4.脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色的物质,而其他氨基酸与茚三酮反应产生蓝紫色的物质。
5.有三种氨基酸因含有共轭双键而有280nm处的紫外吸收,这三种氨基酸按吸收能力强弱依次为色氨酸(Trp)>酪氨酸(Tyr)>苯丙氨酸(Phe)。
6.10个以内的氨基酸残基所组成的肽称为寡肽。
7.1953年维格诺尔德(D.Vingneaud)第一次用化学法合成了具有生物活性的肽—催产素,因而获得诺贝尔奖。
8.我国于1965年由上海生物化学研究所上海有机化学研究所、和北京大学等单位在世界上首次合成了具有生物活性的蛋白质—牛胰岛素。
10.胰蛋白酶能水解赖氨酸(Lys)和精氨酸(Arg)的氨基酸的羧基所形成的肽键。
11.胰凝乳蛋白酶能水解色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)和苯丙氨酸(Phe)的氨基酸的羧基侧所形成的肽键。
12.溴化氰能水解甲硫氨酸(Met)羧基侧所形成的肽键。
13.拆开蛋白质分子中二硫键的常用的方法有一种还原法,其常用的试剂是β-巯基乙醇。
14.蛋白质之所以出现各种无穷的构象主要是因为Cα-C键和Cα-N键能有不同程度的转动。
15.Pauling等人提出的蛋白质α螺旋模型,每圈螺旋包含3.6
氨基酸残基,高度为0.54nm。
每个氨基酸残基上升0.15nm。
16.一般来说,球状蛋白质的疏水性氨基酸侧链位于分子内部,亲水性氨基酸侧链位于分子表面。
17.维持蛋白质一级结构的化学建是肽键和二硫键。
18.维持蛋白质二级结构的化学建是氢键。
19.维持蛋白质三、四级结构的化学建是疏水作用、离子键(盐键)、氢键
和范德华力。
20.最早提出蛋白质变性理论的是我国生物化学家吴宪。
21.血红蛋白(Hb)与氧气结合的过程呈现协同效应,是通过Hb的
别构(变构)现象实现的。
22.当溶液中盐离子强度低时,增加盐浓度可导致蛋白质溶解,这种现象称为盐溶。
当盐浓度继续增加时,可使蛋白质沉淀,这种现象称盐析。
23.各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%,这是凯氏定氮法的基础。
24.利用蛋白质不能通过半透膜的特性,使它和其他小分子物质分开的方法有透析和超滤法。
25.蛋白质的超二级结构是指蛋白质二级结构的基本单位相互聚集,形成有规律的二级结构的聚集体,其基本组合形式常见的有3种,一是αα,如结合钙离子的模体;二是βαβ,如锌指结构;三是βββ。
26.蛋白质的二级结构有α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲四种稳定构象异构体。
27.蛋白质溶液的稳定性的因素是分子外面有水化膜和带有电荷
28.蛋白质进入层析柱后,小分子流出的时间较长,大分子流出的时间较短,因此先流出的蛋白质分子是大
29.沉降系数(S)主要与蛋白质的密度和形状有关。
31.X射线衍射法和磁共振技术是目前研究蛋白质三维空间结构较为准确的方法。
32.根据蛋白质的组成成分可分为单纯蛋白质和结合蛋白质
33.根据蛋白质的形状可分为球状蛋白质和纤维状蛋白质
四.判断题
1.天然氨基酸都具有一个手性α-碳原子。
F
2.鸟氨酸与瓜氨酸有时也可能是蛋白质的组成成分。
F
3.自然界的蛋白质和多肽均有L-型氨基酸组成。
F
4.His和Arg是人体内的半必需氨基酸。
T
5.CNBr能裂解Arg-Gly-Met-Cys-Met-Asn-Lys成三个肽。
T
6.热力学上最稳定的蛋白质构象自由能最低。
T
7.可用8mol/L尿素拆开次级键和二硫键。
F
8.脯氨酸能参与α-螺旋,有时在螺旋末端出现,但决不在螺旋内部出现。
T
9.维持蛋白质三级结构最重要的作用力是氢键。
F
10.在具有四级结构的蛋白质中,每个亚基都有三级结构。
T
11.在水溶液中,蛋白质溶解度最小时的pH值通常就是它的等电点。
T
12.血红蛋白与肌红蛋白均为氧载体,前者是一个典型的变构(别构)蛋白,因而氧合过程中呈现协同效应,而后者却不是。
T
13.在多肽链分子中只有一种共价键即肽键。
F
14.等电点不是蛋白质的特征常数。
T
15.血红蛋白与肌红蛋白的功能都是运输氧气。
F
16.溶液的pH值可以影响氨基酸的等电点。
F
17.血红蛋白与肌红蛋白未与氧气结合时其内的铁是Fe2+,但与氧气结合后铁变成Fe3+。
F
18.到目前为止,自然界发现的氨基酸为20种左右。
F
19.蛋白质分子的亚基与结构域是同义词。
F
20.某蛋白质在pH5.8时向阳极移动,则其等电点小于5.8。
T
21.变性的蛋白质不一定沉淀,沉淀的蛋白质也不一定变性。
T
22.SDS电泳、凝胶过滤和超速离心都可以测定蛋白质的分子量。
T
23.通常采用的X射线衍射法,首先将蛋白质制成晶体,但个别例外,如糖蛋白等。
F
24.蛋白质和核酸中都含有较丰富的氮元素,但蛋白质根本不含有P,而核酸则含有大量的P。
F
五.名词解释
1.氨基酸的等电点(pI)在某一特定PH值溶液时,氨基酸主要以两性离子形式存在,静电荷为0,既不向正极也不向负极移动,这时的溶液PH称为该氨基酸的等电点2.蛋白质的一级结构即共价结构,指多肽链的氨基酸序列
3.蛋白质的二级结构指多肽链借助氢键形成α螺旋和β折叠片
5.蛋白质的三级结构指多肽链借助各种非共价键弯曲、折叠成具有特定走向的紧密球状结构6.结构域多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实体
7.蛋白质的四级结构指多聚蛋白质的各亚基之间在空间上的相互缔合关系8.蛋白质的等电点对某一种蛋白质来说,在某一PH,它所带的正电荷与负电荷恰好相等,也即静电荷为零,这一PH称为蛋白质的等电点
9.蛋白质的变性天然蛋白质分子受到某些物理因素如热、紫外线照射、高压和表面张力等或化学因素如有机溶剂、脲、胍、酸、碱等的影响时,生物活性丧失,溶解度降低,不对称性增高以及其他的物理化学常数发生改变的过程10.盐溶低浓度时,中性盐可以增加蛋白质的溶解度
11.盐析当离子强度增加到足够高时,例如饱和或半饱和的程度,很多蛋白质可以从水溶液中沉淀出来12.透析利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质,使蛋白质和其他小分子物质如无机盐、单糖等分开
13.超滤法利用压力或离心力,强行使水和其他小分子溶质通过半透膜,而蛋白质被截留在膜上,以达到浓缩和脱盐的目的14.电泳在外电场的作用下,带电颗粒,例如不处于等电状态的蛋白质分子,将向着与其电性相反的电极移动的鲜血
15.等电聚焦电泳是一种分辨率极高的蛋白质分离技术,在外电场作用下各种蛋白质将移向并聚焦(停留)在等于其等电点的PH梯度处,并形成一个很窄的区带
六.简答题
1.用下列哪种试剂最适合完成以下工作:
溴化氰、尿素、β-巯基乙醇、胰蛋白酶、过甲酸、丹磺酰氯(DNS-Cl)、6mol/L盐酸、茚三酮、苯异硫氰酸、胰凝乳蛋白酶。
(1)测定一段小肽的氨基酸序列。
苯异硫氰酸
(2)鉴定小于10-7g肽的N端氨基酸丹磺酰氯(DNS-Cl)
(3)使没有二硫键的蛋白质可逆变性尿素。
如有二硫键,应加何种试剂?
β-巯基乙醇使二硫键还原
(4)水解由芳香族氨基酸羧基所形成的肽键。
胰凝乳蛋白酶
(5)水解由Met羧基所形成的肽键溴化氰
(6)水解由碱性氨基酸羧基所形成的肽键。
胰蛋白酶
2.有一球状蛋白质,在pH7的水溶液中能折叠成一定的空间结构。
通常非极性氨基酸侧链位于分子内部形成疏水核,极性氨基酸侧链位于分子外部形成亲水面。
问:
(1)Val、Pro、Phe、Asp、Lys、Ile和His中哪些氨基酸侧链位于内部,哪些氨基酸侧链位于分子外部。
因为Val、Pro、Phe和Ile是极性氨基酸,所以它们的侧链位于分子内部。
因为Asp、Lys和His是极性氨基酸,所以它们的侧链位于分子外部。
(2)为什么球状蛋白质分子内部和外部都可发现Gly和Ala。
因为Gly的侧链是-H,Ala的侧链是-CH3,它们的侧链都比较小,疏水性不强,所以它们既能在球状蛋白质的分子内部,也能在外部。
(3)虽然Ser、Thr、Asn和Gln是极性的,为什么它们位于球状蛋白质的分子内部。
因为Ser、Thr、Asn和Gln在pH7时有不带电荷的极性侧链,它们能参与内部氢键的形成,氢键中和了它们的极性,所以它们位于球状蛋白质分子内部。
(4)在球状蛋白质分子的内部还是外部能找到Cys,为什么。
在球状蛋白质的内部找到Cys,因为两个Cys时常形成二硫键,这样就中和了Cys的极性。
3.一系列球状的单体蛋白质,相对分子质量从10000到,随着相对分子质量的增加,亲水残基与疏水残基的比率将会发生怎样的变化。
随着蛋白质相对分子质量(Mr)的增加,表面积与体积的比率也就是亲水残基与疏水残基的比率必定减少。
为解释这一点,假设这些蛋白质是是半径为r的球状蛋白质,由于蛋白质Mr的增加,表面积随r2的增加而增加,体积r3随的增加而增加,体积的增加比表面积的增加更快,所以表面积与体积的比率减少,因此亲水残基与疏水残基的比率也就减少。
4.一些异常血红蛋白(HbD、HbJ、HbN、HbC)和正常血红蛋白(HbA)仅仅是一个氨基酸的差异。
HbD(α68)Asn变成Lys
HbJ(β69)Gly变成Asp
HbN(β95)Lys变成Glu
HbC(β6)Glu变成Lys
将上述四种异常血红蛋白与正常血红蛋白在pH8.6条件下进行电泳,电泳迁移率如下:
阴极(–)(+)阳极
abHbAcd
问:
a带、b带、c带和d带分别代表哪种异常血红蛋白?
(1)HbD是由一个碱性氨基酸(Lys)取代了中性氨基酸。
在pH8.6时,Lys的ε-氨基呈-NH3+状态,所以HbD比HbA带较多的正电荷,向阴极移动。
(2)HbJ是由一个酸性氨基酸(Asp)取代了中性氨基酸。
在pH8.6时,Asp的β-羧基呈-COO–状态,所以HbJ比HbA带较多的负电荷,向阳极移动。
(3)HbN是由一个酸性氨基酸(Glu)取代了碱性氨基酸(Lys)。
在pH8.6时,Glu的γ-羧基呈-COO–状态,所以HbN比HbA带较多的负电荷,向阳极移动。
若将HbN和HbJ比较,因为HbN是由一个酸性氨基酸(Glu)取代了碱性氨基酸(Lys),而HbJ是由一个酸性氨基酸(Asp)取代了中性氨基酸。
所以HbN比HbJ带更多的负电荷,HbN向阳极移动的速度比HbJ快。
(4)HbC是由一个碱性氨基酸(Lys)取代了酸性氨基酸(Glu)。
在pH8.6时,Lys的ε-氨基呈-NH3+状态,所以HbC比HbA带较多的正电荷,向阴极移动。
若将HbC和HbD比较,因为HbC是由一个碱性性氨基酸取代了酸性氨基酸,而HbD是由一个碱性氨基酸取代了中性氨基酸。
所以HbC比HbD带更多的正电荷,HbC向阴极移动的速度比HbD快。
综上所述可知:
a带代表HbC,b带代表HbD,c带代表HbJ,d带代表HbN。
5.扼要解释为什么大多数球状蛋白质在溶液中具有下列性质。
(1)在低pH时沉淀。
在低pH时,羧基质子化,这样蛋白质分子带有大量的净电荷,分子内正电荷相斥使许多蛋白质变性,并随着蛋白质分子内部疏水基团向外暴露使蛋白质溶解度下降,因而产生沉淀。
(2)当离子强度从零逐渐增加时,其溶解度开始增加,然后下降,最后出现沉淀。
加入少量盐时,对稳定带电基团有利,增加了蛋白质的溶解度。
但是随着盐离子浓度的增加,盐离子夺取了与蛋白质结合的水分子,降低了蛋白质的水合程度,破坏了电荷和水化膜,使蛋白质沉淀(3)在一定的离子强度下,达到等电点pH值时,表现出最小的溶解度。
在等电点时,蛋白质分子之间的静电斥力最小,所以溶解度最小(4)加热时沉淀。
加热时使蛋白质变性,蛋白质内部的疏水性基团被暴露,溶解度降低,从而引起蛋白质沉淀(5)加入一种可和水混溶的非极性溶剂减小其介质的介电常数,从而导致溶解度的减少。
非极性溶剂减小了表面极性基团的溶剂化作用,促使蛋白质分子之间形成氢键,从而取代了蛋白质分子与水之间的氢键(6)如果加入一种非极性强的溶剂,使介电常数大大地下降会导致变性。
介电常数的下降对暴露在溶剂中的非极性基团有稳定作用,结果促使蛋白质肽链的展开而导致变性
7.某一蛋白质的多肽链在一些区段为α-螺旋构象;在另一些区段为β-构象。
该蛋白质的相对分子量为,多肽链外形的长度为5.06×10–5cm。
(在β-折叠中,每个氨基酸残基上升的距离本书按0.35nm,有的书上按0.36nm)试计算α-螺旋体所占分子的百分含量?
Ala的pI=(pK1+pK2)/2=(2.34+9.69)/2=6.02
Glu的pI=(pK1+pK2)/2=(2.19+4.25)/2=3.22
Lys的pI=(pK2+pK3)/2=(8.95+10.53)/2=9.74
20种氨基酸的平均分子量约为138,在蛋白质分子中以小分子量的氨基酸较多,平均分子量大约为128,又由于氨基酸在缩合时失去一分子水,因此氨基酸残基的最终平均分子量大约为110。
所以氨基酸残基数为:
/110=2000,已知α-螺旋构象中,每个氨基酸残基上升的距离为0.15nm,β-折叠中上升0.35nm。
设此多肽链中α-螺旋的氨基酸残基数为X,则β-折叠的氨基酸残基数为2000-X。
0.15X+0.35(2000-X)=5.06×10-5×107
0.15X+7000-0.35X=560
X=970
所以α-螺旋占的百分数为970/2000×100%=48.5%
七.论述题
1.请你从蛋白质的一级结构与高级结构来阐述其含义、特点与化学键
(1)一级结构:
概念:
在蛋白质分子中,从N-端至C-端的氨基酸残基的排列顺序称为蛋白质的一级结构。
特点:
①蛋白质种类及其繁多,其一级结构也各不相同;②一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础;③一级结构并不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。
化学建:
①肽键②二硫键。
(2)蛋白质的二级结构:
概念:
是指蛋白质分子中,某一段肽链的局部空间结构,也就是该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。
特点:
①是一种局部的结构;②仅仅是肽单元之间相互作用所形成的空间结构,而不包含氨基酸侧链及其α-H原子所形成的构象,但氨基酸残基的侧链对二级结构的形成有影响;③二级结构有较多的类型,有α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲,其中α-螺旋和β-折叠是二级结构的主要形式,β-转角通常有四个氨基酸残基组成,而无规卷曲则是指没有确定规律的或根本就没有规律的一些二级结构;④二级结构还可成为超二级结构,如αα形式、βαβ形式和βββ形式等结构。
化学建:
氢键
(3)蛋白质的三级结构:
概念:
是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。
特点:
一条多肽链的三维空间结构。
化学建:
①疏水键②盐键③氢键④范德华力。
(4)蛋白质的四级结构:
概念:
蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。
特点:
两条或两条以上多肽链所形成的三维空间构象。
化学建:
①疏水键②盐键③氢键④范德华力。
2.试论述蛋白质的分子结构与功能的关系1)一级结构与功能的关系
①一级结构不同,生物学功能一般不同
不同蛋白质和多肽具有不同的功能,根本原因是它们的一级结构各异,有时仅微小的差异就表现出不同的生物学功能。
如催产素与加压素(缩宫素)都是由垂体后叶分泌的九肽激素,它们分子中仅两个氨基酸差异,但两者的生理功能却有根本区别。
②一级结构中“关键”部分相同,其功能也相同
如促肾上腺皮质激素其1~24肽段是活性所必需的关键部分。
③一级结构“关键”部分的变化,其生物活性也改变
多肽的结构与功能的研究表明,改变多肽中某些重要的氨基酸,常可改变其活性。