核酸酶作为底物识别的同样的中间产物。
---(判断题)
17.DNA修复的第一步是由专用于修复过程的酶催化的,下面的步骤由DNA代谢过程中的常用酶催化。
---(判断题)
18.大肠杆菌中SOS反应的最主要作用是通过在原始DNA损伤区附近导人补偿突变来提高细胞存活率。
---(判断题)
19.DNA中四个常用碱基自发脱氨基的产物,都能被识别出来。
---(判断题)
20.在细菌细胞中,短片段修复是由损伤诱导的。
相反,长片段修复是组成型的,且往往涉及长约1500一9000bp损伤DNA片段的替换。
---(判断题)
21.真核生物中DNA的修复没有原核生物重要,这是因为体细胞的二倍体特征。
---(判断题)
22.一般性重组需要交换的双方都有一长段同源DNA序列,而位点专一重组仅需要短而专一的核苷酸序列,某些情况下,只需要交换双方中的一方具有该序列即可。
---(判断题)
23.一般性重组包括DNA片段的物理交换,该过程涉及DNA骨架上磷酸二酯键的断裂,和重新形成。
---(判断题)
24.RecA蛋白同时具有位点专一的单链切割的活性和将单链从双螺旋DNA分子上脱离的解旋酶的功能,但需要依赖于ATP活性。
---(判断题)
25.大肠杆菌的单链结合蛋白通过与糖—磷酸骨架结合并使碱基暴露,从而解开单链上的短发夹结构。
---(判断题)
26.RecA蛋白同时与单链、双链DNA结合,因此它能催化它们之间的联会。
---(判断题)
27.交叉链互换包括交叉链和未交叉链,至少其中一条链的磷酸骨架断裂才可能使这个过程逆转。
---(判断题)
28.基因转变是真菌类偶然改变性别的方式;正常情况下,一次接合产生等量的雄性与雌性孢子,但偶然也会出现1:
3或3:
1的比例。
---(判断题)
29.假如发生了碱基对的错配会产生什么表型,它们怎样被修复?
---(简答题)
30.为什么DNA的甲基化状态可以为复制的调节和DNA的修复所利用?
---(简答题)
31.错配修复的方向可以怎样被调节(突变型到野生型或野生型到突变型)?
---(简答题)
32.RecA蛋白是怎样调节SOS反应的?
---(简答题)
33.以图4,1A为例,画出图4.1B所示分子同源区域交叉重组的产物,图中用一条单线表示DNA双螺旋,同源重组的靶位点用箭头标出。
---(简答题)
34.图4.2所示为两条同源的亲代双螺旋和两套可能的重组产物。
请画图表示两亲代双螺旋间可以产生指定重组产物的Holliday连接,在每条链的左端标明Holliday连接的3'或5'端,这样亲代和重组双螺旋间的关系就比较清楚。
请指明为了产生每套重组产物哪些链应被切去。
最后,画出经过一轮DNA复制后的重组产物。
---(简答题)
35.为什么基因内互补只发生在:
(1)某一基因座的等位基因间;
(2)这些基因座的特殊等位基因对间?
---(简答题)
36.实验结果表明所研究细菌的一个操纵子具有三个相似拷贝,它编码一个关键酶的亚基。
由于没有检测到第三个碱基简并性(摇摆性)现象,由此说明接近的相同性(99%)是由于DNA修饰作用的结果。
请问这涉及哪些可能的机理?
---(分析题)
37.根据对细菌限制和修复系统的知识,设计一个简单的实验来检测你收集的菌株是否有原噬菌体的存在。
---(分析题)
38.大肠杆菌中的几个基因包括uvrA、uvrB、uvrC和recA都与紫外线损伤的修复有关,含有一个有缺陷的上述基因的大肠杆菌细胞系比起野生型细胞对紫外光的射线更敏感,就如图4.3A所示的uvr4与recA突变株。
单个不向基因的突变可以成对联合起来形成所有可能的双突变体。
比起单突变体,双突变体的敏感性变化很大。
相对uvr单突变体,两个uvr突变形成的双突变体对紫外光的敏感性并无多大增加,但recA缺陷和任一种uvr突变体形成的双突变体却使一个细胞株对紫外光极度敏感,如图4.3B所示的uvrArecA双突变体放大图。
(1)为什么一个recA突变和一个uvr突变的结合会产生一个对紫外光极其敏感的细菌菌株,而不同uvr基因突变的结合却和单个突变没有差别?
(2)根据泊松分布,当一个细菌种群平均受到一个致命“轰击”,37%(e-1)的个体将存活下来,因为它们实际上并没有受到轰击。
对于uvrArecA双突变体,0.04J/m2的剂量使37%的个体存活(如图4.3B)。
计算对uvrArecA双突变体细胞株来说,多少嘧啶二聚体会组成致死轰击,假设大肠杆菌的基因组有4×106个碱基对,包括50%的GC,而且把DNA暴露在400J/m2的紫外线下,会使1%的嘧啶对(TT、TC、CT和CC)变成嘧啶二聚体。
---(分析题)
39.除了uvrABC内切核酸酶修复、重组修复和SOS修复,细菌还具备一种对嘧啶二聚体更有效的修复系统。
这个现象是在一个关于紫外线对细菌影响的调查中为了确定一个失控的数量而发现的。
发现过程可以假设为:
你与你的同事正试图利用紫外线作为诱变剂来分离大肠杆菌中的突变体,为得到足够的突变子,你觉得有必要使用对细菌杀伤率为99,99%的辐射剂量。
比起你的同事你已经获得了更可靠的结果,而他要用10倍至100倍的辐射剂量才能获得同样的杀伤率。
因为你常在晚上他离开后才做实验,所以他有点怀疑你结果的可靠性,他坚持你早上来做一个平行实验。
当你们都得到同一结论时你们两人都感到惊奇,你有些懊恼,因为结果更接近你同事的结论;当你在晚上重复平行实验时,你的同事对结果感到很惊奇,结果正如你以前所描述的一样。
你发现在下午要取得同样的杀伤率需要用比早上更高的辐射剂量,晴天比阴天需要的剂量高,你的实验室朝西,是什么因素影响着你的实验?
---(分析题)
噬菌体T4编码一个对重组和DNA复制很重要的单链DNA结合蛋白(SSB蛋白)含有编码SSB蛋白温度敏